Gökkuşağı Alabalığı Kökenli Listonella anguillarum İzolatlarının Fenotipik ve Genotipik Karakterizasyonu
Bu çalışmada, gökkuşağı alabalıklarından izole edilen altı L. anguillarum izolatı ve bir referans suş fenotipik ve genotipik özellikler açısından incelendi. İzolatların fenotipik özelliklerinin belirlenmesinde klasik mikrobiyolojik testler ve API 20 E strip testi kullanıldı. İzolatların moleküler identifikasyonu amiB genine dayanan L. anguillarum tür spesifik PCR uygulaması ve sonrasında aynı bölgenin sekans analizinin yapılmasıyla gerçekleştirildi. İzolatların dokuz farklı antibiyotiğe karşı antimikrobiyel aktiviteleri disk difüzyon yöntemiyle belirlendi. Ayrıca izolatlar arasındaki olası klonal ilişkiler Rastgele Amplifiye Edilmiş Polimorfik DNA (RAPD) metodu ile ortaya konuldu. API 20 E testlerinde izolatlar arasında β-Galaktosidaz, arginin dihidrolaz, sitrat, sorbitol, amygdalin ve arabinoz testlerinde farklıklar görülmüştür. Tüm izolatların L. anguillarum spesifik 429 bp’lik bant verdiği saptanmış ve bu sonuç sekans analizi ile doğrulanmıştır. L. anguillarum izolatlarının çalışmada kullanılan dokuz farklı antibiyotiğe karşı değişik düzeyde antimikrobiyal aktiviteye sahip oldukları belirlendi. En yüksek direnç oranı neomisin ve linkomisin’e (% 100), en düşük direnç oranı ise doksisklin’e (% 14,2) karşı gözlendi. RAPD analizi sonucunda L. anguillarum izolatları % 60 benzerlik katsayısına göre bir unique tip ve beş alt türden oluşan bir küme (cluster) içerisinde gruplanmıştır. Bu çalışmanın balık kökenli L. anguillarum izolatlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin belirlenmesi ile ilgili ileride yapılacak çalışmalara temel oluşturabileceği düşünülmektedir. Ayrıca elde edilen sonuçlar, balık hastalıklarının tedavisinde uygun antimikrobiyal ajanların seçilmesinin önemini ortaya koymaktadır.
___
- 1. Akaylı T, Durna M, (2017). Kültür Levrek (D. labrax)
Balıklarından izole edilen Vibrio anguillarum izolatlarının
karakterizasyonu. Kocatepe Vet J. 10(3), 134-141.
- 2. Altun S, Kubilay A, Diler O, (2010). Yersinia ruckeri
suşlarının fenotipik ve serolojik özelliklerinin incelenmesi.
Kafkas Univ Vet Fak Derg.16(Suppl B), 223-229.
- 3. Austin B, Alsina M, Austin DA, Blanch AR, Grimont F,
Grimont PAD, Jofre J, Koblavi S, Larsen JL, Pedersen K,
Tiainen T, Verdonck L, Swings J, (1995). Identification
and typing of Vibrio anguillarum: a comparison of different
methods. Syst Appl Microbiol. 18, 285-302.
- 4. Austin B, Austin DA, (1993). Bacterial fish pathogens disease
of farmed and wild fish, Second edition. Chichester,
England, Ellis Horwood. p.269-270.
- 5. Balta F, Balta ZD, (2017). Doğu Karadeniz’de yetiştiriciliği
yapılan gökkuşağı alabalıkları (Oncorhynchus
mykiss)’ndan izole edilen Vibrio anguillarum suşlarının
serotiplendirilmesi, genetik karakterizasyonu ve antimikrobiyal
duyarlılığının belirlenmesi. Ankara Üniv Vet Fak
Derg. 64, 321-328.
- 6. Beaz-Hidalgo R, Lopez-Romalde S, Toranzo AE.,
Romalde JL, (2008). Polymerase Chain Reaction amplification
of Repetitive Intergenic Consensus and Repetitive
Extragenic Palindromic Sequences for molecular typing
of Pseudomonas anguilliseptica and Aeromonas salmonicida.
J Aquat Anim Health. 20, 75-85.
- 7. CLSI, (2014). Performance standards for antimicrobial
susceptibility testing. Twenty-Fourth Informational
Supplement. Clinical Laboratory Standards Institute,
Wayne, USA, M100-S24, 230s.
- 8. Colorni A, Paperna I, Gordin H, (1981). Bacterial infections
in gilt-head sea bream Sparus aurata cultured at
Elat. Aquaculture, 23, 257-267.
- 9. Cunningham CO, (2002). Molecular diagnosis of fish and
shellfish diseases: present status and potential use in disease
control. Aquaculture. 206, 19-55.
- 10. Frans I, Dierckens K, Crauwels S, Assche AV, Leisner
J, Larsen MH, Michiels CW, Willems KA, Lievens B,
Bossier P, Rediers H, (2013). Does virulence assessment
of Vibrio anguillarum using Sea Bass (Dicentrarchus
labrax) Larvae correspond with genotypic and phenotypic
characterization? Plos One. 8(8), e70477.
- 11. Frans I, Michiels CW, Bossier P, Willems KA, Lievens B,
Rediers H, (2011). Vibrio anguillarum as a fish pathogen:
virulence factors, diagnosis and prevention. J Fish Dis. 34,
643-661.
- 12. Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı. İyi Üretim
Uygulamaları Sertifikası (GMP) Bakanlığımızca Verilmiş
veya Kabul Edilmiş Pazarlama İzinli Veteriner Biyolojik
Ürünler. https://www.tarim.gov.tr/Konular/Veteriner-
Hizmetleri/Veteriner-Saglik-Urunleri. İnternet Erişimi:
15.03.2018.
