Resistance of Streptococcus pneumoniae Strains Isolated from Clinical Samples to Various Antibiotics

Objective: It was aimed to determine the antibiotics resistance rates of Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) strains which are important causes of mortality and morbidity with increasing resistance rates.Methods: Antibiotic susceptibilities of 80 S. pneumoniae specimens identified from samples sent from various clinics in our hospital were analyzed retrospectively. Isolated strains were identified by classical methods and BD Phoenix 100 system (Becton Dickinson Diagnostic, USA) and their antimicrobial susceptibility was evaluated by Kirby-Bauer disc diffusion method according to European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) document. Penicillin, cefotaxime and meropenem susceptibilities were examined by gradient test; while erythromycin, clindamycin, trimethoprim-sulfamethoxazole, levofloxacin, tetracycline, vancomycin and linezolid resistances were analyzed by disc diffusion method.Results: A total of 80 isolates including 32 blood samples, 29 respiratory samples, 10 cerebrospinal fluid (CSF), 5 vitreous, 3 pleural fluid and 1 abscess aspiration were included in the study. Penicillin resistance in CSF isolates was 70% and there was no resistance to cefotaxime and meropenem. Of 70 non-CSF isolates, 15 (21.4%) were moderately resistant, 14 (20%) were highly resistant and 41 (58.6%) were susceptible to penicillin. Cefotaxime resistance was detected in 2 (2.9%) of these isolates. Intermediate values were found in 2 (2.9%) isolates and remaining 66 (94.2%) isolates were susceptible to cefotaxime. There was no meropenem resistance in non-CSF isolates. Resistance rates of erythromycin, clindamycin, trimethoprim-sulfamethoxazole, levofloxacin and tetracycline in all isolates were 32.5%, 27.5%, 42.5%, 3.7% ve 30% respectively. There was no resistance to vancomycin and linezolid.Conclusion: Penicillin resistance is high in S. pneumoniae strains and penicillin has no place in empirical treatment of pneumococcal meningitis. Periodic monitoring of infectious agents and antibiotic susceptibilities in certain regions may guide clinicians to initiate empirical treatment.

Klinik Örneklerden İzole Edilen Streptococcus pneumoniae Suşlarının Farklı Antibiyotiklere Direnç Profilleri

Amaç: Artan direnç oranların edeni ile önemli oranlarda mortalite ve morbiditeye neden olan Streptococcus pneumonia (S. pneumoniae) suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç oranlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Hastanemizdeki çeşitli kliniklerden gönderilen örneklerden tespit edilen 80 adet S. pneumoniae örneğinin antibiyotik duyarlılıkları retrospektif olarak incelendi. İzole edilen suşlar klasik yöntemler ve Phoenix 100 sistemi (Becton Dickinson Diagnostic, ABD) ile tanımlandı ve antimikrobiyal duyarlılıkları, Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi (EUCAST) dokümanına göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile değerlendirildi. Penisilin, sefotaksim ve meropenem duyarlılıkları gradyan testi ile incelendi; eritromisin, klindamisin, trimetoprim-sülfametoksazol, levofloksasin, tetrasiklin, vankomisinve linezolid dirençleri disk difüzyon yöntemiyle analiz edildi. Bulgular: Çalışmaya 32 kan örneği, 29 solunum örneği, 10 beyin omurilik sıvısı (BOS), 5 vitrözsıvı, 3 plevral sıvı ve 1 apse aspirasyonu dahil toplam 80 izolat dahil edildi. BOS izolatların dapenisilin direnci %70 idi ve sefotaksim ve meropenem için direnç yoktu. BOS dışı 70 izolattan 15'i (%21,4) orta derecede dirençli, 14'i (%20) yüksek dirençli ve 41'i (%58,6) penisiline duyarlı idi. Bu izolatların 2'sinde (%2,9) sefotaksim direnci tespit edildi. Ara değer2 (%2,9) izolatta bulundu ve gerikalan 66 (%94,2) izolat sefotaksime duyarlıydı. BOS dışı izolatlarda meropenem direnci yoktu. Tüm izolatlarda eritromisin, klindamisin, trimetoprim-sulfametoksazol, levofloksasin ve tetrasiklin direnç oranları sırasıyla %32,5, %27,5, %42,5, %3,7 ve %30 idi. Vankomisin velinezolide direnç yoktu. Sonuç: S. pneumoniae suşlarında penisilin direnci yüksektir ve penisilinin pnömokokal menenjitin ampirik tedavisinde yeri yoktur. Belirli bölgelerdeki enfeksiyöz ajanların ve antibiyotik duyarlılıklarının periyodik olarak izlenmesi, klinisyene ampirik tedaviyi başlatmada rehberlik edebilir.

