Şeker Pancarında Polymyxa betae Keskin ile Taşınan Virüsler ve Moleküler Tanılama Yöntemleri

Beet necrotic yellow vein virus (Şeker pancarı nekrotik sarı damar virüsü), Beet soil borne virus (Şeker pancarı toprakla taşınan virüs), Beet virus Q (Şeker pancarı Q virüs), ve Beet soil borne mosaic virus (Şeker pancarı toprakla taşınan mozayik virüs) şeker pancarı üretim alanlarında toprakla taşınan en önemli virüs hastalıklarıdır. Bu dört virüs toprakta uzun yıllar kalan Polymyxa betae Keskin fungusu ile taşınmakta ve önemli ürün kayıplarına neden olmaktadırlar. Bu virüsler çoğunlukla aynı alanlarda ya da aynı bitkide bir arada bulunurlar. Bu çalışmada şeker pancarında enfeksiyon oluşturan toprakla taşınan virüsler ve bunların teşhisinde kullanılan moleküler yöntemler ile ilgili bazı çalışmaların sonuçları özetlenmiştir.

Sugar Beet Viruses Transmitted by Polymyxa betae Keskin and Molecular Detection Methods

Beet necrotic yellow vein virus, Beet soil borne virus, Beet virus Q and Beet soil borne mosaic virus are the important soil-borne virus diseases in the production areas of sugar beet. Four viruses are transmitted by fungus vector Polymyxa betae Keskin which survives in infested soil for many years. The viruses cause a significant crop yield reductions. These viruses are often found in same field, sometimes infecting the same beet. In this review, the results from some researches on the molecular techniques for diagnosis of soil borne viruses infecting sugar beet were summarized.

___

Açıkgöz, S., Döken, M.T., Çıtır, A. ve Yardımcı, N. 1998. Amasya Kiraz Hastalığı Etmeninin dsRNA Analii ile Tanılanması ve Ege Bölgesi’nin Bu Hastalık Yönünden İncelenmesi. Türkite VIII. Fitopatoloji Kongresi Bildirileri, Ankara, 234-238.

Anonim, 2008. http://www. scienceblogs.com (Erişim tarihi: 20.05.2008)

Anonim, 2009a. http://www.Icnaes.affrc.go.jp (Erişim tarihi: 02.04.2007)

Anonim, 2009b. http://www.rennes.inra.fr (Erişim tarihi: 12.11.2008)

Anonim, 2010. İnternet Sitesi. http//www.turkseker.gov.tr. (Erişim Tarihi: 23.02.2010)

Asher, M.J.C. and Blunt, S.J. 1987. The Ecological Requirement of Polymyxa betae. In: Proc 50th IIRB Cong., Brussels, 45-55.

Borodynko, N., Rymelska, N., Hasiów-Jaroszewska, B., Pospieszny and H. 2009. Molecular Characterization of Three Soil-borne Sugar Beet-Infecting Viruses Based on the Coat Protein Gene. Journal of Plant Pathology, 91 (1): 191-193.

Canova, A. 1959. On the Pathology of Sugar Beet. Inf. Fitopatol., 9: 390-396.

Duffus, J.E. and Liu, H.Y. 1987. First Report of Rhizomania of Sugar Beet from Texas. Plant Disease, 71: 557.

Ertunç, F., Erzurum, K., Karakaya, A., İlhan, D. ve Maden, S. 1998. Incidence of Rhizomania Disease on Sugar Beet in Çorum, Kastamonu and Turhal Sugar Refinery Regions. The Journal of Turkish Phytopathology, Vol. 27, No:1: 39-46.

Ertunç, F. ve İlhan, D. 2002. dsRNA Analysis of Turkish Beet Necrotic Yellow Vein Virus (BNYVV) Isolates. The Journal of Turkish Phytopathology, Vol. 31, No:3: 173-183.

Harju, V.A., Skelton, A., Clover, G.R.G., Ratti, C., Boonham, N., Henry, C.M. and Mumford, R.A. 2005. The Use of Real-time RT-PCR (TaqMan) and Post-ELISA Virus Release for the Detection of Beet Necrotic Yellow Vein Virus Types Containing RNA 5 and Its Comparison with Conventional RT-PCT. Journal of Virological Methods, 123: 73-80.

Heidel, G.B., Rush, C.M., Kendall, T.L., Lommel, S.A. and French, R.C. 1997. Characteristics of Beet Soilborne Mosaic Virus, a Furo-like virus Infecting Sugar Beet. Plant Disease, 81:1070-1076.

