The Spectrum of β-Thalassemia Mutations in Batman, South-Eastern Turkey

Objective: In this study, we aimed to determine the mutation types and the frequencies of these mutations in the patients with thalassemia in Batman province and to provide the use of these findings in genetic counselling.Methods: The study included 46 patients (27 male and 19 female) with a mean age of 9.5 ± 3.6 years (range: 3-16 years). In this study, mutations were determined by sequence analysis method.Results: 7 different mutations were detected in patients. IVS-I-110 (G>A) (56.25%), codon 44 (-C) del (16.25%), IVS-I-1 (G>A) (12.5%), IVS- II-1 (G>A) (6.25%) were the most common and they were found to constitute 91.25% of the cases. As in other regions of Turkey, IVI-1-110 (G >A) was the most frequent mutation detected. In this study; 28 mutant alleles including IVS-I-110 (G>A)/IVS-I-1 (G> A) (4), IVS-I-110 (G>A)/IVS-II-1 (G> A) (4), codon 8 (-AA) del/IVS-1-110 (G>A) (1), codon 8 (-AA) del/ codon 44 (-C)del (1), codon 15 (GG-GA)/codon 44 (-C) del (1), codon 44 (-C) del/IVS-I-1 (G> A) (1), codon 44 (-C) del/ IVS-II-1 (G> A) (1), codon 44 (-C)del/IVS-I-110 (G>A) (1) were found to have formed a compound heterozygous mutation. Among the β-thalassemia patients in Batman province, 29 (56.25%) were determined to have β⁺ mutation, and 26 (43.75%) had β° mutation.Conclusion: It is important that we, in our study, discovered IVS-II-1 (G>A) mutation compounded with heterozygous in five patients and codon 8 (-AA) del mutation as homozygous in one patient who presented a clinical manifestation of thalassemia intermedia despite having homozygous beta thalassemia. These results will contribute to genetic counseling and prenatal diagnosis.

Türkiye’nin Güneydoğusunda Batman’da β-Talasemi Mutasyonlarının Spektrumu

Amaç: Bu çalışmada, Batman illinde talasemi hastalarının mutasyon tiplerini ve bu mutasyonların sıklıklarını belirleyerek bu bulguların genetik danışmanlıkta kullanılabilmesini amaçladık. Yöntemler: Çalışmaya yaş ortalaması 9.5 ± 3,6 yıl (dağılım: 3-16 yıl) olan 46 hasta (27 erkek ve 19 kadın) alındı. Bu çalışmada mutasyonlar dizi analizi yöntemi ile saptandı. Bulgular: Hastalarda 7 farklı mutasyon saptandı. IVS-I-110 (G>A) (%56,25), codon 44 (-C) del (%16,25), IVS-I-1 (G>A) (%12,5), IVS-II-1 (G>A) (%6,25) en sık olarak belirlendi ve bunların vakaların %91,25’ini oluşturduğu görüldü. Türkiye’nin diğer bölgelerinde olduğu gibi IVI-1-110 (G>A) en sık saptanan mutasyon oldu. Çalışmada ; IVS-I-110 (G>A)/IVS-I-1 (G> A) (4), IVS-I-110 (G>A)/IVS-II-1 (G> A) (4), codon 8 (-AA)del/IVS-1-110 (G>A) (1), codon 8 (-AA)del/ codon 44 (-C)del (1), codon 15 (GG-GA)/codon 44 (-C)del (1), codon 44 (-C) del/IVS-I-1 (G> A) (1), codon 44 (-C)del/ IVS-II-1 (G> A) (1), codon 44 (-C)del/IVS-I-110 (G>A) (1) adet olmak üzere 28 mutant allelin birleşik heterozigot mutasyon oluşturduğu saptandı. Batman ilinde toplam β-talasemi hastalarının 29’unda (%56,25) β⁺ mutasyonu, 26’ında (%43,75) β° mutasyonu tespit edildi. Sonuç: Çalışmamızda Homozigot beta talasemi olmasına rağmen talasemi intermedia klinik tablosu yapan codon 8 (-AA)del mutasyonunu bir hastada IVS-II-1 (G>A) mutasyonunu beş hastada bulmamız önemlidir. Bu sonuçlar genetik danışma ve doğum öncesi tanıda yardımcı olacaktır.

