İzoenzimler bitki populasyonları arasında genetik farklılaşmanın tespit edilmesinde, sistematik ile ilgili problemlerin çözümünde ve çeşit tanılanmasında uzun yıllardan beri kullanılmaktadır. Bu çalışmada da Capsicum cinsi içerisinde tür içi ve türler arasında varyasyonu ortaya koymada enzim polimorfizminin kullanılabilme olanaklarını ortaya koyabilmek için yapılmıştır. Araştırma sonuçlarına göre izoenzimler markör olarak tür içi varyasyonu ortaya koymada yetersiz gibi görünürken, türler arası varyasyonu ortaya koymada daha etkili markörler olarak karşımıza çıkmıştır.

Isozymes have been used for a long time to reveal the genetic differences between populations, to solve the problems related to taxonomy, and to identify cultivars. This study was conducted to reveal the possibilities of using isozyme polymorphism to show intra-and interspecific variation between different Capsicum species. Experiment results showed that while isozyme analysis is rather not strong enough to reveal the intraspecific variation, it can be used to reveal the interspecific variation.