FATİH YILDIRIM, SELÇUK ÖZDEMİR, AHMET YILDIZ

Koçaş Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca (Holştayn) Sığırlarda Bazı Süt Verimi Özellikleri ve İlişkili Genlerin Ekspresyonu

Bu çalışmanın amacı Aksaray Koçaş Tarım İşletmesi şartlarındakiSiyah Alaca sığırlarının bazı süt verimi özellikleri ve süt verimi ileilişkili genlerin mRNA transkript seviyelerinin incelenmesi ve bazıçevre faktörlerinin etkilerinin araştırılmasıdır. Araştırmamateryalini 2009-2015 yılları arasında Koçaş Tarım İşletmesindebulunan toplam 324 baş Siyah Alaca ırkı sığırın, 1377 laktasyona ait3452 kontroldeki süt verimi kaydı ile tüm hayvanlardan alınan kanörnekleri oluşturmuştur. Süt verimi özellikleri üzerine çevrefaktörlerinin etkilerini değerlendirmede en küçük kareler metodukullanılmıştır. Süt verimi ile ilişkili olan ATF3, CDKN1A ve PRLgenlerine ait ifade düzeyleri qRT-PCR ile belirlenmiştir. En küçükkareler ortalamaları 100, 200 ve 305 günlük süt verimi için sırasıyla2950.51±24.79 kg, 5594.28±45.09 kg, 7923.28±80.92 kg; Laktasyon sütverimi, laktasyon süresi ve ortalama günlük süt verimi için sırasıyla,7700.02±99.17 kg, 315.75±3.67 gün ve 24.91±0.2 kg bulunmuştur.Yüksek süt verimine sahip ineklerde ilgili genlerin ifade düzeyleri,düşük verime sahip ineklere göre yüksek düzeyde bulunmuştur.Araştırma bulgularına göre yıllar içerisinde Siyah Alaca ineklerin sütverimini arttırmak için yapılan işlemlerin genel olarak olumlu yöndeolduğu ve ATF3, CDKN1A ve PRL genlerinin, süt verimini arttırmayayönelik yapılacak markör destekli seleksiyon ve ıslah çalışmalarınaolumlu yönde katkı sağlayacağı sonucuna varılmıştır.

Some Milk Yield Traits and Related Gene Expressions of Holstein Cattle Raised in Koçaş Agricultural Enterprise

The aim of this study was to investigate some milk production traits and milk production related gene mRNA transcript levels of Holstein cows in the conditions of Aksaray Koçaş agricultural enterprise and to investigate the effects of some environmental factors. Total 1349 milk yield record from 1377 lactation and blood samples of 324 Holstein cows raising in Koçaş agriculture enterprise between 2009- 2015 years were used. The least squares method was used to assess the effects of environmental factors on milk characteristics. Milk production related ATF3, CDKN1A, and PRL gene expressions were identified by using qRT-PCR. The least squares means for milk yield of 100, 200 and 305 days were 2950.51 ± 24.79 kg, 5594.28 ± 45.09 kg and 7923.28 ± 80.92 kg, respectively. Lactation milk yield, lactation period and average daily milk yield was found to be 7700.02 ± 99.17 kg, 315.75 ± 3.67 days and 24.91 ± 0.2 kg, respectively. According to qRT-PCR results, related gene expressions were up-regulated in high milk production cows compare to low milk production cows. According to the findings, it has been concluded that, Holstein cows are generally positive to improve milk yield over the years and ATF3, CDKN1A and PRL genes contribute positively to marker-assisted selection and breeding programs to improve milk yield.