- 13. Gonzalez SF, Osorio CR, Santos Y, (2003). Development
of a PCR-based method for the detection of Listonella anguillarum
in fish tissue and blood samples. Dis Aquat Org.
55, 109-115.p
- 14. Grisez L. Ceusters R. Ollevier F, (1991). The use of API
20E for the identification of Vibrio anguillarum and V. ordalii.
J Fish Dis. 14, 359-365.
- 15. Harrell LW, Novoty AJ, Schiewe MH, Hodgins HO,
(1976). Isolation and description of two vibrios pathogenic
to Pacific salmon in Puget Sound, Washington. Fish
Bullet. 74, 447-449.
- 16. Hickey ME, Lee J-L, (2018). A comprehensive review of
Vibrio (Listonella) anguillarum: ecology, pathology and
prevention. Rev Aquacult. 10, 585-610.
- 17. Hong GE, Kim DG, Bae JY, Ahn SH, Bai SC, Kong IS,
(2007). Species-specific PCR detection of the fish pathogen,
Vibrio anguillarum, using the amiB gene, which
encodes N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase. FEMS
Microbiol Lett. 269, 201-206.
- 18. Huang Y, Runge M, Michael GB, Schwarz S, Jung A,
Steinhagen D, (2013). Biochemical and molecular heterogeneity
among isolates of Yersinia ruckeri from rainbow
trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) in north west
Germany. BMC Vet Res. 9, 215
- 19. Korun J, Gokoglu M, (2007). Listonella anguillarum isolated
from hatchery cultured red porgy Pagrus pagrus in
Turkey. J Anim Vet Adv. 6, 823-827.
- 20. Kuhn I, Austin DA, Austin B, Blanch AR, Grimont PAD,
Jofre J, Koblavi S, Larsen JL, Mollby R, Pedersen K,
Tiainen T, Verdonck L, Swings J, (1996). Diversity of
Vibrio anguillarum isolates from different geographical
and biological habitats, determined by the use of a
combination of eight different typing methods. Syst Appl
Microbiol. 19, 442-450.
- 21. MacDonell MT, Colwell RR, (1985). Phylogeny of the
Vibrionaceae, and recommendation for two new genera,
Listonella and Shewanella. Syst Appl Microbiol. 6, 171-
182.
- 22. Noguerola I. Blanch AR, (2008). Identification of Vibrio
spp. with a set of dichotomous keys. J Appl Microbiol. 105,
175-185.
- 23. Onuk EE, Çiftci A, Fındık A, Çiftci G, Altun S, Balta F,
Özer S, Çoban AY, (2011). Phenotypic and molecular
characterization of Yersinia ruckeri isolates from Rainbow
Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) in Turkey.
Berl Munch Tierarztl Wochenschr. 124 (7-8), 320-328.
- 24. Öztürk RÇ, Altınok İ, (2014). Bacterial and viral fish diseases
in Turkey. Turk J of Fish Aquat Sci. 14, 275-297.
- 25. Popovic TN, Coz-Rakovac R, Strunjak-Perovic I, (2007).
Commercial phenotypic tests (API 20E) in diagnosis of
fish bacteria: a review. Vet Med. 52(2), 49-53.
- 26. Ravelo C, Magarinos B, Lopez-Ramade S, Toranzo AE,
Romalde JL, (2003). Molecular fingerprinting of fishpathogenic
Lactococcus garvieae strains by Random
Amplified Polymorphic DNA Analysis. J Clin Microbiol.
41(2), 751-756.
- 27. Santos Y, Romalde JL, Bandín I, Magarinos B, Nunez S,
Barja JL, Toranzo AE, (1993). Usefulness of the API-20E
system for the identification of bacterial fish pathogens.
Aquaculture. 116(2-3), 111-120.
- 28. Schiewe MH, Trust TJ, Crosa JH, (1981). Vibrio ordalii
sp.nov.: a causative agent of vibriosis in fish. Curr
Microbiol. 6, 343-348.
- 29. Tanrikul TT, (2007). Vibriosis as an epizootic disease of
rainbow trout (Onchorhynchus mykiss) in Turkey. Pak J
Biol Sci. 10, 1733-1737.
- 30. Tanrikul TT, Cagirgan H, Toksen E, (2004). Levreklerden
(Dicentrarchus labrax L., 1758) izole edilen vibrio türlerinin
API 20E yöntemiyle identifikasyonu. EÜ Su
Ürünleri Dergisi. 21, 243-247.
- 31. Tanrikul TT, Gultepe N, (2011). Mix infections in rainbow
trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) Lactococcus
garvieae and Vibrio anguillarum O1. J Anim Vet Adv. 10,
1019-1023.
- 32. Tekerekoglu MS, Ay S, Otlu B, Çiçek A, Kayabaş Ü,
Durmaz R, (2007). Molecular epidemiology of methicillin-
resistant Staphylococcus aureus isolates from clinical
specimens of patients with nosocomial infection: are there
unnoticed silent outbreaks? New Microbiol. 30, 131-137.
- 33. Versalovic J, Koeuth T, Lupski R, (1991). Distribution
of repetitive DNA sequences in eubacteria and application
to fingerprinting of bacterial genomes. Nuc Acid Res.
19(24), 6823-6831.
- 34. Vaseeharan B, Hussian MR, Chen JC, (2008). RpoN gene,
RAPD profile, antimicrobial resistance and plasmids
of Vibrio anguillarum isolates from vibriosis infected
Penaeus monodon. Lett Appl Microbiol. 47, 380-385.
- 35. Xiao P, Mo ZL, Mao YX, Wang CL, Zou YX, Li J, (2009).
Detection of Vibrio anguillarum by PCR amplification of
the empA gene. J Fish Dis. 32, 293-296.