Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama)

Amaç: Bu çalışmada Polimeraz Zincir Reaksiyonu Tarama (PZR-T) yöntemiyle klonlama sonucu elde edilen bakteriyel kolonilerin pozitifliği araştırılmıştır. Gereç ve yöntem: Fasciola hepatica katepsin L1 geni ve sığır vebası virüs matriks genleri üç farklı vektör sistemine klonlandıktan sonra E.coli kompetan hücrelerine transformasyon yapıldı. Transformasyon sonucu elde edilen kolonilerin bir kısmı PZR-T yöntemi kullanılarak değerlendirmeye tabi tutuldu. PZR-T sonucu istenilen büyüklükte elde edilen bantları içeren koloniler belirlenerek klasik miniprep yöntemiyle plasmid DNA'lar elde edildi. Kesim deneyleri yapılarak istenilen gen bölgelerinin varlığı doğrulandı. Bulgular: PZR-T ile pozitif olduğu saptanan 61 örneğin tamamının miniprep sonrası yapılan kesim deneylerinde de pozitif olduğu belirlendi. Sonuç: PZR-T yöntemiyle hem çok daha kısa zamanda pozitif koloniler belirlenecek hem de materyal açısından büyük ölçüde tasarruf edilmiş olacaktır.
Anahtar Kelimeler:

-

Screening of Transformed Bacteriial Colonies By Using Polymerase Chain Reaction (Pcr-screening)

Aim: In this study, it was investigated that bacterial colonies obtained after transformation were tested whether they contained positive recombinant colonies by using PCR screening method. Material and method: For this aim, Fasciola hepatica cathepsin L1 gene and Rinderpest virus matrix gene were cloned into three different vector systems and transformed into E. coli. It was determined some bacterial colonies which had the right size band after PCR screening. Plasmid DNA of those bacterial colonies was extracted by classical miniprep method. The colonies positive with PCR screening were assayed by enzyme digestion assays to verify the PCR screening results. Results: There was 100% correlation between PCR screening and enzyme digestion assays. Conclusion: Using PCR screening method reduce the time requirement for detection the positive colonies and saving the materials used for plasmid DNA extraction.
Keywords:

-,

Fırat Tıp Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-9818
  • Başlangıç: 2015
  • Yayıncı: Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi
Sayıdaki Diğer Makaleler

Balık Omega-3 Yağ Asitlerinin Sıçan Testisinde Bazı Metabolik Enzim Aktiviteleri Üzerine Etkisi

Mustafa SARSILMAZ, H. Ramazan YILMAZ, Ahmet SONGUR, Aslı Ö. TÜRKOĞLU, Ömer AKYOL

İn Vitro Fertilizasyon Laboratuvarında Hazırlık ve Değerlendirme Aşamalarında Önemli Basamaklar

Meltem ÖZGÜNER, D. Özlem DABAK

Pilonidal Sinüs Hastalığında Body Mass Indexe (Bmı) Göre Demografik Özellikler ve Klinik Durum Farklı Mı?

Erhan AYGEN, Refik AYTEN

Akciğerde Adenoid Kistik Karsinoma: Olgu Sunumu

Feyza COŞKUN, Ahmet ÇEKİRDEKÇİ, Hayreddin YEKELER, M. Hamdi MUZ, Bengü ÇOBANOĞLU

Ameliyat Öncesi Pap Class-II Tiroid Lezyonlarının Ameliyat Esnasında Malignite Şüphesi Olanlarında Frozen Kesit İncelemesinin Sonuçları

Refik AYTEN, Erhan AYGEN

Dirsek Gecikmiş Posterior Kırıklı-çıkığında Speed'in Triseps V-y Uzatma Tekniği ile Açık Redüksiyon: Olgu Sunumu

Lokman KARAKURT, Ahmet EKİNCİ, Rüştü KÖSE

Deneysel Oluşturulan Hipotiroidizmin Sıçan Hipofizindeki Tirotrop, Somatotrop ve Mammotroplara Etkisi

Aysel KÜKNER, Jale ÖNER, Neriman ÇOLAKOĞLU, Hakan ÖNER, Candan ÖZOĞUL, Enver OZAN

Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Transforme Bakteriyel Kolonilerın Belirlenmesi (Pzr-tarama)

Aykut ÖZDARENDELİ, Zülal Aşçı TORAMAN, Salih KUK, Şükrü TONBAK, Yasemin BULUT, Ahmet KALKAN

Üst Üriner Sistemin Sintigrafik Görüntülemesi

İsmail ÇİFTÇİ, Tansel Ansal BALCI

Elazığ ve Bingöl Yörelerinde İçme Suyundaki İyot-129'un Tiroid Dokusunda Nodüler Formasyona Etkisi

Erhan AYGEN, Mahmut DOĞRU