METİSİLİNE DİRENÇLİ STAPHYLOCOCCUS AUREUS SUŞLARININ ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARI VE PULSED FIELD JEL ELEKTROFOREZ YÖNTEMİ İLE TİPLENDİRİLMELERİ
Amaç: Bu çalışma, Ekim 2003-Mart 2004 tarihleri arasında Hacettepe Üniversitesi Erişkin ve Onkoloji Hastaneleri’nde yatan hastalardan izole edilen Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) suşlarının, fenotipik bir yöntem olan antibiyotik duyarlılık testi ve genotipik bir yöntem olan Pulsed Field Jel Elektroforezi (PFGE) ile tiplendirilmeleri amacıyla gerçekleştirildi.Gereç ve Yöntem: Çalışmada kullanılan izolatların antibiyotik duyarlılıkları MIK yöntemi ile saptandı. Söz konusu bakteriler, genomları SmaI restriksiyon endonükleaz ile kesildikten sonra PFGE ile karakterize edildi.Sonuç ve Tartışma: İki tanesi (Ant1 ve Ant2) yaygın olmak üzere toplam 9 antibiyotip belirlendi. PFGE kullanılarak yapılan çalışma sonucunda bir baskın tip (Tip A) belirlendi. Bu baskın tipin dışında daha az örnekle temsil edilen üç tip (Tip B, C, D) tespit edildi. Tip A’nın 8, tip B’nin 2 ve tip C’nin 5 tane alt tipi belirlenmiştir. Çalışma tarihleri arasında MRSA’ya bağlı bir epidemi oluşmadığı belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, tiplendirme çalışmalarında PFGE tekniğinin, antibiyotik seyirlerinin karşılaştırılmasıyla yapılan fenotipik tiplendirme yönteminden daha hassas olduğunu göstermektedir.
Anahtar Kelimeler:
antibiyotik duyarlılığı, genotiplendirme, hastane enfeksiyonları, metisiline dirençli Staphylococcus aureus, pulsed field jel elektroforezi
TYPING OF METHICILLIN RESISTANT STAPHYLOCOCCUS AUREUS STRAINS BY ANTIBIOTIC SUSCEPTIBILITIES AND PULSED FIELD GEL ELECTROPHORESIS METHOD
Objective: This study was carried out for typing of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains, isolated from patients hospitalized at Hacettepe University Adult and Oncology Hospitals between October 2003-March 2004, by using the phenotypic method of antibiotic susceptibility testing and the genotypic method of Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE).
Keywords:
antibiotic susceptibility, genotyping, hospital acquired infections, methicillin resistant Staphylococcus aureus, pulsed field gel electrophoresis,
___
- Haznedaroğlu, T. (2013). MRSA Korunma Ve Kontrol. http://docplayer.biz.tr/7038727-Metisilin-direncli-s-aureus-mrsa-korunma-ve-kontrol.html
- Dilek, N. (2005). Enfeksiyon kapan hastanelere neşter. Aksiyon Haftalık Haber Dergisi. 10 (570): 1-5. Retrived November 13, 2005, from http//www.aksiyon.com.tr/detay.php?id=22379
- Durmaz, R. (2001). Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji, Nobel Tıp Kitabevleri Ltd. Sti., İstanbul, p.142.
- Ranjbar, R., Karami, A., Farshad, S., Giammanco, G.M., Mammina, C. (2014). Typing methods used in the molecular epidemiology of microbial pathogens: a how-to guide. The New Microbiologica, 37(1), 1–15.
- Montesinos, I., Salido, E., Delgado, T., Cuervo, M., Sierra, A. (2002). Epidemiologic genotyping of methicillin-resistant Staphylococcus aureus by pulsed-field gel electrophoresis at a university hospital and comparison with antibiotyping and protein a and coagulase gen polymorphisms. Journal of Clinical Microbiology, 40, 2119-2125.
- Blanc, D.S., Petignat, C., Moreillon, P., Wenger, A., Billie, J., Francioli, P. (1996). Quantitative antibiogram as a typing method for the prospective epidemiological surveillance and control of MRSA: comparison with molecular typing. Infection Control and Hospital Epidemiology, 17, 654-659.
- Durmaz, R. (2001). Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji, Nobel Tıp Kitabevleri Ltd. Sti., İstanbul, p.143.
- Şardan, Y.Ç. (2003). Hastanelerde salgın incelemesi. Hastane İnfeksiyonları Dergisi,7, 100-106.
- Bilgehan, H. (1990). Klinik Mikrobiyoloji. Özel Bakteriyoloji ve Bakteri Enfeksiyonları, Barış Yayınları, İzmir, p.184-204.
- Collins, C.H., Lyne, P.M. Grange, J.M. (2001). Collin’s and Lyne’s Microbiological Methods, Oxford University Press Inc., Newyork, p.110-111.
- National Committee for Clinical Laboratory Standards. (2003). Approved Standard M7-A6. Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically, 6th ed. NCCLS, Wayne, Pa.
- Lencastre, H., Couto, I., Santos, I., Melo-Cristino, J., Torres-Pereira, A., Tomasz, A. (1994). Methicillin-resistant Staphylococcus aureus disease in a Portuguese Hospital. Characterization of clonal types by a combination of DNA typing methods. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 13, 64–73.
- Durmaz, R. (2001). Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji, Nobel Tıp Kitabevleri Ltd. Sti., İstanbul, p.161.
