Miyelodisplastik sendrom hastalığında P53 polimorfizmlerinin önemi

Amaç: Miyelodisplastik sendrom (MDS) akut miyeloid lösemiye dönüşüm riski yüksek olan, artmış apoptozis ve azalmış hematopoez oranlarıyla karakterize klonal bir hastalıktır. MDS patogenezi tam olarak açıklanabilmiş değildir. Olguların ~%50' si anormal karyotiptedir ve bu oran ikincil MDS' de %80 civarındadır. P53 proteini kök hücre homeostazının önemli düzenleyicisidir ve hücre döngüsünün düzenlenmesi, apoptotik ile enflamatuar yanıt gibi bir dizi hücresel olayda yer alır. Genomik bütünlüğün korunmasında da önemli görevleri bulunan TP53 geni kanserlerde sıklıkla mutasyona uğramaktadır; ancak, mutasyonlarının yanında bazı gen polimorfizmlerinin de kanserle ilişkili oldukları bilinmektedir. Çalışmadaki amacımız, dört yaygın p53 tek nükleotid polimorfizminin MDS’ deki yaygınlıklarını ve hastalık gelişimi üzerine etkilerini belirlemektir. Bu amaçla, Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Dahiliye Anabilim Dalı Hematoloji Bilim Dalı' nda MDS tanısı ile takip edilen ya da yeni tanı almış 100 olgu çalışmaya dahil edildi. Gereç ve Yöntem: MDS’li olguların periferik kan lökositlerinden izole edilen DNA’lar gerçek-zamanlı PCR yöntemiyle çalışılarak, p53 polimorfizmleri (rs35163653, rs35993958, rs1800371, rs1042522) uygun probların kullanımıyla ve erime eğrisi analizleriyle belirlendi. Bulgular: İncelenen dört yaygın p53 polimorfizmin arasında özellikle rs1042522 polimorfizmindeki atasal olmayan G alelinin MDS’li olgularda artmış olduğu gözlenmiştir (C:%30.3; G:%69.7). Fonksiyonel olduğu, yani sentez edilen proteinin fonksiyonunu etkilediği bilinen bu polimorfizmde 417. pozisyonundaki C nukleotidinin G’ye transisyonu (C>G), proteinin 72. pozisyonundaki prolin amino asidinin arjinine (P72R) kodlanmasına yol açmaktadır. Sonuç: Çalışmamız, MDS hastalık grubunda rs35163653, rs35993958, rs1800371 ve rs1042522 p53 polimorfizmlerinin araştırıldığı ilk çalışmadır. Bunlardan, rs1042522 polimorfizminin kansere yatkınlık ve duyarlılıkla ilişkili olduğu yapılan diğer bazı çalışmalarla gösterilmiş olması nedeniyle, MDS hastalığı için de yüksek risk oluşturabileceği düşünülmektedir. Sonuç olarak, MDS hastalığı için gerçekleştirilen bu çalışmanın daha geniş bir olgu grubuyla tekrarlanmasıyla rs1042522 polimorfizmi ileride MDS teşhisinde belirteç olarak kullanılabilecektir.

Importance of p53 gene polymorphisms in myelodysplastic syndrome disease

Aim: Myelodysplastic syndrome (MDS) is a clonal disease with a high risk of conversion to acute myeloid leukemia, characterized by increased apoptosis and decreased hematopoiesis. The pathogenesis of MDS has not been fully explained. ~50% of cases have abnormal karyotype and this rate is around 80% in secondary MDS. The p53 protein is an important regulator of stem cell homeostasis and is involved in a range of cellular events such as cell cycle regulation, apoptotic and inflammatory response. The TP53 gene, which has important roles in maintaining genomic integrity, is frequently mutated in cancers; however, some gene polymorphisms are known to be associated with cancer, as well as mutations. Our aim in the study is to determine the prevalence of four common p53 single nucleotide polymorphisms in MDS and their effects on disease development. For this reason, 100 cases followed up with the diagnosis of MDS or newly diagnosed in Ege University Faculty of Medicine, Department of Internal Medicine, Department of Hematology were included in the study. Materials and Methods: DNAs isolated from peripheral blood leukocytes of MDS cases were studied by real-time PCR method, p53 polymorphisms (rs35163653, rs35993958, rs1800371, rs1042522) were determined by using appropriate probes and melting curve analysis. Results: Among the four common p53 polymorphisms examined, especially the non-ancestral G allele in the rs1042522 polymorphism was observed to be increased in MDS cases (C: 30.3%; G: 69.7%). In this polymorphism, which is known to be functional, that is, affecting the function of the synthesized protein, the transition of the C nucleotide at position 417 to G (C>G) causes the coding of the amino acid proline at position 72 of the protein to arginine (P72R). Conclusion: Our study is the first to investigate the p53 polymorphisms of rs35163653, rs35993958, rs1800371 and rs1042522 in the MDS disease group. Of these, rs1042522 polymorphism has been shown to be associated with cancer susceptibility and susceptibility, and it is thought that it may pose a high risk for MDS disease as well. In conclusion, rs1042522 polymorphism may be used as a marker in the diagnosis of MDS in the future by repeating this study for MDS disease with a larger case group.

