Güney Trakya Havzası'nın Eosen ile başlayan sedimenter istifi iki farklı temel üzerinde yer alır: (1) Saros Körfezi’nin kuzeyinde Üst Eosen konglomera ve kireçtaşları, sleyt, koyu renkli kireçtaşı ve fillitten oluşan metamorfik bir temel üzerinde bulunur. Bu metamorfik kayalar, Yunanistan’daki Rodop Çevresi Kuşağı’nın doğuya doğru olan devamını teşkil eder. (2) Ganos Fayı güneyinde Şarköy çevresinde ise serpantinit, metadiyabaz ve mavişistlerden oluşan bir temel tektonik dilimi üzerinde uyumsuzlukla geç Bartoniyen–erken Priaboniyen yaşlı sığ denizel Soğucak Formasyonu kireçtaşları yer alır. Mürefte kuzeyinde Soğucak kireçtaşları altında geç İpreziyen yaşlı transgressif bir seri (Dişbudak serisi) haritalanmıştır. Kumtaşları ile başlayan Dişbudak serisi üste doğru kumlu kireçtaşı ve marnlara geçer. Ganos Fayı güneyinde açılmış olan petrol arama kuyuları da Soğucak kireçtaşı veya Dişbudak serisi altında ofiyolitik bir temel kesmiştir. Kuzey Anadolu Fayı’nın Trakya’daki kolunu temsil eden Ganos Fayı bu iki farklı temel arasındaki sınırı oluşturur. Soğucak Formasyonu kireçtaşları üzerinde içinde olistostromlar bulunduran Geç Eosen yaşlı bir fliş yer alır. Fliş istifi içindeki çakıl ve bloklar Soğucak Formasyonu'na ait sığ denizel kireçtaşı, Kretase ve Paleosen pelajik kireçtaşı, serpantinit, bazalt, gabro, grovak, kuvars-diyorit ve yeşilşistten yapılmıştır. Birleşik olistolitler, altta pelajik kireçtaşı veya bazalt ve onu uyumsuzlukla örten Üst Eosen kireçtaşlarından oluşur. Geç Eosen yaşındaki kütle akıntıları genişlemeli bir tektonik ortamda, güneye bakan büyük normal fayların yamaçlarından kaynaklanmıştır. Dişbudak serisinin, temel-Eosen dokanakları boyunca genellikle gözlenmemesi, Güney Trakya Havzası'nın oluşumuna yol açan ana transgresyonun geç Bartoniyen’de meydana geldiğine işaret etmektedir

The Eocene sequence of the southern Thrace Basin unconformably overlies two types of basement: (1) Slate, limestone and phyllite crop out in small inliers under the Upper Eocene conglomerates and limestones in the Mecidiye region, north of Saros Bay. These low-grade metamorphic rocks form the eastern extension of the Circum-Rhodope Belt of Greece. (2) In the Şarköy region south of the Ganos Fault, tectonically elevated basement consisting of serpentinite, metadiabase and Upper Cretaceous blueschists is unconformably overlain by the upper Bartonian to lower Priabonian shallow marine limestones of the Soğucak Formation. In some places erosional remnants of an upper Ypresian transgressive sequence (the newly discovered Dişbudak series) underlie the Soğucak Limestones. This Dişbudak series starts with sandstone and conglomerate and passes up into sandy limestone, marl and shale. Hydrocarbon exploration wells south of the Ganos Fault have also encountered an ophiolitic mélange basement under the Dişbudak series and/or under the Soğucak Formation. The Ganos Fault forms the boundary between the two basement types. The Soğucak Limestone is overlain by an Upper Eocene to Early Oligocene flysch sequence with olistostromes. The clasts in the flysch include the Soğucak Limestone, Cretaceous and Palaeocene pelagic limestone, serpentinite, basalt, gabbro, greywacke, quartz-diorite and greenschist. They range in size from sand grains to olistoliths up to one kilometre across. Composite olistoliths consist of pelagic limestone or basalt overlain by the Upper Eocene limestone. The Upper Eocene mass flows were probably formed in an extensional setting and were derived from the south from the flanks of large normal faults related to the opening of the southern Thrace Basin. The Dişbudak series is absent along the observed basement-Eocene contacts, which implies that the main transgression leading to the development of the southern Thrace Basin started in the late Bartonian.