- Birren, B., Lai, E. (1993). Pused Field Gel Electrophoresis, Academic Press Inc, California, p.90.
- Wang, J.T., Chen, Y.C., Yang, T.L., Chang, S.C. (2002). Molecular epidemiology and antimicrobial susceptibility of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Taiwan. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 42, 199-203.
- Garner, J.S., Jarvis, W.R., Emori, T.G., Horan, T.C., Hughes, J.M. (1988). CDC Definitions for nosocomial infections, American Journal of Infection Control, 16(3), 128-140.
- Aygün, G. (2009). Ülkemizde Hastane İnfeksiyonlarının Değerlendirilmesi: Güncel Durum, 14. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi, 25-29 Mart, Antalya, Türkiye, 2009.
- Filetoth, Z. (2003). Hospital-acquired Infection Causes and Control, Whurr Publishers Ltd., London, p.92
- Durmaz, R. (2001). Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji, Nobel Tıp Kitabevleri Ltd. Sti., İstanbul, p.164.
- Atmaca, Ö., Köşker, P.Z., Karahan, C., Çakir, B., Ünal, S. (2014). Erişkin ve Onkoloji Hastanelerinde Yatan Hastalarda Saptanan Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus Bakteriyemilerinde Risk Faktörleri (2004-2011), Antibiyotik Kullanımı ve İzolatların Antimikrobiyal Duyarlılıkları : Yuvalandırılmış Olgu-Kontrol Çalışması. Mikrobiyoloji Bülteni, 48(4), 523–537.
- Zarakolu, P., Metan, G., Karahan, Z.C., Tekeli, A., Ünal, S. (2016). Bacterial factors influencing the mortality for methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) bacteremia. Infectious Diseases, 48(8), 649–650.
- Faria, N.A., Oliveira, D. C., Westh, H., Monnet, D. L., Larsen, A. R., Skov, R., De Lencastre, H. (2005). Epidemiology of emerging methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Denmark: a nationwide study in a country with low prevalence of MRSA infection. Journal of Clinical Microbiology, 43, 1836–1842.
- Ho, P.L., Cheung, C., Mak, G.C., Tse, C.W., Ng, T.K., Cheung, C.H., Que, T.L., Lam, R., Lai, R.W., Yung, R.W., Yuen, K.Y. (2007). Molecular epidemiology and household transmission of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Hong Kong. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 57, 145–151.
- Kuehnert, M.J., Kruszon-Moran, D., Hill, H.A., McQuillan, G., McAllister, S.K., Fosheim, G., McDougal, L.K., Chaitram, J., Jensen, B., Fridkin, S.K., Killgore, G., Tenover, F.C. (2006). Prevalence of Staphylococcus aureus nasal colonization in the United States, 2001–2002. The Journal of Infectious Diseases, 193, 172–179.
- Tiemersma, E.W., Bronzwaer, S.L., Lyytikainen, O., Degener, J.E., Schrijnemakers, P., Bruinsma, N., Monen, J., Witte, W., Grundman, H. (2004). Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Europe, 1999–2002. Emerging Infectious Diseases, 10, 1627–1634.
- Çetinkaya, Y., Ünal, S. (1996). Metisilin dirençli S. aureus infeksiyonları epidemiyoloji ve kontrol. Flora, 1, 1-16.
- Goering, R.V. (2010). Pulsed field gel electrophoresis: a review of application and interpretation in the molecular epidemiology of infectious disease. Infection Genetics and Evolution, 10, 866-875.
- Faria, N.A., Carrico, J.A., Oliveira, D.C., Ramirez, M., De Lencastre, H. (2008). Analysis of typing methods for epidemiological surveillance of both methicillin-resistant and methicillin-susceptible Staphylococcus aureus strains. Journal of Clinical Microbiology, 46(1), 136–144.
- Durmaz, R. (2001). Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji, Nobel Tıp Kitabevleri Ltd. Sti., İstanbul, p.144-145.
- Hunter, P.R., ve Gaston, M.A. (1988). Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity. Journal of Clinical Microbiology, 26, 2465–2466.
- Simpson, E.H. (1949). Measurement of species diversity. Nature, 163, 688.
- Grundmann, H., Hori, S., Tanner, G. (2001). Determining confidence intervals when measuring genetic diversity and the discriminatory abilities of typing methods for microorganisms. Journal of Clinical Microbiology, 39, 4190–4192.
- ISSN: 1015-3918
- Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
- Başlangıç: 2016
- Yayıncı: Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi
Sayıdaki Diğer Makaleler
NEOPTERİN: GASTROİNTESTİNAL KANSERDE OLASI BİR BİYOBELİRTEÇ
Aysun HACISEVKI, Burcu BABA, Sebahattin ASLAN, Yesim OZKAN
ÇOK AMAÇLI DÖRT KONTAKT LENS BAKIM SOLÜSYONUNUN ANTİMİKROBİYAL ETKİNLİKLERİ
Mujde ERYILMAZ, Banu KASKATEPE, Merve Eylul KIYMACI, Duygu SIMSEK, Hilal Basak EROL
MEME KANSERİNDE ETKİLİ TIBBİ BİTKİLER VE SEKONDER METABOLİTLERİ
Serdar ÖZGÜÇ, Hüsniye KAYALAR, Ulvi ZEYBEK
TÜRKİYE’DE 2006-2011 YILLARINDA PROTON POMPASI İNHİBİTÖRLERİ TÜKETİMİNİN BÜTÇEYE ETKİSİ