İTHAL AYÇİÇEĞİ (Helianthus annuus L.) TOHUMLARINDA Plasmopara halstedii (Farl.)Berl. & De Toni)’ NİN VARLIĞININ MOLEKÜLER YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI

Öz Özellikle, tohum kaynaklı olan ve tohumla taşınabilen etmenlerin hızlı tanılanması ve bunların kontrol altına alınması sağlıklı bir ürün elde etmenin ilk aşamasını oluşturmaktadır.  Bu çalışmanın amacı, ithalat aşamasında analiz şartı olan tohum kaynaklı Plasmopara halstedii (Farl.) Berl. & De Toni)’nin ayçiçeği tohumundaki varlığının klasik yöntemlere göre çok daha avantajlı moleküler yöntemler kullanılarak optimizasyonunun gerçekleştirilmesidir. Klasik PCR (agaroz jel elektroforez) ile ilgili hesaplamaları EPPO Standart Protokolleri Appendix 2 ve Real Time PCR (hidroliz probları) ile ilgili hesaplamalar ise EPPO Standart Protokolleri Appendix 3 referans alınarak optimize edilmiştir. Ayrıca, EPPO Standart Protokollerinde yer almayan Real time PCR (SyberGreen) çalışmasında ise, SyberGreen Mastermix kit protokolü esas alınarak optimize edilmiştir. Böylece, ülkemiz karantina laboratuarları içerisinde her üç moleküler protokülün daha uygulanabilir olması sağlanmıştır. Ayrıca, bu optimizasyon ile etmenin ayçiçeği tohumundan direkt tespitine yönelik ilk moleküler çalışma da gerçekleştirilmiştir. 

___

Kaynaklar Berg T., Tesoriero L. and Hailstones D.L., 2005, PCR-based detection of Xanthomonas campestrispathovars in Brassica seed. Plant Pathology Volume 54, Issue 3 June 2005, 416–427pp.

Bitki Karantinası Yönetmeliği, 2011, 03 Aralık 2011, Resmi Gazete Sayı: 28131.

Bonants, P.J.M., Schoen, C., van der Wolf, J.M. and Zijlstra, C., 2001, Developments in detection of plant pathogens and other plant-related organisms: Detection in the past detection in the future. In: Proceedings of the 53th International Symposium of Crop Protection, Gent, Belgium, May 8th 2001. Mededelingen Faculteit Landbouwkundige en Toegepaste Biologische Wetenschap, Universiteit van Gent, 66: 25–37pp.

Bouterige, S., Robert, R., Bouchara, J.P., Marot-Leblond, A., Molinero, V. and Senet, J.M., 2000, Production and characterization of two monoclonal antibodies specific for Plasmopara halstedii. Applied and Environmental Microbiology, 33 ref.66(8):3277-3282pp.

Erkan, S., 1998, Tohum Patolojisi, EÜ Zir.Fak.Bitki Koruma Bölümü Doktora Programı Ders Kitabı 6-40s.

Ioos, R., Laugustin, L., Rose, S., Tourvieille, J. and Tourvieille de Labrouhe, D, 2007, Development of a PCR test to detect the downy mildew causal agent Plasmopara halstedii in sunflower seeds. Plant Pathology 56, 209-218pp.

Ioos, R. and Iancu, G., 2008, European collaborative studies for the validation of PCR-based detection tests targeting regulated fungi and oomycetes. Bulletin OEPP/EPPO (2008) Bulletin 38, 198–200pp.

Ioos, R., Fourrier, C., Wilson, V., Webb, K., Jean-Luc Schereffer, and Tourvieille de Labrouhe, D, 2012, An optimized duplex real-time PCR tool for sensitive detection of the quarantine oomycete Plasmopara halstedii in sunflower seeds. Phytopathology 102:908-917pp.

Innis, M.A. and Gelfand.,1990, Optimization of PCR’s in PCR Protocols. Academic, San Diego, CA, 3-12pp.

Kahya, S., Buyukcangaz, E. ve Carlı, K.T., 2013, Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) Optimizasyonu. Uludag Univ. J. Fac. Vet. Med. 32 (2013), 1: 31-38. Moinard, J., Mestries, E. and Penaud, A., 2006, An overview of sunflower downy mildew. Phytoma – La Défense des Végétaux 589:34–38pp.

Mullis, KB., 1990, The unusual origin of the polymerase chain reaction. Scientific American. 1990; 262(4):56–61. 64–5. [PubMed]

Noble, M., 1957, The transmission of plant pathogens by seed In:Horton-Smith C. (ed.) Biological aspects of Transmission of Diseases Oliver & Body, Edinburg, UK, a,81-85pp

Singleton, L., Mihail, J.D., Rush, C.M., 1992. Methods for Research on Soilborne Phytopathogenic Fungi, APS Press, St. Paul, MN.

Zazzerini, A. and Raggi, V., 1974, Plasmopara helianthi in sunflower seeds, transmission of the disease and germination capacity of infected seeds. Sementi Elette 20(5):21-25. “alınmıştır” Review of Plant Pathology,1976. 55(2):150p.

Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1018-8851
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1964
  • Yayıncı: Prof. Dr. Banu YÜCEL
Sayıdaki Diğer Makaleler

Domat Zeytin Çeşidinde Meyve - Yaprak Besin Elementleri Değişimlerinin İncelenmesi

Nurdan Zincircioğlu

Meloidogyne incognita ırk 2'nin Farklı İnokulasyon Yoğunluklarının Bazı Dayanıklı Biber Hatlarında Reaksiyonu

Fatma Gül GÖZE ÖZDEMİR, Gülsüm UYSAL

Effects of Chemical Fruit Thinning on Oil Yield and Quality in ‘Gemlik’ Olive (Olea europaea L.)

Murat İsfendiyaroğlu, Zekeriya Çigdem, Elmas Özeker

Narın Hasat Sonrası Hastalıklarına Karşı Hava İle Ön Soğutma ve Ozon Uygulamalarının Etkisi

Kadir İLHAN

İTHAL AYÇİÇEĞİ (Helianthus annuus L.) TOHUMLARINDA Plasmopara halstedii (Farl.)Berl. & De Toni)’ NİN VARLIĞININ MOLEKÜLER YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI

Gülenay YILMAZ, Necip TOSUN

Samsun Ekolojik Koşullarında Bazı Ketencik [Camelina sativa (L.) Crantz.] Genotiplerin Önemli Tarımsal Karakterlerinin Belirlenmesi

Orhan KURT, Merve GÖRE

Farklı Bölge, Çeşit Ve Üretim Sistemleri İle Elde Edilen Zeytinyağlarının Acılık İndekslerinin Ve Toplam Fenol Değerlerinin Belirlenmesi

Didar SEVİM, Oya KÖSEOĞLU, Mehmet ULAŞ, Durmuş ÖZDEMİR

Türkiye’de Kırsal Kadınların Aile İşletmelerinde Organik Tarımı Benimseme Olasılığını Etkileyen Faktörler

Buket KARATURHAN, Ayşe UZMAY, Gökçe KOÇ

Yaprak lahana (Brassica oleracea L. var. acephala) Yapraklarının Fitokimyasal İçeriği ve Antioksidan Aktivitenin Mevsimsel Değişimi

Nazan ÇÖMLEKÇİOĞLU, Mehtap KUTLU

Farklı Azot ve Fosfor Seviyelerinin Horozibiği (Amarantus mantegazzianus)’nde Tane Verimi ve Bazı Verim Özelliklerine Etkisi Üzerine Bir Ön Araştırma

Zeynep DUMANOĞLU, Hakan GEREN