Roma İmparatorluğunun ikiye ayrılması daha sonraki yıllarda hıristiyan âleminin de ikiye ayrılmasına sebep oldu. Bilhassa Batı Romanın yıkılmasından sonra eski Roma rolünü oynayan Bizans, o günkü siyaseti icabı Romadaki papayı değil, İstanbuldaki patriki en büyük hıristiyan ruhanî lider olarak tanımaya başladı. VI. y.y. da başlayan bu ayrılık gittikçe artarak XI. y.y. da kesin şeklini aldı. 1053 yılında Ortodoks mezhebini kabul etmiş olan doğu hınstiyanları, îstanbulda Ortodoks Patrikhanesini resmen kurdular ve Roma Katolik Kilisesinden kesin olarak ayrıldılar. Bir ara Latinlerin İstanbulu ele geçirmeleri (1204) ile sarsıntıya uğradıysa da Bizans İmparatorluğunun yıkılışına kadar fasılasız devam etti. Ancak Kilise, Doğu Roma imparatorluğu gibi sonraları basit bir değişim geçirerek Grek Kilisesi şekline dönüştü. Yahut Doğu Roma'dan armağan kalan ismiyle Rum Patrikhanesi oldu