KAN KÜLTÜRLERİNDE ÜREYEN MİKROORGANİZMALAR VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLAR
Kan dolaşımı enfeksiyonları en sık karşılaşılan invazif enfeksiyonlardan biridir. Bu çalışmanın amacı kan dolaşımı enfeksiyonlarının ampirik tedavisinin belirlenmesinde klinisyenlere yol göstermek için kan kültürlerinden üreyen mikroorganizma türlerini ve antibiyotik duyarlılıklarını belirlemektir. Ocak 2016-Aralık 2017 tarihleri arasında tanımlanan 621 izolat çalışmaya dahil edilmiştir. Kan kültürü örnekleri BACT/ALERT 3D (bioMérieux, Marcy I’Etoile, Fransa) otomatize sistemi ile inkübe edilmiştir. Üreyen mikroorganizmaların identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılıkları VITEK 2 cihazı (bioMérieux, Fransa) ile yapılmıştır. Çalışmaya dahil edilen 621 kan kültürü örneğinin 399’unda (% 64.3) Gram negatif bakterilerin, 192’sinde (% 30.9) Gram pozitif bakterilerin, 30’unda (% 4.8) ise mayaların üredikleri görülmüştür. En sık izole edilen Gram negatif bakterilerin sırasıyla Escherichia coli (107, % 26.8), Acinetobacter baumannii (104, % 26.1), Klebsiella pneumoniae (73,% 18.3), Pseudomonas aeruginosa (41, % 10.3) ve Enterobacter spp.(26,% 6.5) oldukları tespit edilmiştir. Gram pozitif bakteri üremesinin 99’unun (% 51.6) Enterococcus spp., 85’inin (% 44.3) Staphylococcus aureus olduğu saptanmıştır. Genişlemiş spektrumlu B-laktamaz (GSBL) üretimi Escherichia coli izolatlarının 50’sinde (% 46.7), Klebsiella pneumoniae izolatlarının 26’sında (% 35.6) görülürken, Proteus spp. izolatlarında saptanmamıştır. Karbapenemler tüm Gram negatif bakterilere karşı en etkili antibiyotikler olsa da, Acinetobacter baumannii izolatlarının tamamının karbapenemlere dirençli olduğu görülmüştür. Staphylococcus aureus izolatlarında vankomisine direnç saptanmazken, metisiline direnç % 30.6 olarak belirlenmiştir. Enterococcus spp. izolatlarının tamamı linezolide duyarlı olup vankomisine direnç sadece iki izolatta (% 2) tespit edilmiştir. Sonuç olarak bu çalışmada kan dolaşımı enfeksiyonlarına neden olan etkenler arasında hastanemizde diğer çalışmalara göre A.baumannii’nin hem görülme sıklığının fazla olması hem de izolatların tamamının karbapenemlere dirençli tespit edilmesi, hastanemizde enfeksiyon kontrol önlemlerinin artırılmasının gerektiği kanaatini oluşturmuştur.
Distribution of Microorganisms in Blood Cultures and Their Antibiotic Resistance
Bloodstream infections are one of the most common invasive infections. The aim of this study is to determine the types of microorganisms and antibiotic susceptibility isolated from blood cultures in order to guide clinicians determining the empirical treatment of bloodstream infections. 621 isolates identified between January 2016 and December 2017 were included in the study. Blood culture samples were incubated in BACT / ALERT 3D automated system (bioMérieux, Marcy I’Etoile, France). Identification and antibiotic susceptibility of microorganisms were done with VITEK 2 (bioMérieux, France). Of the isolated 621 microorganisms, 399 (64.3 %) were Gram negative, 192 (30.9 %) were Gram positive bacteria and 30 (4.8 %) were yeasts. The most frequent Gram negative bacteria were Escherichia coli (107, 26.8 %), Acinetobacter baumannii (104,26.1 %), Klebsiella pneumoniae (73, 18.3 %), Pseudomonas aeruginosa (41, 10.3 %) and Enterobacter spp. (26,6.5 %). The most frequent Gram positive bacteria were Enterococcus spp. (99, 51.6 %) and Staphylococcus aureus (85, 44.3 %). Extended spectrum B-lactamase (ESBL) was found in 50 (46.7 %) Escherichia coli isolates and 26 (35.6 %) of K.pneumoniae isolates while ESBLs were not detected in Proteus spp. isolates. Although carbapenems are the most effective antibiotics against all Gram negative bacteria, it has been found that the all A.baumannii isolates are resistant to carbapenems. Methicillin resistance was 30.6 % while no resistance to vancomycin was detected in Staphylococcus aureus isolates. Enterococus spp. were sensitive to linezolid and resistance to vancomycin was detected in only two isolates (2 %). As a result, among the agents causing bloodstream infections in this study, it was observed that the both incidence of A.baumannii and their carbapenem resistance ratio were higher in our hospital than other studies, suggesting that infection control measures should be increased in our hospital.
___
- Aydın M, Kaşıkçıoğlu C, Koşucu SN, Timurkaynak
F, Arslan H. Kan dolaşımı infeksiyonu etkenleri ve
antibiyotik direnç oranları. Klimik Derg. 2016;29(2):
82-5.