İlhan, D. 2004. Şeker Pancarı Nekrotik Sarı Damar Virüsü (Beet Necrotic Yellow Vein Benyvirus: BNYVV)’nün Moleküler Olarak Tanılanması. Doktora Tezi, Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Ensititüsü, 75s, Ankara.

İlhan, D. ve Ertunç, F. 2001. Investigation of Some Furoviruses by dsRNA Analysis Method. The Journal of Turkish Phytopathology, Vol. 30, No. 1: 27-34.

Ivanovic, M. and Mc F a r l a n e, I. 1982. A tubular Virus Associated with Infection of Sugar Beet by Polymyxa betae, Rothamsted Exp. Stn. Rep. 1981: 190—191.

Kardani, S. G., Tabasinezhad, F., Jafarpour, B. and Rastegar, M. F. 2006. Detection of Beet Soil Borne Virus and Type A of Beet Necrotic Yellow Vein Virus in Razavi Khorasan Province of Iran using the RT-PCR Method with Specific Primers. Ninth Arab Congress of Plant Protection, 19-23 November, Damascus, Syria.

Kaya, R. 2009. Türkiye’de Şeker Pancarı Ekim Alanlarında Rhizomania Hastalığının Yayılma Durumu. Tarım Bilimleri Dergisi, 15 (4): 332-340.

Kayrın, L., Aksoy, K., Tuli, A., Çürük, M.A. ve Attila, G. 2003. Restriksiyon Enzimleri. Tanıda DNA Teknikleri, VI. Biyokimya Yaz Okulu, 15-19 Eylül 2003, Adana.

Kıymaz, T. 2002. Şeker Politikalarında Yeni Yönelimler ve Türkiye’nin Konumu. İktisadi Sektörler ve Koordinasyon Genel Müdürlüğü Tarım Dairesi, DPT Yayın No: 2652, Ankara.

Keskin, B. 1964. Polymyxa betae n.sp., ein Parasit in den Wurzeln von Beta vulgaris Tournefort, Besonders Während der Jugendent Wicklung der Zuckerrübe. Archiv für Mikrobiologie, 49: 348-374.

Koenig, R., Lüddecke, P. and Haeberlé, A.M. 1995. Detection of Beet necrotic yellow vein virus Strains, Variants and Mixed Infections by Examining Single-Strand Conformation Polymorphisms of Immunocapture RT-PCR Products. Journal of General Virology, 76: 2051-2055.

Koenig R., Pleij C.W.A., Beier C. and Commandeur, U. 1998. Genome Properties of Beet Virus Q, A New Furo-like Virus from Sugarbeet, Determined from Unpurified Virus. Journal of General Virology, 79: 2027-2036.

Korkmaz, S. ve Çınar, A. 1998. Bitki Virus Hastalıklarının Double-Stranded RNA Analizi Yöntemiyle Tanısının Yapılması. Türkiye VIII. Fitopatoloji Kongresi, 21-25 Eylül 1998, Ankara.

Kutluk Yılmaz, N.D., Meunier, A., Schmit, J.F., Stas, A. and Bragard, C. 2004. Tokat ili Şeker Pancarı Üretim Alanlarında Beet Necrotic Yellow Vein Virus, Beet Soilborne Virus, Beet Virus Q ve Vektör Polymyxa betae Keskin’in Multiplex Reverse Transcription-PCR Yöntemi ile Belirlenmesi. Türkiye I. Bitki Koruma Kongresi, 8-10 Eylül, Samsun, s.174.

Kutluk Yılmaz, N.D. ve Erkan, S. 2005. Şeker Pancarı (Beta vulgaris var. saccharifera)’nda Rhizomania Hastalığı. OMÜ. Ziraat Fakültesi Dergisi, 20(1): 64-72.

Kutluk Yılmaz, N.D. ve Sökmen, M.A. 2007. Orta Karadeniz Bölgesi Şeker Pancarı Üretim Alanlarında Belirlenen Beet Necrotic Yellow Vein Virus Izolatlarında RNA-5’in Araştırılması. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi, 27-29 Ağustos, Isparta, s.303.

Kutluk Yılmaz, N.D., Meunier, A., Schmit, J.F., Stas, A. and Bragard, C. 2007 Partial Nucleotide Sequence Analysis of Turkish Isolates of Beet Necrotic Yellow Vein (BNYVV) RNA-3. Plant Pathology, 56: 311-316.