PDF

___

Akkaş Ö, Şahin EH 2008. Holştayn Irkı Sığırlarda Bazı Verim Özellikleri. Kocatepe Vet J, 1(1): 25-31.
Akman N, Ulutaş Z, Efil H, Biçer S 2001. Gelemen Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Sürüsünde Süt ve Döl Verimi Özellikleri. Atatürk Üniv Ziraat Fak Derg, 32(2): 173-179.
Allan AL, Albanese C, Pestell RG, LaMarre J 2001. Activating Transcription Factor 3 Induces DNA Synthesis and Expression of Cyclin D1 in Hepatocytes. J Biol Chem, 276(29): 27272–27280.
Andersson L 2009. Genome-wide Association Analysis in Domestic Animals: A Powerful Approach for Genetic Dissection of Trait Loci. Genetica, 136(2): 341–349.
Anonim 2017a. Breeds of Livestock - Holstein Cattle. http://www.ansi.okstate.edu/breeds/cattle/holstein, (Erişim tarihi: 13.07.2017).
Anonim 2017b. Türkiye İstatistik Kurumu Hayvancılık İstatistikleri. http://www.tuik.gov.tr (Erişim tarihi: 13.07.2017).
Aytekin İ, Mammadova NM, Altay Y, Topuz D, Keskin İ 2016. Determination of The Factors Effecting Lactation Milk Yield of Holstein Friesian Cows by The Path Analysis. Selcuk J Agr Food Sci, 30(1): 44- 48.
Bakır G, Çetin M 2003. Reyhanlı Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Sığırlarda Süt ve Döl Verim Özellikleri. Turk J Vet Anim Sci, 27: 173- 180.
Bakır G, Kaygısız A, Çilek S 2009. Milk Yield Traits of Holstein Cattle Reared at Tahirova State Farm in Balikesir Province in Turkey. J Anim Vet Advances, 8(11): 2369-2374.
Bartek J, Lukas J 2001. Pathways Governing G1/S Transition and Their Response to DNA Damage. FEBS Lett, 490(3): 117–122.
Bayril T, Yılmaz O 2010. Kazova Vasfi Diren Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Sığırların Döl Verimi Özellikleri. YYU Vet Fak Derg, 21(3): 163- 167.
Bole-Feysot C, Goffn V, Edery M, Binart N 1998. Prolactin (PRL) and Its Receptor: Actions, Signal Transduction Pathways and Phenotypes Observed in PRL Receptor Knockout Mice. Endocr Rev, 19: 225-268.
Cole JB, Wiggans GR, Ma L, Sonstegard TS, Lawlor TJ Jr, Crooker BA, Van Tassell CP, Yang J, Wang S, Matukumalli LK 2011. Genome-Wide Association Analysis of Thirty One Production, Health, Reproduction and Body Conformation Traits in Contemporary U.S. Holstein cows. BMC Genomics, 12: 408.
Cui XG, Hou YL, Yang SH, Xie Y, Zhang SL, Zhang Y, Zhang Q, Lu XM, Liu GE, Sun DX 2014. Transcriptional Profiling of Mammary Gland İn Holstein Cows With Extremely Different Milk Protein and Fat Percentage Using RNA Sequencing. BMC Genomics, 15: 226.
Cura EÖ 2016. Trakya Bölgesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Süt Sığırlarında Döl ve Süt Verimlerinin Bazı Sistematik Faktörler Açısından Değerlendirilmesi. NKÜ. Fen Bil. Ens., Zootekni ABD, Yüksek Lisans Tezi, Tekirdağ.
Çilek S 2009. Milk Yields Traits of Holstein Cows Raised at Polatlı State Farm in Turkey. J Anim Vet Advances, 8(1): 6-10.
Dadousis C, Pegolo S, Rosa GJM, Bittante G, Cecchinato A 2017. Genome-Wide Association And Pathway-Based Analysis Using Latent Variables Related To Milk Protein Composition And Cheesemaking Traits in Dairy Cattle. Journal of Dairy Science, 10.3168/jds.2017-13219.