- Central Asian and Eastern European Surveillance of
Antimicrobial Resistance CAESAR Annual Report
2016: http: www.euro.who.int/en/health-topics/
disease-prevention/antimicrobial-resistance/
publications/2016/central-asian-and-eastern
european-surveillance-of-antimicrobialresistance.-annual-report-2016.
- CLSI. Clinical and Laboratory Institute.
Performance Standards for Antimicrobial
Susceptibility Testing; Twenty Fifth Informational
Supplement. Document M100-S23, (2013).
- Er H, Aşık G, Yoldaş Ö, Demir C, Keşli R. Kan
kültürlerinde izole edilerek tanımlanan mikroorganizmaların
ve antibiyotik direnç oranlarının
belirlenmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg.
2015;45(1):48-54.
- European Centre for Disease Prevention and
Control. Healthcare-associated infections acquired
in intensive care units. In: ECDC. Annual epidemiological
report for 2015, page:4-5, Stockholm:
ECDC; 2017. Stockholm, (2017).
- Guimarães ROS, Cunha TM, Oliveira ACS,
AraújoLB, Pedroso RS, Röder DVDB. Bloodstream
infection: The influence of risk factors, etiology
and antimicrobial therapy on mortality rates. J
Am Geriatr Soc. 2014;62(2):306-11.
- Gündoğdu DZ, Çopur-Çiçek A, Mutlu MA,
Koçyiğit S. Kan kültürlerinden izole edilen Gram
negatif çomaklar ve antibiyotik duyarlılıkları. Eur
J Health Sci. 2015;1(2):58-62.
- Kılınç Ç, Güçkan R, Kahveci M, Kayhan Y, Pirhan
Y, Özalp T. Kan kültürlerinde üreyen Gram negatif
izolatların dağılımı ve antibiyotik direnç profilleri.
Int J Basic Clin Med. 2015;3(3):125-30.
- Küçükateş E, Gültekin N. Yoğun bakım ünitelerinde
yatan hastaların kan kültürlerinden izole
edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal
duyarlılıkları. Med Bull Haseki 2016;54(2):97-102.
https://doi.org/10.4274/haseki.2872
- Pfaller M. Nosocomial fungal infections.
Epidemiology of candidiasis. J Hosp Infect.
1995;30:329-38.
https://doi.org/10.1016/0195-6701(95)90036-5
- Rossolini GM, D’Andrea MM, Mugnaioli C. The
spread of CTX-M-type extended-spectrum betalactamases.
Clin Microbiol Infect. 2008;14(1):33-
41.
http://dx.doi.org/10.1111/j.1469-0691.2007.01867.x
- Şafak B, Kılınç O. 2010-2015 yılları arasında kan
kültürlerinde üreyen mikroorganizmalar ve antibiyotik
duyarlılıkları. Klimik 2016;29(2):60-4.
- Şahin İ, Çalışkan E, Öztürk E, et al. Kan kültürlerinden
izole edilen mikroorganizmaların dağılımı
ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Düzce Tıp Derg.
2013;15(2):11-4.
- Şirin MC, Ağuş N, Yılmaz N ve ark. Yoğun bakım
ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden
izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik
duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg.
2017;74(3):269-78.
https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2017.94899
- Taşçı L, Güreser AS, Boyacıoğlu Zİ, Karasartova
D, Taylan ÖA. Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve
Araştırma Hastanesi’nde kan kültürlerinden üreyen
mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları.
FLORA 2016;21(1):27-32.
- Temiz H, Temiz S, Kaya Ş, Çelen MK. Kan kültürlerinden
izole edilen Gram-negatif bakterilerde
antibiyotik direnci. Klimik Derg. 2014;27(2):62-8.
http://dx.doi.org/10.5152/kd.2014.15
- T.C. Sağlık Bakanlığı Türkiye Halk Sağlığı Kurumu
Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarları Daire
Başkanlığı. Ulusal Hastane Enfeksiyonları
Sürveyans Ağı Özet Raporu 2015. Ankara. Ağustos
(2016).
- The European Committee on Antimicrobial
Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation
of MICs and zone diameters. Version 3.1,
2013. http://www.eucast.org (Erişim Tarihi: Mart
2017)
- World Health Organization Antimicrobial
Resistance. Global Report on Surveillance 2014.
http://www.who.int/drugresistance/documents/surveillancereport/en/
(Erişim tarihi:
Nisan 2014)
- Yiş R. Güneydoğu Anadolu Bölgesi’nde bir çocuk
hastanesinde kan kültürü sonuçlarının değerlendirilmesi.
Turk Ped Arş. 2015;50(2):102-7.
- Yüksekkaya Ş, Opuş A, Güvenç Hİ ve ark. 2009-
2013 yılları arasında Konya Eğitim ve Araştırma
Hastanesi’nde kan kültüründen izole edilen
Staphylococcus aureus suşlarının antimikrobiyal
ajanlara duyarlılıklarının değerlendirilmesi.
ANKEM Derg. 2017;31(1):1-6.