Kutluk Yılmaz, N.D., Sökmen, M., Gulser, C., Saracoğlu, S. and Yılmaz, D. 2010. Relationships Between Soil Properties and Soilborne Viruses Transmitted by Polymyxa betae Keskin in sugar beet fields. Spanish Journal Agricultural Research, 8(3): 766-769.

Lennefors, B.L. 2006. Molecular Breeding for Resistance to Rhizomania in Sugar Beets. Swedish University of Agricultural Sciences, Doctoral Thesis, 41p. Uppsala.

Lesemann, D.E., Koenig, R., Lindsten, K. and Henry, C. 1989. Serotypes of Beet Soil-borne Furovirus from FRG and Sweden. Bull. EPPO/OEPP, 19: 539-540.

Liu, H.Y., Sears, J.L. and Lewellen, R.T. 2005. Occurence of Resistance-Breaking Beet Necrotic Yellow Vein Virus of Sugar Beet. Plant Disease, 89: 464-468.

Makkouk, K. and Kumari, S. 2006. Molecular Diagnosis of Plant Viruses. Arab Journal of Plant Protection, Vol. 24: No.2.

Meunier, A., Schmit, J-F., Stas, A., Kutluk, N. and Bragard, C. 2003. Multiplex Reverse Transcription-PCR for Simultaneous Detection of Beet necrotic yellow vein virus, Beet soilborne virus, and Beet virus Q and their vector Polymyxa betae Keskin on Sugar Beet. Applied Environment Microbiology, 69: 2356-2360.

Morris, J., Clover, G.R.G., Harju, V.A., Hugo, S.A. and Henry, C.M. 2001. Development of A Highly Sensitive Nested RT-PCR method for Beet Necrotic Yellow Vein Virus Detection. Journal of Virological Methods, 95: 163-169.

Mullis, K., Faloona, F., Scharf, S., Saiki, R., Horn, G. and Erlich, H. 1986. Spesific Enzymatic Amplification of DNA in Vitro: The Polymerase Chain Reaction. Cold Spring Harbor. Symp. Quant Biol., 51: 263-273.

Özgür, O.E. 1995. Türkiye Şeker Pancarı Hastalıkları. Türkiye Şeker Fabrikaları A.Ş. Genel Müdürlüğü, Yayın No: 218: 33-47.

Özgür, O.E. 2003. Türkiye Şeker Pancarı Hastalıkları (Sugar Beet Diseases In Turkey). Türkiye Şeker Fabrikaları A.Ş. Genel Müdürlüğü, Yayın No: 219: 52-55.

Pferdmenges, F. 2007. Occurrence, Spread and Pathogenicity of Different Beet Necrotic Yellow Vein Virus (BNYVV) Isolates. Der Georg-August-Universität Göttingen, Doctoral Thesis, 110pp.

Prillwitz, H. and Schlösser, E. 1992. Beet Soil-Borne Virus: Occurence, Symptoms and Effect on Plant Development. Med. Fac. Landbouv. Üniv. Gent. 57/2a: 295-302.

Putz, C., Merdinoğlu, D., Lemaire, O., Stocky, B., Valentin, P. and Wiedemann, S. 1990. Beet Necrotic Yellow Vein Benyvirus causel agent of Rhizomania. Rewiev of Plant Pathology. 69(5): 247-254.

Rush, C. M., French, R.C. and Heidel G. B. 1993. Texas 7a Possible Strain of Beet Necrotic Yellow Vein Virus. Pages 59-In: Proc. Symp. Int. Work. Group Plant Viruses Fungal Vectors, 2nd. Montreal, Canada.

Rush, C. M. and Heidel G. 1995. Furovirus Diseases of Sugar Beets in the United States. Plant Disease, 79: 868-875.

Rysanek, P., Homa, I. and Zouhar, M. 2006. Study of Sugar Beet Viruses Transmitted by Polymyxa betae in the Czech Republic. Proc. Nat. Sci. Matica Srpska Novi Sad, 110: 47-54.

Shahnejat-Busnehri, A.A., Jamaledin, A. and Dehkordi, M.K.H. 2006. Detection of Beet Necrotic Yellow Vein Virus with Reverse Transcription-Polimerase Chain Reaction. International Journal of Agriculture Biology, Vol.8: No.2.

Spiegel, S. 1987. Double-Stranded RNA in Strawberry Plants Infected with Strawberry Mild Yellow-Edge Virus. Phytopathology, 77: 1492-1494.

Suarez, M.B., Grondona, I., Garcia Benavides, P., Monte, E. and Garcia-Acha, I. 1999. Characterization of Beet Necrotic Yellow Vein Furovirus from Spanish Sugar Beet. International Microbiology, 2: 87-92.

