Avcı Bakteriler
Avcılık canlılığın her ölçeğinde görülebilen bir etkileşim biçimidir. Bakteriyofajların da dahil edilmesi durumunda; mikronlar ile ölçülen canlılardan metreler ile ölçülen hayvanlara kadar uzanan bir avcı skalası oluşur. Ökaryot ve prokaryot canlıların gösterdiği avcılık modelleri arasında yatan temel fark, prokaryot hücrelerin avlarını yutamamasından kaynaklanır. Avcı bakteriler ilk kez 1962 yılında Heinz Stolp tarafından; küçük, yüksek motiliteye sahip, zorunlu avcı, Gram negatif bakteriler olarak tanımlanmıştır. Bu bakteriler, hücreye tutunma ve hücreyi lize etme yeteneğine sahiptir. Doğada yaygın olarak bulunan avcı bakterilerin etki mekanizmaları tam olarak keşfedilememiş ve bu bakterilerin tamamı filogenetik olarak sınıflandırılamamıştır. İn-vivo ve in-vitro ortamlarda yapılan çalışmalarda avcı bakterilerin geniş bir bakteri skalasına etki gösterdiği bulunmuştur. Bu derlemede avcı bakterilerin filogenetik olarak sınıflandırılması, temel özellikleri ve etki mekanizmaları ile avcı bakteriler kullanılarak yapılan bazı çalışmalar anlatılmıştır.
___
- 1. Atterbury RJ, Hobley L, Till R, Lambert C, Capeness MJ,
Lerner TR, Sockett RE, (2011). Effects of orally administered
Bdellovibrio bacteriovorus on the well-being and
Salmonella colonization of young chicks. Appl Environ Microbiol.
77(16), 5794–5803.
- 2. Boileau, M. J., Clinkenbeard, K. D., & Iandolo, J. J. (2011).
Assessment of Bdellovibrio bacteriovorus 109J killing of
Moraxella bovis in an in vitro model of infectious bovine
keratoconjunctivitis. Canadian Journal of Veterinary Research.
75(4), 285–291.
- 3. Casida LE Jr (1980). Bacterial predators of Micrococcus luteus
in soil. Appl Environ Microbiol. 39, 1035–1041.
- 4. Chanyi R.M (2014). Cell Biology of the Entry of Bdellovibrio
and Like Organisms. Graduate Program in Microbiology
and Immunology, The University of Western Ontario, PhD
Thesis, Canada.
- 5. Dworkin M (1999). Fibrils as extracellular appendages of
bacteria: Their role in contactmediated cell-cell interactions
in Myxococcus xanthus. Bioessays. 21, 590–595.
- 6. Gilligan PH, Lum G, VanDamme PAR, Whittier S (2003).
Burkholderia, Stenotrophomonas, Ralstonia, Brevundimonas,
Comamonas, Delftia, Pandoraea, and Acidivorax. eds.
Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, et al. In: Manual of
Clinical Microbiology Eighth edition. ASM Press, Washington,
DC. p.729–748
- 7. Jurkevitch E (2007). A brief history of short bacteria: A
chronicle of Bdellovibrio (and like organisms) research.
eds. Jurkevitch, E. In Predatory Prokaryotes-Biology, Ecology
and Evolution. Springer, Verlag Heidelberg, Germany
p.20-40
- 8. Lambina VA, Afinogenova AV, Romai Penabad S, Konovalona
SM, Pushkareva AP (1982). Micavibrio admirandus
gen. et sp. nov. Mikrobiologiya. 51, 114–117.
- 9. Muñoz-Dorado J, Marcos-Torres FJ, García-Bravo E, Moraleda-
Muñoz A, Pérez J (2016). Myxobacteria: Moving,
killing, feeding, and surviving together. Frontiers in Microbiology.
7, 781.
- 10. Pasternak Z, Ben Sasson T, Cohen Y, Segev E, Jurkevitch E
(2015). A new comparative-genomics approach for defining
phenotype-specific indicators reveals specific genetic markers
in predatory bacteria. PLoS ONE. 10(11), e0142933.
- 11. Reichenbach H, Gerth K, Irschik H, Kunze B, Hofle G
(1988). Myxobacteria: A source of new antibiotics. Trends
Biotechnol. 6, 115–121.
- 12. Reichenbach H (2001). The genus Lysobacter. Eds: Dworkin
M et al, In: The Prokaryotes: An Evolving Electronic
Resource for the Microbiological Community. Springer,
Berlin Heidelberg, Germany.
- 13. Romanowski EG, Stella NA, Brothers KM, Yates KA, Funderburgh
ML, Funderburgh JL, … Shanks RMQ (2016).
Predatory bacteria are nontoxic to the rabbit ocular surface.
Scientific Reports. 6, 30987.
- 14. Shatzkes K, Singleton E, Tang C, Zuena M, Shukla S,
Gupta S, Kadouri DE (2016). Predatory bacteria attenuate
Klebsiella pneumoniae burden in rat lungs. mBio. 7(6),
e01847–16.
- 15. Wang Z, Kadouri DE, Wu M (2011). Genomic insights into
an obligate epibiotic bacterial predator: Micavibrio aeruginosavorus
ARL 13. BMC Genomics. 12, 453.
- 16. Willis, A. R., Moore, C., Mazon-Moya, M., Krokowski, S.,
Lambert, C., Till, R., … Sockett, R. E. (2016). Injections of
Predatory Bacteria Work Alongside Host Immune Cells to
Treat Shigella Infection in Zebrafish Larvae. Current Biology.
26(24), 3343–3351.
- 17. Yutani M, Taniguchi H, Borjihan H, Ogita A, Fujita K, Tanaka
T (2011). Alliinase from Ensifer adhaerens and its use for
generation of fungicidal activity. AMB Express. 1, 2.
- 18. Zer Y, Karaoğlan İ, Çevik S, Erdem M (2009). Stenotrophomonas
maltophilia suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının irdelenmesi.
Gaziantep Üniversitesi Klinik Dergisi. 22, 21-24.