AKIM SİTOMETRİ’DE RNA ÖLÇÜMÜNÜN ÖZGÜNLÜĞÜ VE GÜVENİRLİLİĞİ

Bu çalışmanın amacı akım sitomeride (AS) ile ölçümünün özgün ve güvenilir olup olmadığını test etmektir. Bu amaçla; RNA içeriği bilinen farklı hücreler ve RNA sentezini durduran ajanlar kullanılarak AS deki RNA ölçümünün özgünlüğü ve güvenirliliği dört ayrı işlemle test edildi.1) Periferal Kan Medyum içerisinde, mitojenle uyarılmış mononükleer hücrelerin (PKMNH=periferal kan mononukleer hücre) RNA içerikleri AS ile ve kit ile izole edilip spektrofotometride ölçülerek karşılaştırıldı. Her iki yöntemle bulunan sonuçların birbiriyle uyumlu oldukları görüldü (p=0.026, r=0.974) 2) AS’de RNA ölçümünün yinelenebilirliği aynı ve farklı kişilerden alınan örnekler çalışılarak test edildi. a) Sağlıklı bir kişiden 8 ml kan alınarak 4 farklı tüpe bölündü. Bölünen kanların mononükleer hücreleri izole edildi, boyandı ve RNA içerikleri AS’de ölçüldü. Aynı kişiye ait kan örneklerinin RNA içerikleri arasındaki varyasyon katsayısı (V)=%0,75 olarak bulundu. b) Beş sağlıklı kişiden 2 şer ml kan alındı ve mononükleer hücreleri izole edildi, boyandı ve RNA içerikleri AS’de ölçüldü. Beş sağlıklı kişinin RNA içerikleri arasındaki varyasyon katsayısı (V)= %1.72 olarak bulundu. 3) Aktinomisin deneyi: Aynı kişinin mononükleer hücreleri Periferal Kan Medyum içeren iki kültür flaskına ekilerek iki gün mitojenle uyarıldı. Kültür flasklarından birine RNA sentezini durudurmak amacıyla 24. saatte 0.05 µg/ml aktinomisin D ilave edildi, diğerine ise herhangi bir işlem yapılmadı. Mitojenle uyarılan mononükleer hücrelerin 48 saat sonra RNA içerikleri AS ile ölçüldü. Sonuçta aktinomisin-D ile etkileştirilmiş olan hücrelerin RNA içeriğinin artmadığı AS ile belirlendi. 4) RNA içerikleri bilinen hücrelerin F640 meanX değerlerinin AS ölçümlerinin karşılaştırılması: ALL (Akut Lenfoblastik Lösemi), AML (Akut Miyeloid Lösemi)’li hastalardan ve sağlıklı bir kişiden 2’şer ml kan örneği alınarak, mononükleer hücreleri izole edildi, boyandı ve RNA içerikleri AS’de ölçüldü. ALL ve AML’li hastaların hücrelerinin RNA içerikleri sağlıklı bireyin hücrelerinin RNA içeriğinden daha yüksek bulundu. Sonuç olarak Türkiye’de hiç çalışılmamış, optimize edilmemiş olan AS’de RNA ölçüm yöntemi, yapılan bu çalışma ile hem tanı amaçlı, hem de araştırma amaçlı kullanılabilir, özgün ve güvenilir bir yöntem olarak geliştirilmiştir

The Specificity and Reliability of RNA Measurement in Flow Cytometry

The aim of this work is to establish whether or not specificity/ reliability of our RNA measurement in flow cytometry is consistent. RNA measurement specificity was established using various cells with known RNA content and blocking agents: 1) Results of the comparison of the RNA content during the mitogen-stimulated growth of Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMNCs) in Peripheral Blood Medium found by our flow cytometric method and by the kit were compared. The results obtained with the two different methods were concordant (p=0.026, r=0.974). 2) Replicability of the RNA (F640 mean X) measurement for the same and for different individuals: a) 8 ml of peripheral blood sample from a healthy individual was divided into 4 portions and each of which was submitted for isolation, staining and fluorescence measurement procedures. Variation coefficient (V) was found as 0.75% among RNA contents of the tubes (V=0.75) .b) 2 ml of peripheral blood samples from 5 healthy individuals was submitted for isolation, staining and fluorescence measurement procedures. Variation cofficient (V) was found as 1.72% among RNA contents of the five healthy individulals (V=1.72 %). Actinomycin D experiment: The two PBMNCs flasks from a healthy individual were cultured in Peripheral Blood Karyotyping Medium simultaneously for 2 days. One of the flasks received 0, 05 µg/ml of actinomycin D 24 h after the initiation of the cultures and cell luminescence of each flask was measured at 48 h. We did not obtain an increase in cellular RNA content in actinomycin D treated cells versus untreated cells, 4) Comparison of F640 mean X measurements in the cells of known character in RNA content: 2 ml of peripheral blood samples from ALL, AML patients and healthy control was submitted to isolation, staining and fluorescence measurement procedures. RNA content of ALL and AML patients’ cells were higher than those of healthy control. This experiment shows that our F640 mean X measurement indicates the RNA level in the cell. We concluded that our evaluation of the relative RNA content is reliable