Tamada, T., Shirako, Y., Abe, H., Saito, M., Kiguchi, T. and Harada, T. 1989. Production and Pathogenicity of Isolates of Beet Necrotic Yellow Vein Virus with Different Numbers of RNA Components. Journal of General Virology, 70: 3399-3409.

Ulubaş, Ç. 2002. Sert Çekirdekli Meyve Ağaçlarında Enfeksiyon Yapan Virüslerin Moleküler Yöntemlerle Tanılanması. Sert Çekirdekli Meyve Virüslerinin Moleküler Yöntemlerle Tanılanması Kurs Notları. 30 Eylül- 4 Ekim 2002. Ankara

Vorechovsky, I. 2005. Single-Strand Conformation Polymorphism (SSCP) Analysis. Medical Biomethods Handbook. 73-77 p.

Ward, L., Fenn, M. and Henry, C., 2003. Development of a Direct Detection Method for Polymyxa sp. in Soil. American Society of Sugar Beet Technologists, 111-114.

Webster C.G., Wylie, S. J. and Jones, M. G. K. 2004. Diagnosis of Plant Viral Pathogens. Current Science, Vol, 86: No:12.

Whitney, E.D. and Duffus, J.E. 1991. Compendium of Beet Diseases and Insects, APS Pres, 76pp., USA.

Wisler, G. C., Liu, H. Y. and Duffus, J. E. 1994. Beet Necrotic Yellow Vein Virus and its Relationship to Eight Sugar Beet Furo-Like Viruses from the United States. Plant Disease, 78: 995-1001.

Zizyte, M., Staniulis, J. and Zitikaite, I. 2006. Identification of Beet Necrotic Yellow Vein Virus Isolate Detected in Lithuania. Agronomy Research, 4: 475-478
Ziraat Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1304-9984
  • Yayın Aralığı: Yılda 2 Sayı
  • Başlangıç: 2006
  • Yayıncı: Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi
Sayıdaki Diğer Makaleler

Şeker Pancarında Polymyxa betae (Keskin) ile Taşınan Virüsler ve Moleküler Tanılama Yöntemleri

Handan ÇULAL KILIÇ, Nejla YARDIMCI

Seralarda Karbondioksit Düzeyi, Karbondioksit Gübrelemesi ve Olası Etkileri

Ahmet TEZCAN, ATILGAN ATILGAN

Organik ve Konvansiyonel Olarak Yetiştirilen M9 Anaçlı Bazı Elma Çeşitlerinde Farklı Besin Uygulamaların Bitkinin Morfolojik Gelişimi Üzerine Etkileri

Adem ATASAY, Mesut İŞÇİ, Kadir UÇGUN, Gökhan ÖZTÜRK, Suat KAYMAK, Hüseyin AKGÜL

Bazı Tritikale Genotiplerinde Tane Verimi ve Stabilite Analizi

İLKNUR AKGÜN, DEMET ALTINDAL

Çiftlik Hayvanlarının Beslenmesinde Organik Selenyumun Önemi

TUGAY AYAŞAN, MİKAİL BAYLAN

Şeker Pancarında Polymyxa betae Keskin ile Taşınan Virüsler ve Moleküler Tanılama Yöntemleri

HANDAN ÇULAL KILIÇ, NEJLA YARDIMCI

Organik ve Konvansiyonel Olarak Yetiştirilen M9 Anaçlı Bazı Elma Çeşitlerinde Farklı Besin Uygulamalarının Bitkinin Morfolojik Gelişimi Üzerine Etkileri

Adem ATASAY, Mesut İŞCİ, KADİR UÇGUN, Gökhan ÖZTÜRK, Suat KAYMAK, Hüseyin AKGÜL

Seçilmiş Bazı Badem Genotiplerinin Döllenme Biyolojileri Üzerine Araştırmalar: II. Bazı Kimyasal Uygulamaların Polen Performansları Üzerine Etkileri

SULTAN FİLİZ GÜÇLÜ, Fatma KOYUNCU, Adnan YILDIRIM, Funda CELEPAKSOY

Isparta Yöresi Kiraz Bahçeleri Topraklarının Bitkiye Yarayışlı Demir Miktarlarının Belirlenmesinde DTPA ve EDTA Test Yöntemlerinin Karşılaştırılması

Çiğdem BOYDAK, İBRAHİM ERDAL

22-42 Günlük Yaştaki Dişi Etlik Piliçlerin Treonin Gereksinmesi

TUGAY AYAŞAN, Ferda OKAN