___

  • 1. Kim E, Viatour P. Hepatocellular carcinoma: Old friends and new tricks. Experimental & Molecular Medicine 2020; 52: 1898-907.
  • 2. Yang H-C, Kao J-H. Persistence of hepatitis b virus covalently closed circular DNA in hepatocytes: Molecular mechanisms and clinical significance. Emerging Microbes & Infections 2014; 3: 1-7.
  • 3. Allweiss L, Dandri M. The role of cccdna in hbv maintenance. Viruses 2017; 9: 156. 4. Zhou F, Shang W, Yu X, Tian J. Glypican-3: A promising biomarker for hepatocellular carcinoma diagnosis and treatment. 2018; 38: 741-67.
  • 5. Anatelli F, Chuang ST, Yang XJ, Wang HL. Value of glypican 3 immunostaining in the diagnosis of hepatocellular carcinoma on needle biopsy. Am J Clin Pathol 2008; 130: 219-23.
  • 6. Sharov AA, Schlessinger D, Ko MS. Exatlas: An interactive online tool for meta-analysis of gene expression data. J Bioinform Comput Biol 2015; 13: 1550019.
  • 7. Atay S. Integrated transcriptome meta-analysis of pancreatic ductal adenocarcinoma and matched adjacent pancreatic tissues. PeerJ 2020; 8: e10141.
  • 8. Deng YB, Nagae G, Midorikawa Y, Yagi K, Tsutsumi S, Yamamoto S, et al. Identification of genes preferentially methylated in hepatitis c virus-related hepatocellular carcinoma. Cancer Sci 2010; 101: 1501-10.
  • 9. Wang H, Huo X, Yang XR, He J, Cheng L, Wang N, et al. Stat3-mediated upregulation of lncrna hoxd-as1 as a cerna facilitates liver cancer metastasis by regulating sox4. Mol Cancer 2017; 16: 136.
  • 10. Wang SM, Ooi LL, Hui KM. Identification and validation of a novel gene signature associated with the recurrence of human hepatocellular carcinoma. Clin Cancer Res 2007; 13: 6275-83.
  • 11. Melis M, Diaz G, Kleiner DE, Zamboni F, Kabat J, Lai J, et al. Viral expression and molecular profiling in liver tissue versus microdissected hepatocytes in hepatitis b virus-associated hepatocellular carcinoma. J Transl Med 2014; 12: 230.
  • 12. Roessler S, Jia HL, Budhu A, Forgues M, Ye QH, Lee JS, et al. A unique metastasis gene signature enables prediction of tumor relapse in early-stage hepatocellular carcinoma patients. Cancer Res 2010; 70: 10202-12.
  • 13. Wang Y-L, Zhu Z-J, Teng D-H, Yao Z, Gao W, Shen Z-Y. Glypican-3 expression and its relationship with recurrence of hcc after liver transplantation. World journal of gastroenterology 2012; 18: 2408-14.
  • 14. Maurel M, Jalvy S, Ladeiro Y, Combe C, Vachet L, Sagliocco F, et al. A functional screening identifies five micrornas controlling glypican-3: Role of mir-1271 down-regulation in hepatocellular carcinoma. 2013; 57: 195-204.
  • 15. Lü Z-L, Luo D-Z, Wen J-M. Expression and significance of tumor-related genes in hcc. World journal of gastroenterology 2005; 11: 3850-4.
  • 16. Pan C, Wang X, Chen W, Tao C, Xu X, Jin L, et al. Reevaluation of glypican-3 as a prognostic marker in hcc using x-tile software. Med Oncol 2015; 32: 359.
  • 17. Fu S-J, Qi C-Y, Xiao W-K, Li S-Q, Peng B-G, Liang L-J. Glypican-3 is a potential prognostic biomarker for hepatocellular carcinoma after curative resection. Surgery 2013; 154: 536-44.
  • 18. Jeon Y, Kim H, Jang ES, Hong S, Kim JW, Yoon Y-S, et al. Expression profile and prognostic value of glypican-3 in post-operative south korean hepatocellular carcinoma patients. APMIS 2016; 124: 208-15.
  • 19. Cui X, Li Z, Gao PJ, Gao J, Zhu JY. Prognostic value of glypican-3 in patients with hbv-associated hepatocellular carcinoma after liver transplantation. Hepatobiliary Pancreat Dis Int 2015; 14: 157-63.
  • 20. Ning S, Bin C, Na H, Peng S, Yi D, Xiang-hua Y, et al. Glypican-3, a novel prognostic marker of hepatocellular cancer, is related with postoperative metastasis and recurrence in hepatocellular cancer patients. Molecular Biology Reports 2012; 39: 351-7.
  • 21. Liang J, Ding T, Guo ZW, Yu XJ, Hu YZ, Zheng L, Xu J. Expression pattern of tumour-associated antigens in hepatocellular carcinoma: Association with immune infiltration and disease progression. British journal of cancer 2013; 109: 1031-9.
  • 22. Moudi B, Heidari Z, Mahmoudzadeh-Sagheb H. Meta-analysis and systematic review of prognostic significance of glypican-3 in patients with hepatitis b-related hepatocellular carcinoma. Virusdisease 2019; 30: 193-200.
Ege Tıp Dergisi-Cover
  • ISSN: 1016-9113
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1962
  • Yayıncı: Ersin HACIOĞLU
Sayıdaki Diğer Makaleler