___

1.Henriques-Normark B, Tuomanen EI. Thepneumococcus: epidemiology, microbiology, andpathogenesis. Cold Spring HarbPerspect Med.2013;3: a010215.

2.O'Brien KL, Wolfson LJ, WattJ P, et al. Burden ofdisease caused by Streptococcus pneumoniae inchildren younger than 5 years: global estimates.Lancet.2009; 374: 893–902.

3. Obaro S, Adegbola R. The pneumococcus: carriage,disease and conjugate vaccines. J Med Microbiol.2002; 51: 98–104.

4.MahonCR, LehmanDC, ManuselisG. Textbook ofdiagnostic microbiology, 4th edn. Saunders, 2010. 5.DonkorES. Understanding the pneumococcus:transmission and evolution. Front Cell InfectMicrobiol. 2013; 3: 7.

6.BogaertD, de GrootR, Hermans PW. Streptococcuspneumoniaecolonisation: the key to pneumococcaldisease. Lancet Infect Dis.2004; 4: 144–54.

7.Torres A, Blasi F, Dartois N, Akova M. Whichindividuals are at increased risk of pneumococcaldisease and why? Impact of COPD, asthma, smoking,diabetes, and/or chronic heart disease oncommunity-acquired pneumonia and invasivepneumococcal disease. Thorax.2015; 70: 984–9.

8.Hansman D, Bullen MM. A resistant pneumococcus. The Lancet.1967; 290: 264–5.

9.Aslan G, Emekdaş G, Delialioğlu N, Bayer M.Kreşçocukları ve huzurevinde kalan yaşlılardaorofaringeal Streptococcus pneumoniae taşıyıcılığıve izole edilen suşlarda penisiline direnç. TürkMikrobiyol Cem Derg.2005; 35: 85-90.

10.Bayram A, Koçoğlu ME, Ekşi F, Balcı İ.Pnömokoklarda makrolidveflorokin olonlara direnç.Türk Mikrobiyol Cem Derg.2005; 35: 284-90.

11.EUCASTClinical Breakpoint Table Version 6.0.ValidFrom2016-01-01. Basel: EUCAST, 2016.http://www.eucast.org/clinical_breakpoints/.

12.Kim L, McGee L, Tomczyk S, Beall B.Biologicaland epidemiological features of antibiotic resistantStreptococcus pneumoniae in pre-and post-conjugate vaccine eras: a United States perspective.Clin Microbiol Rev. 2016; 29: 525-52.

13.Antimicrobial resistance surveillance in EuropeAnnual Report of the European AntimicrobialResistance Surveillance Network (EARS-Net), 2014.http:/www.ecdc.europa.eu

14.Centers for Disease Control and Prevention.2017. Active bacterial core surveillance report,emerging infections program network, Streptococcus pneumoniaehttp://www.cdc.gov/abcs/reportsfindings/survreports/spneu17.pdf

15.El Moujaber G, OsmanM, Rafei R, DabboussiF,Hamze M. Molecular mechanisms andepidemiology of resistance in Streptococcuspneumoniae in the Middle East regionJ MedMicrobiol. 2017; 66: 847–58.

16.İlki A, Sağıroğlu P, Elgörmüş N, Söyletir G. Trendsin antibiotic susceptibility patterns of Streptococcuspneumoniae and Haemophilus influenzae isolates:four years follow up. Mikrobiyol Bul. 2010; 44: 169-75.

