Abdulhamit ÇALI, CEM ÇELİK, UĞUR TUTAR, Mustafa Zahir BAKICI

Hastanede Yatan Hastalardan İzole Edilen Mikroorganizmaların Biyofilm Formasyon Aktiviteleri

GİRİŞ ve AMAÇ: Günümüzde antimikrobiyallere dirençli mikroorganizmaların giderek artması bakteriyel enfeksiyonların tedavisinde ciddi sorunlara neden olmaktadır. Antimikrobiyal maddelere karşı direncin önemli nedenlerinden birisi de biyofilmlerdir. Biyofilm, mikroorganizmalar için korunaklı bir yapıdır ve bu yapının içinde yaşayan mikroorganizmalar antimikrobiyal ajanlara ve dezenfektanlara karşı planktonik formlara oranla 1000 kata kadar daha dirençli olabilmektedir. Bu çalışmada, hastane enfeksiyonlarından sıklıkla izole edilen Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus ve Candida albicans mikroorganizmalarının biyofilm formasyon aktivitelerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. YÖNTEM ve GEREÇLER: Bu çalışmada, Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Uygulama ve Araştırma Hastanesi servislerinde ve yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalardan gönderilen çeşitli klinik örneklerden yapılan kültürlerde üreyen 25’er adet A. baumannii, P. aeruginosa, S. aureus ve C. albicans mikroorganizmalarının biyofilm üretim kapasiteleri mikrotitre plak yöntemi kullanılarak yapılmıştır. Biyofilm formasyonları negatif kontrol değeri baz alınarak; biyofilm oluşturmayan = 0, zayıf biyofilm = I, orta dereceli biyofilm = II ve güçlü biyofilm = III olarak değerlendirilmiştir. BULGULAR: Yapılan çalışma sonrasında izolatların toplam % 89’unda zayıf, orta ve güçlü düzeylerde biyofilm oluşumu tespit edilmiştir. A. baumannii, P. aeruginosa, S. aureus ve C. albicans suşlarının biyofilm oluşturma oranları sırası ile % 100, % 88, % 92 ve % 76 olarak bulunmuştur. TARTIŞMA ve SONUÇ: Hastane kaynaklı P. aeruginosa, A. baumannii, S. aureus ve C. albicans mikroorganizmalarının önemli oranlarda biyofilmler oluşturduğu görülmüştür. Mikroorganizmalarda direnç gelişimi ile ilgili çalışmalarda bu durumun da göz önünde bulundurulması önemli olabilir. Çalışmamızda elde edilen verilerin bu konuda yapılacak daha ileri çalışmalar için literatüre veri sunacağını düşünmekteyiz.

Biofilm Formation Activities of Isolated Microorganisms from Hospitalized Patients

INTRODUCTION: Increasing numbers of antimicrobialresistant microorganisms today are causing serious problems in the treatment of bacterial infections. One of the major causes of resistance to antimicrobials is biofilms. Biofilm is a sheltered structure for microorganisms and microorganisms living within this structure can be up to 1000 times more resistant to antimicrobial agents and disinfectants than planktonic forms. In this study, it was aimed to evaluate biofilm formation activities of Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus and Candida albicans microorganisms which are frequently isolated from hospital infections. METHODS: In this study, the biofilm production capacities of 25 A. baumannii, 25 P. aeruginosa, 25 S. aureus and 25 C. albicans microorganisms that were cultured in various clinical specimens sent from the patients hospitalized in Cumhuriyet University Faculty of Medicine Practice and Research Hospital services and intensive care units were evaluated by microtiter plate method. Biofilm formations were evaluated based on negative control value how non-biofilm = 0, weak biofilm = I, moderate biofilm = II and strong biofilm = III. RESULTS: At the end of the study, 89% of the isolates were found to have weak, moderate and strong biofilm formation. Biofilm formation rates of A. baumannii, P. aeruginosa, S. aureus and C. albicans were 100%, 88%, 92% and 76%, respectively. DISCUSSION and CONCLUSION: Hospital-borne P. aeruginosa, A. baumannii, S. aureus and C. albicans microorganisms were found to form biofilms at significant proportions. Consideration of this situation may be important in studies on resistance development in microorganisms. We think that the data obtained in our study will provide literature data for further studies in this regard.