Dahl GE 2008. Effects of Short Day Photoperiod on Prolactin Signaling in Dry Cows: A Common Mechanism Among Tissues and Environments? J Anim Sci, 86: 13.
Dong CH, Song XM, Zhang L, Jiang JF, Zhou JP, Jiang YQ 2013. New Insights into the Prolactin-RsaI (PRL-RsaI) Locus in Chinese Holstein Cows and Its Effect on Milk Performance Traits. Genet Mol Res, 12 (4): 5766-5773.
Duru S, Tuncel E 2002. Koçaş Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah-Alaca Sığırların Süt ve Döl Verimleri Üzerine Bir Araştırma (1. Süt Verim Özellikleri). Turk J Vet Animal Sci, 26: 97-101.
Elo KT, Vilkki J, de Koning DJ, Velmala RJ, MakiTanila AV 1999. A Quantitative Trait Locus for Live Weight Maps to Bovine Chromosome 23. Mamm Genome,10(8): 831–835.
Erdem H, Atasever S, Kul E 2007. Gökhöyük Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Sığırların Süt ve Döl Verim Özellikleri 1. Süt Verim Özellikleri. OMÜ Zir Fak Derg, 22(1): 41-46.
Georges M, Nielsen D, Mackinnon M, Mishra A, Okimoto R, Pasquino AT, Sargeant LS, Sorensen A, Steele MR, Zhao X 1995. Mapping Quantitative Trait Loci Controlling Milk Production in Dairy Cattle by Exploiting Progeny Testing. Genetics, 139(2): 907–920.
Gu M, Cosenza G, Nicolae I, Bota A, Guo Y, Di Stasio L, Pauciullo A 2017. Transcript Analysis at DGAT1 Reveals Different mRNA Profiles in River Buffaloes with Extreme Phenotypes for Milk Fat. J Dairy Sci, 0022-0302(17): 30731-30732.
Gürses M, Bayraktar M 2012. Türkiye’de Farklı Bölgelerde Yetiştirilen Holştayn Sığırlarda Bazı Süt ve Döl Verimi Özellikleri. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 18(2): 273-280.
Han B, Liang W, Liu L, Li Y, Sun D 2017. Determination of Genetic Effects of ATF3 and CDKN1A Genes on Milk Yield and Compositions in Chinese Holstein Population. BMC Genetics, 18: 47.
Invernizzi G, Naeem A, Loor JJ 2012. Short Communication: Endoplasmic Reticulum Stress Gene Network Expression in Bovine Mammary Tissue During the Lactation Cycle. J Dairy Sci, 95(5): 2562–2566.
Invernizzi G, Thering BJ, McGuire MA, Savoini G, Loor JJ 2010. Sustained Upregulation of StearoylCoA Desaturase in Bovine Mammary Tissue With Contrasting Changes in Milk Fat Synthesis And Lipogenic Gene Networks Caused by Lipid Supplements. Funct Integr Genomics, 10(4): 561– 575.
Kaygısız A, Yılmaz İ, Koşum S 2017. Şanlıurfa İlinde Siyah Alaca Irkı Sığırların Yetiştirici Şartlarında Bazı Adaptasyon Özellikleri. KSÜ Doğa Bil Derg, 20(2): 133-136.
Kaygisiz A 2013. Estimation of Genetic Parameters and Breeding Values for Dairy Cattle Using Testday Milk Yield Records. J Anim Plant Sci, 23: 345- 349.
Keser M 2016. Tekirdağ İlinde Farklı İşletme Büyüklüklerinde Yetiştirilen Siyah Alaca Süt Sığırlarının Döl Ve Süt Verim Özelliklerin Belirlenmesi. NKÜ. Fen Bil. Ens., Zootekni ABD, Yüksek Lisans Tezi, Tekirdağ.
Koçak S, Tekerli M, Özbeyaz C, Demirhan İ 2008. Lalahan Merkez Hayvancılık Araştırma Enstitüsünde Yetiştirilen Holştayn, Esmer ve Simental Sığırlarda Bazı Verim Özellikleri. Lalahan Hay Araşt Enst Derg, 48(2): 51-57.
Koçak S, Yüceer B, Uğurlu M, Özbeyaz C 2007. Bala Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Holştayn İneklerde Bazı Verim Özellikleri. Lalahan Hay Araşt Enst Derg, 47(1): 9-14.
