Böceklerde Farklı Muhafaza Koşulları ve Zamanın Mitokondrial DNA Kalitesi Üzerine Etkisi: Bir Diptera (Tephiritidae) Örneği Çalışması

Bu çalışmada geleneksel öldürme yöntemleri ile elde edilmiş ve farklıkoşullarda muhafaza edilen Tephritidae familyasına ait Euarestabullans (Wiedemann, 1830) örneklerinden DNA izole edilerekmuhafaza koşulları ve muhafaza sürelerine bağlı olarak DNA kalitesive PZR başarıları araştırılmıştır. Bu anlamda standart barkod geniolan mitokondriyal sitokrom oksidaz I (COI) gen bölgesikullanılmıştır. 15 yıllık örneklerden kuru ortamda (müze materyali)muhafaza edilenlerin yaşı ile PZR başarısı arasında tam bir ilişkigözlemlenmemiştir. Ancak alkolde (%95’lik etil alkol) saklananörneklerde ise DNA kalitesi ve PZR başarısı yüksek bulunmuştur.

The Effects of Different Storage Conditions and Storage Time on The Quality of The Mitochondrial DNA on Insects: Sample Study is A Fruit Fly (Diptera: Tephiritidae)

In this study, DNA was isolated from the samples of Euaresta bullans (Wiedemann, 1830) belonging to the Tephritidae family which was obtained by traditional killing methods and kept under different conditions. In this sense, the standard barcode gene mitochondrial cytochrome oxidase I gene (COI) was used. The lack of relationship observed between the age of samples that were kept in dry conditions (museum material) for 15 years and PCR success. However, the DNA quality and PCR success of the samples stored in alcohol (95% ethyl alcohol) were found to be high.

___

Barret RDH, Hebert PDN 2005. Identifying spiders through DNA barcodes. Canadian Journal of Zoology, 83: 481-491.

Catzeflis FM 1991. Animal tissue collections for molecular genetics and systematics. Trends in Ecology and Evolution, 6(5): 168.

Çalışkan Keçe AF, Özbek Çatal B, Ulusoy MR 2019. A New Invasive Species in Turkey: Dacus ciliatus Loew, 1862 (Diptera: Tephritidae). Turkish Journal of Entomology. 43 (1): 25-30.

Dean DM, Ballard JWO 2001. Factors affecting mitochondrial DNA quality from museum preserved Drosophila simulans. Entomologia Experimentalis et Applicata 98:279-283.

Folmer O, Black M, Hoeh W, Lutz R, Vrijenhoek R 1994. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Molecular Marine Biology and Biotechnology, 3(5): 294-299

Goldstein PZ, DeSalle R (2003) Calibrating phylogenetic species formation in a threatened insect using DNA from historical specimens. Mol Ecol 12:1993–1998.

Hebert PDN, Ratnasingham S, Dewaard JR 2003. Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit I divergences among closely related species. Proc. Royal Society London B (Suppl.): 596-599.

Korneyev VA 1999. Phylogenetic relationships among higher groups of Tephritidae. In Fruit Flies (Tephritidae): Phylogeny and Evolution of Behavior. CRC Press, Boca Raton, xi 944 p (73– 113).

Lodge RJ, Freeland JR 2003, The use of Odonata museum specimens in questions of molecular evolution. Odonatologica, 32:375–380.

Norrbom AL 1999. A Generic reclassification an pylogeny of the tribe Myopitini (Tephritinae). In Fruit Flies (Tephritidae): Phylogeny and Evolution of Behavior. CRC Press, Boca Raton. xi 944 p (581 – 627).

Vink JC, Steven MT, Pierre P, Cheryl HY, Marshal H 2005. The effects of preservatives and temperatures on arachnid DNA. Invertebrate Systematics, 19: 99 -104.

Watts CPH, Thompson JD, Allen AK, Kemp JS 2007. How useful is DNA extracted from the legs of archived insects for microsatellite-based population genetic analyses. Journal of Insect Conservation, 11:195-198.

Yaran M, Kütük M, Görmez V, Koyuncu MÖ 2018. A new species and additional record of Terellia Robineau-Desvoidy (Diptera: Tephritidae) from Turkey with a key for the Cerajocera group. Turkish Journal of Zoology. 42: 661-665.
KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi-Cover
  • ISSN: 2619-9149
  • Yayın Aralığı: Yılda 6 Sayı
  • Başlangıç: 2018
Sayıdaki Diğer Makaleler

Phytochemical Analysis of Dorycnium pentaphyllum and Its Antiproliferative Effect on Cervix Cancer Cells

Yüksel ALİYAZICIOĞLU, SELİM DEMİR, Serap Özer YAMAN, Sıla Özlem ŞENER, Elif Ayazoğlu DEMİR, Rezzan ALİYAZICIOPĞLU, İbrahim TURAN

New invasive species in Turkey: Zaprionus indianus (Gupta) (Diptera: Drosophilidae)

Burcu Özbek ÇATAL, Asime Filiz ÇALIŞKAN KEÇE, Mehmet Rıfat ULUSOY

Detection of Extracellular Lipases and Genotypic Identification from Yeast Causing Spoilage of Some Dairy Products Produced in Gaziantep

Semih TOKAK, İbrahim Halil KILIÇ, HÜSNİYE TANSEL YALÇIN, Tuğçe DURAN

Brassicaceae, Chenopodiaceae ve Urticaceae Familyalarına Ait Bazı Bitkilerin Arbusküler Mikorhizal Funguslar (AMF)’la İlişkisi

Hasret GÜNEŞ, Semra DEMİR, Emre Demirer DURAK

Investigation of the Cytotoxicity of Fig, Lemon, Olive, and Turnip Exosomes on MCF-7 Cells

Oğuzhan KARAOSMANOĞLU

Çukurova Üniversitesi Yerleşkesinde Artan Yapılaşmanın Floraya Etkisinin Belirlenmesi

Muzaffer YÜCEL, Zerrin SÖĞÜT, Necattin TÜRKMEN, Deniz ÇOLAKKADIOĞLU, Barış KAHVECİ, Veli ÇELİKTAŞ

Apricot Culture in Container for Earliness

Sara DEMİRAL, Salih ÜLGER

Salvia verticillata L. (Dadırak)’nın Tohum Dormansisinin Kırılmasında Farklı Uygulamaların Etkileri

Ayşe Özlem TURSUN

Manisa İli Salihli ve Sarıgöl İlçelerindeki Zirai İlaç Bayilerinin Mesleki Tutum ve Davranışları ve Üreticiler ile İlgili Gözlemleri

Ahmet ÖZYÖRÜK, Elif ERBEK, Ümit ARSLAN

Meşe Palamudunun (Quercus coccifera L.) Farklı Kısımlarının A549, MCF-7 ve HeLa İnsan Kanser Hücrelerine Karşı Antikanser, Antiproliferatif ve Laktat Dehidrojenaz Enzim Aktiviteleri

Sevgi GEZİCİ