17.Hasçelik G, Gürler N, Ceyhan M. Serotypedistribution and antibiotic resistance among isolatesof Streptococcus pneumoniae causing invasivepneumococcal disease in adults in Turkey: 2005-2015. Int J Infect Dis. 2016; 45: 91.

18. Öksüz L, Gürler N. BirÜniversitehastanesindeyetişkinhastalardanizoleedilenStreptococcus pneumoniaesuşlarınınserotipdağılımıveantibiyotikdirenci. Mikrobiyol Bul. 2017; 51: 195-208. 19. Akgün Karapınar DB. Determination of serotypesand antibiotic resistance in Streptococcuspneumoniae. J Clin Anal Med. 2015; 6: 443-7.

20.Soyletir G, Altinkanat G, Gur D,et al. Results fromthe survey of antibiotic resistance (SOAR) 2011-13in Turkey. J Antimicrob Chemother. 2016; 71: 71-83.

21.Hosseini SM, Poorolajal J, Karami M, Ameri P.Prevalence of nasopharyngeal carriageofStreptococcus pneumonia in Iran: A Meta-Analysis. J Res Health Sci. 2015; 15: 141-6.

22.Cherazard R, Epstein M, Doan TL, Salim T, BhartiS, Smith MA. Antimicrobial resistant Streptococcuspneumoniae: prevalence, mechanisms, and clinicalimplications. Am J Ther. 2017; 24: e361-9.
Dicle Tıp Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-2945
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1963
  • Yayıncı: Cahfer GÜLOĞLU
Sayıdaki Diğer Makaleler

The relationship between microvascular angina and De Ritis ratio in normal coronary artery patients with recurrent chest pain / De Ritis ratio and microvascular angina

Arafat YILDIRIM, Özge ÖZCAN ABACIOĞLU, Nermin YILDIZ KOYUNSEVER

Turner Sendromlu Olguların Değerlendirilmesi

Edip ÜNAL, Yusuf Kenan HASPOLAT

The Spectrum of β-Thalassemia Mutations in Batman, South-Eastern Turkey

Sedat YILMAZ, Murat ÇAĞLAYAN

Association of Fragmented QRS Morphology With Risk of Atrial Fibrillation in Hemodialysis Patients

Ekrem AKSU, Abdullah SÖKMEN, Gülizar SÖKMEN, Fatma Betül GÜZEL, ADEM DOĞANER, Özkan GÜNGÖR

Akciğer Malignitelerinde Bronş Lavajı Sitolojisinin Tanısal Duyarlılığı

Elif DURSUN, Süreyya YILMAZ, Ayşe Nur KELEŞ

Prostat Kanserli Hastalarda Sağkalım Analizi ve Prognostik Faktörler: Doğu Anadolu Tek Merkez Deneyimi

Ali YILMAZ, Mehmet BİLİCİ, Salim Başol TEKİN

The Role Of Breast-Conserving Surgery In The Treatment Of Early-Stage Breast Cancer

Fatih ÇİFTCİ, Mehmet Tolga KAFADAR

The Monocyte To High-Density Lipoprotein Cholesterol Ratio Predicts The Mortality in Patients With Reduced Ejection Fraction Heart Failure

Seçkin DERELİ, Nurtaç ÖZER, Yasemin KAYA, Ahmet KAYA, OSMAN BEKTAŞ, Mustafa YENERÇAĞ, Mehmet FİLİZ, Fatih AKKAYA

Opere Pankreas Adenokanserli Hastalarda Kemoterapiye Kemoradyoterapi Eklemenin Katkısı

Gökhan UÇAR, Yakup ERGÜN, Yusuf AÇIKGÖZ, Selin Aktürk ESEN, Özlem AYDIN, Ercan Aydın KARAHALİLOĞLU, İrem SARICANBAZ, Doğan UNCU

The benefit of surgery on survival for patients with stage 1 and 2 malignant pleural mesothelioma

Birol OCAK, Ahmet Bilgehan SAHIN, Bahar DAKİKİ, Hikmet Utku ODMAN, Sibel Oyucu ORHAN, Adem DELIGONUL, Hüseyin MELEK, Erdem ÇUBUKÇU, Turkkan EVRENSEL