Renal hücreli karsinomda bir heparanaz varyantı olan T5 oluşumunda miR-6814-5p'nin rolü

Amaç: Bu çalışmanın amacı insan renal hücre karsinomu (RHK) vakalarında insan heparanaz proteininin (HPSE) T5 adlı alternatif varyant proteininin aşırı ekspresyonunun nedeninin miR-6814-5p'nin artmış ekspresyonu olup olmadığını araştırmaktır. Ayrıca RHK vakalarının klinik parametreleri ile T5 ve miR-6814-5p ekspresyon seviyelerinin olası korelasyonu değerlendirilmiştir. Gereç ve Yöntem: T5 ve miR-6814-5p ekspresyon analizi, kullanıma hazır RHK cDNA panelinde qPCR yöntemi ile gerçekleştirildi. Bu panel, 10 evre-1, 5 evre-2, 13 evre-3 ve 11 evre-4 RHK hastalarının tümör dokularından ve 9 sağlıklı bireyden alınan normal böbrek dokularından elde edilen 48 cDNA örneğini içeriyordu. Bulgular: TNM evreleri, Fuhrman nükleer derece ve histolojik tip ile miR-6814-5p ve T5 ifadeleri arasında anlamlı bir ilişki bulunmadı. RHK tümör dokularında miR-6814-5p ekspresyon seviyesi, sağlıklı kontrollerden yaklaşık 8 kat daha yüksek ve T5 ekspresyon seviyesi yaklaşık 5 kat daha yüksekti. MiR-6814-5p ve T5 ekspresyon değişiklikleri, RHK vakalarının nötrofil / lenfosit oranı ile istatistiksel olarak anlamlı korelasyon gösterdi. Sonuç: MiR-6814-5p, RHK'de T5 oluşum mekanizmasında rol oynayabilir.

Role of miR-6814-5p for the formation of T5, a heparanase variant, in renal cell carcinoma

Purpose: The aim of this study is to investigate whether the overexpression of human heparanase protein (HPSE) alternative variant protein called T5 is caused by increased expression of miR-6814-5p in human renal cell carcinoma (RCC) cases. In addition, the possible correlation between the clinical parameters of RCC cases and the expression levels of T5 and miR-6814-5p was evaluated. Materials and Methods: T5 and miR-6814-5p expression analysis was performed on ready-to-use RCC cDNA panel by qPCR method. This panel included 48 cDNA samples obtained from tumor tissues of 10 stage-1, 5 stage-2, 13 stage-3 and 11 stage-4 RCC patients and normal kidney tissues from 9 healthy individuals. Results: There was no significant correlation between TNM stages, Fuhrman nuclear grade and histological type and miR-6814-5p and T5 expressions. The expression level of miR-6814-5p in RCC tumor tissues was about 8-fold higher and the T5 expression level about 5-fold higher than healthy controls. MiR-6814-5p and T5 expression changes were statistically significantly correlated with neutrophil/lymphocyte ratio of RCC cases. Conclusion: MiR-6814-5p may play a role in the formation mechanism of T5 in RCC.