Kraniyal manyetik rezonans görüntüleme istenilen olguların retrospektif özellikleri

Hilal AYDIN, Selçuk YAZICI, Ezgi ÖZDEN, Gülen DEMİRPOLAT

Mide kanserli hastaların demografik özelliklerinin sağ kalıma etkisi

Andaç KARADENİZ, Mehmet BİLİCİ, Melih ŞİMŞEK

Nadir görülen bir pnömotoraks olgusu: katamenial pnömotoraks

Ufuk ÇAĞIRICI, Hasan YAVUZ, Ayşegül ÇEVİK ERGÖNÜL, Tevfik İlker AKÇAM

Oldukça nadir bir koroner arter anomalisi: Non-koroner sinüsten çıkan sol ana koroner arter

Cihat PINARCI, Selen BAYRAKTAROĞLU

Nüks gelişen vulvar skuamöz hücreli kanser hastalarında prognostik faktörler ve nüksün toplam sağ kalıma etkisi

Fatih DİNÇER, Gülşah Selvi DEMİRTAŞ, Mehmet GÖKÇÜ, Muzaffer SANCI

Endometrium kanserli obez hastalarda laparoskopik ve açık cerrahinin karşılaştırılması

Ceren SANCAR, Nuri YILDIRIM, Ahmet BİLGİ, Sevki GÖKÜLÜ, Levent AKMAN, Mustafa Coşan TEREK, Ahmet Aydın ÖZSARAN

Suriyeli mülteci ve türk kadınlarının perinatal eğilimleri ve obstetrik sonuçları

Hande İLERİ, Suna YILDIRIM KARACA, Ayşe Rabia ŞENKAYA, Alper İLERİ, Can ATA

Fuchs heterokromik iridosiklit hastalarında kornea biyomekaniği ve kornea değerlendirilmesi

Semir YARIMADA, Cumali DEĞİRMENCİ, Melis PALAMAR, Suzan GÜVEN YILMAZ, Halil ATEŞ

In vitro ve in silico analizi ile metforminin meme tümörü hücrelerinde protein profili üzerindeki etkinliği

Güven YENMİŞ, Nail BEŞLİ

Akut iskemik serebrovasküler olay geçiren hastalarda aritmi sıklığının holter elektrokardiyografi ile değerlendirilmesi

Tuncay GÜZEL, Mehmet KIŞ