PDF

___

1. Clarke GM, Higgins TN. Laboratory Investigation of Hemoglobinopathies and Thalassemias: Review and Update. Clin Chem 2000; 46: 1284-90.

2. Alwar V, Kavadia R, Singh N, et al. Hunt for hidden trait. J Lab Physicians 2009; 1: 15-18.

3.Fucharoen S, Winichagoon P.Hemoglobinopathies in Southeast Asia: molecularbiology and clinical medicine. Hemoglobin 1997;21: 299-319.

4.Thein SL. Pathophysiology of β-thalassemiaAguide to molecular therapies. Hematology Am SocHematol Educ Program 2005; 31–7.

5.Erlandson ME, Brilliant R, Smith CM. Comparisonof sixty-six patients with thalassaemia major andthirteen patients with thalassaemia intermedia.Ann NY Acad Sci 1964; 119: 727-35.

6.Fucharoen S. Genotypes and Phenotypes ofThalassemia: A Discussion. Ann NY Acad Sci 2005;1054: 518-21.

7.Asadov C, Abdulalimov E, Mammadova T, et al.Genotype-Phenotype Correlations of β-ThalassemiaMutations in an Azerbaijani Population. Turk JHematol 2017; 34: 258-263.

8.Davies SC, Wonke B. The management ofhaemoglobinopathies. Bailliere's Clin Haematol1991; 4: 361-389.

9.Hershko C. Role of Iron Chelation Therapy inThalassemia Major. Turk J Haematol 2002; 19: 121-6.

10.Sookaromdee P, Wiwanitkit V. Glomerular andTubular Functions in Transfusion-Dependent.Thalassemia. Turk J Hematol 2018; 35: 137-51.

11.Canatan D, Necati Koç N. The effect oftransfusion on pulmonary function tests in patientswith thalassemia. Turk J Haematol 2004; 21: 137-9

12.Kervancıoğlu M, Devecioğlu C, Okur N. Çocukkardiyoloji polikliniğine göğüs ağrısı yakınmasıylabaşvuran hastaların değerlendirilmesi. Dicle TıpDergisi 2005; 32: 196-200.

13.Asadı-pooya AA, Karamıfar H. Body mass indexin children with beta-thalassemia major. Turk JHaematol 2004; 21: 177-80

14.Cappellini MD, Cohen A, Eleftheriou A, et al.Guidelines for the Clinical Management ofThalassaemia, 2nd Revised edition. Nicosia (CY):Thalassaemia International Federation, 2008.

15.Rachmilewitz EA, Giardina PJ. How I treatthalassemia. Blood 2011: 118: 3479-88.

16.Çürük MA, Zeren F, Genç A, et al. Prenataldiagnosis of sickle cell anemia and beta-thalassemiain southern Turkey. Hemoglobin 2008; 32: 525-30.

17.Mendilcioglu İ, Yakut S, Keser İ, et al. Prenataldiagnosis of p-thalassemia and otherhemoglobinopathies in southwestern Turkey.Hemoglobin 2011; 35: 47-55.

18.Aydınok Y, Oymak Y, Atabay B, et al. A NationalRegistry of Thalassemia in Turkey: Demographicand Disease Characteristics of Patients,Achievements, and Challenges in Prevention. Turk JHematol 2018; 35: 12-8.

19.Thein SL. Genetic modifiers of β -thalassemia.Hematologica 2005; 90: 649-60.

20.Altay C, Başak N. Molecular basis and prenataldiagnoses of hemoglobinopathies in Turkey. Int JPediatr Hematol Oncol 1995; 2: 283-90.

21.Altay C, Yılgor E, Beksac S, et al. Premaritalscreening of hemoglobinopathies in Turkey: a pilotstudy in Turkey. Hum Hered 1996; 46: 112-4.

22.Gürgev A. Beksac S. Gümrük E. Et al. Prenataldiagnosis of hemoglobinopathies in Turkey:Hacettepe experience. Pediatr Hematol Oncol 1996;13: 163-6.

23.Tüzmen S, Tadmouri GO, Özer A, et al. Prenataldiagnosis of beta-thalassaemia and sickle cellanaemia in Turkey. Prenat Diagn 1996; 16: 252-8.

24.Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel MüdürlüğüEvlilik öncesi hemoglobinopati tarama programısaha rehberi. Çocuk ve Ergen Sağlığı DaireBaşkanlığı, 2018.