HLA PROTEİNLERİNİN GNM METODU İLE DİNAMİK KARAKTERİZASYONU

Biyolojik sistemler, birbirleri ile sürekli bilgi alışverişinde bulunan ağyapılar, biyolojik moleküller de bu yapının temel noktaları olarak tanımlanabilirler. Yaşamsal süreklilik açısından sistemin herhangi bir noktasında oluşacak bir sinyalin, hücreler arasında, hücre içinde veya hücre dışından hücre içine iletilmesi büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada, sistematik bir çerçevede HLA (İnsan Lökosit Antijenleri-Human Leukocyte Antigen) molekülleri üzerinde çalışılmıştır. HLAlar hücrelere yapışan yabancı proteinleri tanıyarak kendinden olan ve olmayanı ayırmakta kullanılır, bağışıklık sisteminin temelini oluştururlar. Çalışma kapsamında hesapsal bir yöntem olan Gaussian Ağ yapı modeli uygulanarak HLA sınıf 1 grubuna mensup yapıların yüksek frekanslarda öne çıkan bölgeleri tespit edilmiştir. Tüm moleküllerde hızlı modlarda aynı rezidülerin ön plana çıktığı görülmekte olup bu rezidülerin arasında bir iletişim patikası olduğu düşünülmektedir

DYNAMIC CHARACTERIZATION OF HLA MOLECULES BY GNM

Biological systems communicate within a network and biological molecules are the main building blocks of this network. For the continuation of life, it is necessary for the signals to be transmitted within and among the cells in a living organism. This study is conducted on HLA (Human Leukocyte Antigen) structures in a systematic manner. HLAs having a role in immune system recognize the foreign substances and attack them. By employing Gaussian Network Model (GNM) on HLA class I molecules, the residues that are energetically active at high frequency modes are detected. In all the molecules, same residues are observed to have the highest fluctuating profile, which are thought to form an interaction network
Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fen ve Mühendislik Dergisi-Cover
  • ISSN: 1302-9304
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Başlangıç: 1999
  • Yayıncı: Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi
Sayıdaki Diğer Makaleler

DOKUMA KUMAŞLARDA ULTRASONİK DİKİŞ ÜZERİNE BİR ARAŞTIRMA

Ayşe Şevkan MACİT, Bahar TİBER

SOĞUK METAL TRANSFER (CMT) VE DARBELİ SOĞUK METAL TRANSFER (DARBELİ CMT) KAYNAK İŞLEMLERİ İLE BİRLEŞTİRİLMİŞ AA5754 ALÜMİNYUM ALAŞIMININ MİKROYAPI VE MEKANİK ÖZELLİKLERİNİN KARŞILAŞTIRMALI OLARAK İNCELENMESİ

Fatih KAHRAMAN, Gökçe Mehmet GENÇER, Coşkun YOLCU, Ayça Demirer KAHRAMAN, Mehmet Ege DİLBAZ

BEYTİTEPE KİREÇTAŞI’NIN (BORNOVA FLİŞ ZONU) GÖKDERE ALANINDA (İZMİR, BATI TÜRKİYE) PLANKTONİK FORAMİNİFER BIYOSTRATİGRAFİSİ VE MİKROFASİYES ÖZELLİKLERİ

Bilal SARI

MFI Tipi Zeolit Membranların Yüksek Sıcaklıkta Geri Döngülü Akış Sisteminde Sentezi

BERNA TOPUZ, Aylin ÖNDER SAKA, HALİL KALIPÇILAR

Kendiliğinden Yerleşen Beton Davranışının Hesaplamalı Akışkanlar Dinamiği İle Benzetimi

CENK KARAKURT, AHMET OZAN ÇELİK, VOLKAN KİRİÇÇİ, Cem YILMAZER

Sayısal Görüntü İşleme ile Titreşim Yer Değiştirmelerinin Ölçümü ve Modal Parametre Tayini

YILDIRIM SERHAT ERDOĞAN

Beytitepe Kireçtaşı’nın (Bornova Fliş Zonu) Gökdere Alanında (İzmir, Batı Türkiye) Planktonik Foraminifer Biyostratigrafisi ve Mikrofasiyes Özellikleri

BİLAL SARI

KANSER ALT-TÜRLERİNİN SINIFLANDIRILMASI İÇİN RNA-SEKANSLAMA VE RPPA VERİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

Zerrin IŞIK

Determination of Tetracycline Residues After Ionic Liquid Assisted Dispersive Liquid Liquid Microextraction in Dairy Foods

HAYRİYE MİNE ANTEP, Melis KAYNAKER, MELEK MERDİVAN

SURFACE POTENTIAL CORRELATIONS WITH IRREGULAR PLASTIC DEFORMATION

AHMET YILMAZ