___

  • Darzynkiewicz Z. Simultaneous analysis of cellular RNA and DNA content, Methods in Cell Biology, Academic Press 1994, Vol. 41: pp 401-420,
  • Hiraki M. Intracellular DNA and RNA in the course of tumor growth. Kurume Med J 1994, 41: 1-13.
  • Grunwald D. Flow Cytometry and RNA studies. Biol Cell 1993, 78: 27-30.
  • Darzynkiewicz Z,Tragonos F,Sharpless T, Melamed MR. Lymphocyte stimulation: A rapid multiparameter analysis. Medical Sciences1976,73: 2881- 2884.
  • Traganos F, Darzynkiewicz Z, Sharpless T, Melamed MR. Simultaneous staining of ribonucleic and deoxyribonucleic acids in unfixed cells using acridine orange in a flow cytofluorometric system. J Histochem Cytochem 1977, 25: 46-56.
  • Yılmaz MT, Deniz G. Cytometry’nin çalışma mekanizması ve prensipleri. Bilmedya grup, Aktüel Tıp Dergisi, İstanbul1999, ss 1-9.
  • Radcliff G, Jaroszeski MJ. Basic of Flow Cytometry. In: Jarazeski, MJ, Heller, R. (Eds). Methods in Molecular Biology. Flow cytometry Protocols, Humana Press Inc., Totawa, NJ, 1988, 91:1-24.
  • Steck K, El-Naggar A. Simultaneous DNA/RNA analysis of solid and hematoreticular malignancies. In: Jarazeski MJ, Heler R. (Eds), Methods in Molecular Biology. Flow cytometry Protocols. Humana Press Inc, Totawa, NJ, 1988, 91: 167-180.
  • Toba K, Winton E F, Koike T, Shibata A. Simultaneous three color analysis of surface phenotype and DNA-RNA quantitation using 7- amino-actinomycin D and pyronin Y. J Immunol Meth 1995, 182:193-207.
  • Darzynkiewicz Z. DNA-RNA differential staining using AO. In: Robinson JP (Ed), Handbook of Flow Cytometry Methods. A John Wıley and Sons Inc, USA 1993, p114.
  • Hiddeman W, Wörmann B, Messerer D, Sprngefeld R, Büchner Th. Analysis of the cellular DNA and RNA content in acute leukemias by Flow Cytometry. J Cancer Res Clin Oncol 1990, 116: 507-512.
Sağlık Bilimleri Dergisi-Cover
  • ISSN: 1018-3655
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Başlangıç: 1993
  • Yayıncı: Prof.Dr. Aykut ÖZDARENDELİ
Sayıdaki Diğer Makaleler

Adnan menderes Üniversitesi Sağlık Yüksekokulu ve Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekolulu öğrencilerinin sigaraya yönelik, bilgi, tutum ve davranışları

Nimet KILIÇ, H. Nurcan EK

KONJUGE LİNOLEİK ASİT: OBEZİTEDE ETKİLERİ

Neriman İNANÇ

PROSTAT HİPERPLAZİ VE KANSER DOKU ÖRNEKLERİNDE İKİ BOYUTLU AgNOR DEĞİŞİKLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

Perihan GÖKALP, Nurhan CÜCER, Atilla TATLIŞEN, Nalan İMAMOĞLU

FİTOHEMAGGLÜTİNİN KONSANTRASYONUNUN DOWN SENDROMLU VE SAĞLIKLI BİREYLERİN LENFOSİTLERİNDEKİ MİTOTİK İNDEKSLERİNE ETKİSİ

Nalan İMAMOĞLU, Halil DEMİRTAŞ

İNSAN KAN LENFOSİTLERİNDE SİTRİNİNİN MİTOTİK İNDEKS ÜZERİNE ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI

Hamiyet Dönmez ALTUNTAŞ, Gülcan Dumlupinar COŞGUN, Nalan İMAMOĞLU, Zuhal HAMURCU, Bilal Cem LİMAN, Halil DEMİRTAŞ

İnsan kan lenfositlerinde sitrininin mitotik indeks üzerine etkisinin araştırılması

Zuhal HAMURCU, Halil DEMİRTAŞ, Dönmez Hamiyet ALTUNTAŞ, Dumlupınar Gülcan COŞGUN, Nalan İMAMOĞLU, Bilal Cem LİMAN

AMASYA İLİNDE SATIŞA SUNULAN BEYAZ PEYNİRLERDE AFLATOKSİN M1, RUTUBET VE ASİDİTE DEĞERLERİ ÜZERİNE BİR ARAŞTIRMA

Yaşar ALKAN, Zafer GÖNÜLALAN

Fitohemagglütinin konsantrasyonunun Down sendromlu ve sağlıklı bireylerin lenfositlerindeki mitotik indekslerine etkisi

Halil DEMİRTAŞ, Nalan İMAMOĞLU

STANDART VE SIKIŞIK KAFES YOĞUNLUĞUNDA YETİŞTİRİLEN YUMURTA TAVUĞU KARMA YEMLERİNE ORGANİK ASİT İLAVESİNİN PERFORMANSA ETKİSİ

Erkan KUM, Berrin Kocaoğlu GÜÇLÜ

AKIM SİTOMETRİ’DE RNA ÖLÇÜMÜNÜN ÖZGÜNLÜĞÜ VE GÜVENİRLİLİĞİ

Zuhal HAMURCU, Halil DEMİRTAŞ, Türkan PATIROĞLU