Bağımsızlığını kazandığı 1991 yılından sonra Kırgızistan’da din hizmetleri Sovyetler Birliği dönemindeki örgütlenmeye benzer şekilde sürdürülmektedir. Bu hizmetler başkent Bişkek’te “Müftiyat”, taşrada ise “Kaziyat” adı verilen birimler tarafından yürütülmektedir.