___

  • 1. Cooper TA, Wan L, Dreyfuss G. RNA and disease. Cell. 2009;136:777–93.
  • 2. Barash U, Cohen V, Arvatz G, Gingis S, Levy F. A novel human heparanase splice variant, T5, endowed with protumorigenic characteristics. FASEB J. 2010;24:1239–48.
  • 3. Von M, Bernhart SH, Pansky A, Richter C, Kohl T, Deckert M et al. Beyond the 3′ UTR binding– microRNA-induced protein truncation via DNA binding. Oncotarget. 2018;9:32855.
  • 4. Saydam F, Değirmenci İ, Güneş HV. MicroRNAs and cancer. Dicle Med J. 2011;38:113-20.
  • 5. Ergün, S. In silico analysis of biomarker potentials of miRNA-mediated ceRNAs in prostate cancer. Dicle Med J. 2018;45:415-429.
  • 6. Wong N, Wang X. miRDB: an online resource for microRNA target prediction and functional annotations. Nucleic Acids Res. 2014;43:D146-52.
  • 7. Rennie W, Liu C, Carmack, CS, Wolenc A, Kanoria S, Lu J et al. STarMir: a web server for prediction of microRNA binding sites. Nucleic Acids Res. 2014;42:W114-8.
  • 8. Yang SF, Hsu HL, Chao TK, Hsiao CJ, Lin YF, Cheng CW. Annexin A2 in renal cell carcinoma: expression, function, and prognostic significance. Urol Oncol. 2015;33:22-e11.
  • 9. Ergün S, Altay DU, Güneş S, Büyükalpelli R, Karahan SC, Tomak L et al. Tr-KIT/c-KIT ratio in renal cell carcinoma. Mol Biol Rep. 2019;46:5287-94.
  • 10. Akgun S, Kucuksayan H, Tokgun O, Karagur ER, Can O, Akca H. miR-548a-3p, miR-548as-3p and miR-8078 are responsible for NSCLC. September 2016. 2016: 41th FEBS Congress, Ephesus/Kuşadası, TurkeyAt: Ephesus/Kuşadası, Turkey, Volume: 283.
  • 11. Yonemori K, Seki N, Idichi T, Kurahara H, Osako Y, Koshizuka K et al. The microRNA expression signature of pancreatic ductal adenocarcinoma by RNA sequencing: anti-tumour functions of the microRNA-216 cluster. Oncotarget. 2017;8:70097.
  • 12. Shuai L, Zifan H, Ziwei L, Chengwu Z, Lijian Y, Shaohua C et al. SNPs/mutations in BCL11B-3'UTR miRNA binding site of healthy humans and T-ALL patients. Chinese J Pathophysiology. 2018;07:1228- 1231.
  • 13. Sharma B, Randhawa V, Vaiphei K, Gupta V, Dahiya D, Agnihotri N. Expression of miR-18a-5p, miR-144- 3p, and miR-663b in colorectal cancer and their association with cholesterol homeostasis. J Steroid Biochem. 2021;208:105822.
  • 14. Ye Z, Sun B, Xiao Z. Machine learning identifies 10 feature miRNAs for lung squamous cell carcinoma. Gene. 2020;749:144669.
  • 15. Hu K, Lou L, Ye J, Zhang S. Prognostic role of the neutrophil–lymphocyte ratio in renal cell carcinoma: a meta-analysis. BMJ Open. 2015;5:e006404.
  • 16. Chen P, Zhang Z, Chen X. Overexpression of PKMYT1 facilitates tumor development and is correlated with poor prognosis in clear cell renal cell carcinoma. Med Sci Monit. 2020; 6:e926755-1.
Cukurova Medical Journal-Cover
  • ISSN: 2602-3032
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1976
  • Yayıncı: Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi
Sayıdaki Diğer Makaleler

Secondary carpal tunnel syndrome caused by space-occupying lesionlipoma

Orçin BOZKURT

Propofol infüzyonu sonrası doku nekrozu gelişen bir prematüre bebek olgusu

Şerif HAMİTOĞLU, Mehmet SATAR

Glioblastoma hücre hattında (U87) siklopamin ve temozolomid kombine tedavisinin miR-20a ekspresyonu üzerine etkileri

Leman SENCAR, Derviş Mansuri YILMAZ, Dilek GÖKTÜRK, Sema ÖZANDAÇ POLAT, Gülfidan COŞKUN, Dilek ŞAKER, Tuğçe SAPMAZ, Samet KARA, Alper ÇELENK, Sait POLAT

Primer perkütan koroner girişim uygulanan ST-segment yükseklikli miyokard infarktüslü hastalarda platelet/lenfosit oranı ile no-reflow oluşumu arasındaki ilişki

Çağlar ÖZMEN, Anıl AKRAY, Abdulkadir İLTAŞ, Pınar ÖZMEN YILDIZ, İbrahim YILDIZ, Halil AKTAŞ

Seröz borderline over tümörleri olan reprodüktif çağdaki hastalarda survivin immünoekspresyonunun klinikopatolojik önemi

Erdem ŞAHİN, Hulya AKGUN, Yusuf MADENDAĞ, Mehmet Mete KIRLANGIÇ, Erol KARAKAŞ, Nahit TOPALOĞLU

Saat çizme testinin çeşitli demans tiplerini ayırt etmedeki etkinliği

Gülcan GÖÇMEZ YILMAZ, Aynur OZGE, Mekselina ŞAHİN, Kahraman KIRAL

Sigmoid volvulus: Nörolojik hastalıklarla birliktelik

Sabri Selcuk ATAMANALP

Sınırda kişilik bozukluğunda serum ürik asit seviyeleri ve dürtüsellikle ilişkisi

Aslı KAZĞAN, Sevler YILDIZ, Osman KURT, Sevda KORKMAZ

Anestezi indüksiyonu ve anestezi ilişkili değişimlerin radiyal arter kanülasyon başarısına etkisi

Ayşegül TURGAY, Onat BERMEDE, Volkan BAYTAŞ, Asuman Hanife UYSALEL

Mizaç özelliklerinin invaziv karyotip testlerini seçme kararları üzerine olan etkisi

Erol ARSLAN, Gökçe Naz KÜÇÜKBAŞ, Çiğdem AKCABAY, Duru Saygin GÜLBAHAR, Mete SUCU