Le Provost F, Leroux C, Martin P, Gaye P, Djiane J 1994. Prolactin Gene Expression in Ovine and Caprine Mammary Gland. Neuroendocrinology, 60: 305–313
Li RW, Capuco AV 2008. Canonical Pathways And Networks Regulated by Estrogen in The Bovine Mammary Gland. Funct Integr Genomics, 8(1): 55– 68.
Livak KJ, Schmittgen TD 2001. Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and The 2 (-Delta Delta C(T)) Method. Methods, 25: 402–408.
Melendez P, Pinedo PJ 2015. Effect of Dry Beet Pulp on Milk Yield and Milk Composition in Chilean Holstein cows. J Appl Anim Res, 43(3): 261-265.
Nguyen P, Leray V, Diez M, Serisier S, Le Bloc'h J, Siliart B, Dumon H 2008. Liver Lipid Metabolism. J Anim Physiol Anim Nutr (Berl), 92(3): 272–283.
Orhan H, Kaşıkçı D 2002. Path, Korelasyon ve Kısmi Regresyon Katsayılarının Karşılaştırılmalı Olarak İncelenmesi. Hayvansal Üretim, 43(2): 68-78.
Özçakır A, Bakır G 2003. Tahirova Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Sığırların Döl ve Süt Verim Özellikleri (1. Süt Verim Özellikleri). Atatürk Üniv Ziraat Fak Derg, 34(3): 145-149.
Özçelik M, Arpacık R 2000. Siyah Alaca Sığırlarda Laktasyon Sayısının Süt ve Döl Verimine Etkisi. Turk J Vet Animal Sci, 24: 39-44.
Özkök H, Uğur F 2007. Türkiye’de Yetiştirilen Esmer ve Siyah Alaca Sığırlarda Süt Verimi, İlk Buzağılama Yaşı ve Servis Periyodu. Atatürk Üniv Ziraat Fak Derg, 38(2): 143-149.
Parlak N 2008. Afyonkarahisar İlinde Yetiştirilen Siyah Alaca İneklerin Süt ve Döl Verimleri Üzerine Farklı Çevre Faktörlerinin Etkisi. AKÜ. Sağlık Bil. Ens, Zootekni ABD, Yüksek Lisans Tezi, Afyonkarahisar.
Patel JB, Chauhan JB 2017. Polymorphism of the Prolactin Gene and Its Relationship with Milk Production in Gir and Kankrej Cattle. J Nat Sci Biol Med, 8(2):167-170.
Schennink A, Bovenhuis H, Leon-Kloosterziel KM, van Arendonk JA, Visker MH 2009. Effect of Polymorphisms in the FASN, OLR1, PPARGC1A, PRL and STAT5A Genes on Bovine Milk-Fat Composition. Anim Genet, 40(6): 909–916.
Sehar Ö, Özbeyaz C 2005. Orta Anadoludaki Bir İşletmede Holştayn Irkı Sığırlarda Bazı Verim Özellikleri. Lalahan Hay Araşt Enst Derg, 45(1): 9- 19.
Singh K, Phyn CVC, Reinsch M, Dobson JM, Oden K, Davis SR, Stelwagen K, Henderson HV, Molenaar AJ 2017. Temporal and Spatial Heterogeneity in Milk and Immune-related Gene Expression During Mammary Gland Involution in Dairy Cows. J Dairy Sci, 0022-0302(17): 30663.
Şahin A, Ulutaş Z 2010. Polatlı Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca İneklerde Süt ve Döl Verim Özellikleri. Anadolu Tarım Bilim Derg, 25(3): 202- 212.
Şekerden Ö 2002. Siyah Alaca Sığırlarda Süt, Yağ, Protein, Kuru Madde Verimleri, Süt Komponentleri ile Bazı Döl Verimi Özellikleri Arasındaki İlişkiler. Atatürk Üniv Ziraat Fak Derg, 33(3): 293-296.
Uslucan B 2017. Siyah Alaca Sığırlarda Süt Ve Döl Verim Özellikleri İle Bazı Davranış Parametreleri Üzerine Etkili Çevre Faktörlerinin Belirlenmesi. ÇÜ. Fen Bil. Ens., Zootekni ABD, Doktora Tezi, Adana.
Yue SJ, Zhao YQ, Gu XR, Yin B, Jiang YL, Wang ZH, Shi KR 2017. A Genome-Wide Association Study Suggests New Candidate Genes For Milk Production Traits in Chinese Holstein Cattle. Anim Genet, 10.1111/age.12593.