Veteriner Mikrobiyolojide Salmonella’nın Tanısında PCR ve Bakteriyolojik Yöntemlerin Meta-Analize Uygunluğunun Belirlenmesi
Bu çalışmada, veteriner mikrobiyolojide Salmonella’ların tanısında kullanılan bakteriyoloji ve PCR tekniklerine ait sonuçların, tutarlılık yönünden değerlendirilmesi için meta-analiz metodunun kullanılabilirliğinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmada, belirlenen “Salmonella, veterinary, PCR, cattle, sheep, goat, pig, chicken, horse, poultry” anahtar kelimeleri ile yapılan taramada 1472 kaynağa ulaşıldı. Elektronik kütüphanenin duplikasyonları elemesinden sonra 698 literatür ayrıca mikrobiyoloji alanında iki uzman tarafından da bağımsız şekilde okunarak, hala duplikasyon olan ve İngilizce olmayan yayınlar ile kitap, kitapta bölüm ve derleme olarak yer alanların yanı sıra, Salmonella dışında çalışılmış olan makaleler ve deneysel çalışmalar elenerek kalan 601 makale, kabul ve ret kriterleri dikkate alınmak suretiyle okundu. Makaleler, çalışmaların yapıldığı hayvan türü, kullanılan numune türü, çalışmada uygulanan PCR tekniği, kültür, makalede araştırılan Salmonella türü ve istatistiki yöntem kullanılıp kullanılmaması açısından değerlendirilerek veriler çıkarıldı. Hayvan türünün, kullanılan numune türünün, kültür ve PCR yöntemlerinin çalışmalarda farklı olduğu saptandı. İncelenen ve veri çıkarılan hiçbir makalede de herhangi bir istatistiki yöntem kullanılmadığı belirlendi. Bundan dolayı, elde edilen verilerin herhangi bir tanımlayıcı istatistik yöntemiyle değerlendirilmesi mümkün olmadı. Sonuç olarak, çalışmada değerlendirilen makalelerde hayvan türünün, kullanılan numune türünün, kültür ve PCR yöntemlerinin birbirinden farklı bulunması nedeniyle, verilerin standart yapıda olmadığı saptandı. Bu heterojenlikten dolayı meta-analiz yönteminin, PCR ve bakteriyolojik yöntemlerle elde edilen sonuçların tutarlılığı yönünden karşılaştırılması amacıyla kullanılamayacağı kanısına varıldı.
___
- 1. Akçil M, Karaağaoğlu E, (2001). Tıpta Meta Analizi. Hacettepe
Tıp Dergisi. 32(2), 184-190.
- 2. Arserim NB, Keskin O, (2012). Veteriner Epidemiyoloji’de
Sistematik Derleme ve Meta-analizi. Dicle Üniv Vet Fak Derg.
2(1), 37-39.
- 3. Carli KT, Unal CB, Caner V, Eyigor A, (2001). Detection of
Salmonellae in chicken faces by a combination of tetrathionate
broth enrichment, capillary PCR, andcapillary gel electrophoresis.
Journal of Clinical Microbiology. 39, 1871- 1876.
- 4. Çarkungöz E, (2010). Meta Analizinin Veteriner Hekimlikte
Uygulanması. Yüksek Lisans Tezi, Uludağ Üniversitesi Sağlık
Bilimleri Enstitüsü Biyoistatistik Anabilim Dalı, Bursa.
- 5. Egger M, Smith GD, Phillips AN, (1997). Meta- Analysis:
Principles and Procedures. British Medical Journal. 315,
1533-1537.
- 6. Egger M, Smith GD, Altman DG, eds., (2001). Systematıc
Revıews In Health Care: Meta-Analysıs In Context. Second
edition. BMJ Publishing Group, p.1-487.
- 7. Eyigor A, Carli KT, (2003). Rapid detection of Salmonella from
poultry by real-time polymerase chain reaction with fluorescent
hybridization probes. Avian Diseases. 47, 380-386.
- 8. Fisher M, Friedman SB, Strauss B, (1994). The Effects of
Blinding on Acceptance of Research Papers by Peer Review.
JAMA. 272(2), 143-146.
- 9. Gouws PA, Visser M, Brözel VS, (1998). A polymerase chain
reaction procedure for the detection of Salmonella spp. within
24 hours. Journal of Food Protection. 61, 1039-1042.
- 10. Hedges L, Olkin I, (1985). Statistical methods for meta-analysis.
Academic Press, New York. p.224-236.
- 11. Hunter J, Schmidt FL, Jackson GB, (1982). Meta-Analysis:
Cumulating research findings across studies. Sage Publication,
California. p.56-62.
- 12. Hunter JE, Schmidt FL, (1990). Methods of Meta-Analysis
Correcting Error and Bias in Research Findings. The Publisher
of Proffesional Social Science, Newbury Park, London, New
Delhi.
- 13. İzgür M, (2006). Enterobakteri İnfeksiyonları
(Enterobacteriaceae). Aydın N, Paracıkoğlu J. eds. Veteriner
Mikrobiyoloji (Bakteriyel Hastalıklar). İlke-Emek Yayınları,
Ankara. p.109-127.
- 14. Leandro G, (2005). Meta-analysis in medical research : the
handbook for the understanding and practice of meta-analysis.
First published. Blackwell Publishing, Massachusetts, USA.
p.1-98.
- 15. Oliveira SD, Santos LR, Schuch DMT, Silva AB, Salle CTP,
Canal CW, (2002). Detection and identification of salmonellas
from poultry-related samples by PCR. Veterinary
Microbiology. 87, 25-35.
- 16. Ridge SE, Harkin JT, Badman RT, Mellor AM, Larsen JWA,
(1995). Johne’s disease in alpacas (Lama pacos) in Australia.
Aust. Vet. J. 72, 150-153.
- 17. Rodriguez JM, (1997). Detection of pathogens by using the
Polymerase Chain Reaction(PCR). Vet. Journal. 153, 287-305.
- 18. Shelby LB, Vaske JJ, (2008). Understanding Meta-Analysis:
A Review of the Methodological Literature. Leisure Sciences.
30(2), 96-110.
- 19. Stroup DF, Berlin JA, Morton SC, (2000). Meta Analysis of
Observational Studies in Epidemiology. JAMA. 283(15),
2008-2012.
- 20. Totton SC, Farrar AM, Wilkins W, Bucher O, Waddell LA,
Wilhelm BJ, Mcewen SA, Rajić A, (2012). The effectiveness
of selected feed and water additives for reducing Salmonella
spp. of public health importance in broiler chickens: a systematic
review, meta-analysis, and meta-regression approach. Prev
Vet Med. 106(3-4), 197-213.
- 21. Wilkins W, Rajić A, Parker S, Waddell L, Sanchez J, Sargeant
J, Waldner C, (2010). Examining heterogeneity in the diagnostic
accuracy of culture and PCR for Salmonella spp. in swine:
a systematic review/meta-regression approach. Zoonoses And
Public Health. 57(1), 121-34.
- 22. Wolf FM, (1986). Meta-Analysis : Quantitative Methods for
Research Synthesis. Series: Quantitative Applications in the
Social Sciences. Sage Publications, California. 3, 7-59.
___
APA
|
Nuraloğlu, M. U.
& Yardımcı, H.
(2016).
Veteriner Mikrobiyolojide Salmonella’nın Tanısında PCR ve Bakteriyolojik Yöntemlerin Meta-Analize Uygunluğunun Belirlenmesi
.
Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi
, 27 (2) ,
113-117 .
DOI: 10.35864/evmd.514523 |