PDF

___

1. Orucu M, Geyik MF. Yoğun Bakım Ünitesinde Sık Görülen Enfeksiyonlar. Düzce Tıp Fakültesi Dergisi 2008; 10: 40-3.
2. Yüksekdağ ZN, Baltacı N. Staphylococcus aureus Türlerinde Biyofilm ve Biyofilm Oluşumundan Sorumlu Genler. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2013; 43: 77-83.
3. Lindsay D, Von Holy A. Bacterial Biofilms Within the Clinical Setting: What Healthcare Professionals Should Know? J Hosp Infect 2006; 64: 313-25.
4. Balcázar JL, Subirats J, Borrego C. The Role of Biofilms As Environmental Reservoirs of Antibiotic Resistance. Front Microbiol 2015; 6: 1216.
5. Gülgör G, Korukluoğlu M. Mikroorganizmalar Arasında Çoğunluk Algılanması (Quorum Sensing). Uludağ Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi 2014; 28: 83-92.
6. Kumar A, Alam A, Rani M, Ehtesham NZ, Hasnain SE. Biofilms: Survival and defense strategy for pathogens. Int J Med Microbiol 2017; 8: 481-9.
7. Myszka K, Czaczyk K. Bacterial Biofilms on Food Contact Surfaces. Polish Journal of Food and Nutrition Sciences 2011; 61: 173-80.
8. Christensen GD, Simpson WA, Younger JJ, et al. Adherence of Coagulase-Negative Staphylococci to Plastic Tissue Culture Plates; a Quantitative Model for the Adherence of Staphylococci to Medical Devices. J Clin Microbiol 1985; 22: 996- 1006 .
9. Chusri S, Phatthalung PN, Voravuthikunchai SP. Anti-biofilm Activity of Quercus İnfectoria G. Olivier Against Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus. Letters in Applied Microbiology 2012; 54: 511-7.
10. Öztürk ŞB, Sakarya S, Öncü S, Ertuğrul MB. Biyofilmler ve Yabancı Cisim İnfeksiyonları. Klimik Dergisi 2008; 21: 79-86.
11. Can F, Azap ÖK, Demirbilek M, Karabay G, Ergin F ve Arslan H. Kan Kültürlerinden İzole Edilen Acinetobacter baumannii Suşlarında Biyofilm Oluşumu. İnfeksiyon Dergisi 2006; 20: 159-63.
12. Altun HU, Şener B. Biyofilm İnfeksiyonları ve Antibiyotik Direnci. Hacettepe Tıp Dergisi 2008; 39: 82-8.
13. Sanchez C, Mende K, Beckius ML, et al. Biofilm Formation by Clinical İsolates and The İmplications in Chronic Infections. BMC Infect Dis 2013; 13: 47.
14. Sebit B, Aksu B, Yağcı AK. Biofilm Production and Biocidal Efficacy in Multidrug- Resistant Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii Isolates. International Journal of Antisepsis Disinfection Sterilization. 2016; 1: 7–12.
15. Tepeli EÇ. Pseudomonas aeruginosa Suşlarında Biyofilm Yapımının ve Quorum Sensing’de Rol Alan Genlerin Araştırılması [Uzmanlık Tezi]. [Denizli]: Pamukkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı; 2009. 85 s.
16. Demir C, İnanç BB. Nazal Kolonize Stafilokok Türlerinde Biyofilm Üretiminin Araştırılması. Journal of Clinical and Analytical Medicine 2013; 6: 414-8.
17. Ferrara AM. Potentially Multidrug-resistant Non-fermentative Gram-negative Pathogens Causing Nosocomial Pneumonia. International Journal of Antimicrobial Agents 2006; 27: 183-95.
18. Şahin R. Staphylococcus aureus Suşlarında Biyofilm Üretimi, Biyofilm Pozitif Ve Negatif Suşların Genotipik ve Fenotipik Karakterlerinin Karşılaştırılması [Uzmanlık Tezi]. [Denizli]: Pamukkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı; 2007. 94 s.
19. Özdemir T. Yara Yerinden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarının Biyofilm Oluşumunun Konvansiyonel ve Moleküler Yöntemlerle İncelenmesi [Yüksek Lisans Tezi]. [Ankara]: Gazi Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü; 2014. 105 s.
20. Demirbilek M, Timurkaynak F, Can F, Azap Ö, Arslan H. Hastane Kaynaklı Candida Türlerinde Biyofilm Oluşumu ve Antifungal Duyarlılık Paternleri. Mikrobiyol Bul 2007; 41: 261-9.
21. Yarar M. Klinik Materyallerden İzole Edilen Candida Albicans Suşlarında Sap Genlerinin Araştırılması [Uzmanlık tezi]. [Denizli]: Pamukkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı; 2014. 80 s.
22. Mahmoudabadi AZ, Zarrin M, Kiasat N. Biofilm Formation and Susceptibility to Amphotericin B and Fluconazole in Candida albicans. Jundishapur Journal of Microbiology. 2014; 7: e17105.