Klinik Örneklerden İzole Edilen ID Staphylococcus aureus Suşlarının Metisilin Direncinin Belirlenmesi ve Antibiyotik Duyarlılıklarının Araştırılması
Metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) suşları tedavi seçeneklerinin kısıtlılığı ve infeksiyon kontrol önlemlerinin maliyeti nedeniyle tüm dünyada ciddi bir sağlık sorunu haline gelmiştir. Bu çalışmanın amacı, çeşitli klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının metisilin direncinin yıllar içindeki değişimini ve antibiyotik duyarlılıklarını belirlemektir. Çalışmaya Ağustos 2015-Aralık 2018 tarihleri arasında hastanemiz Mikrobiyoloji Laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden elde edilen ve tekrar izolatı olmayan toplam 197 S.aureus suşu dâhil edilmiştir. Bakteri identifikasyonu için matriks aracılı lazer dezorbsiyon iyonizasyon - uçuş zamanlı kütle spektrometresi (MALDI-TOF) (VITEK-MS, bioMérieux, Fransa), antibiyotik duyarlılığının belirlenmesinde VITEK 2 otomatize sistemi (bioMérieux, Fransa) kullanılmıştır. Suşların antibiyotik duyarlılığı, 2015 senesi için Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), 2016 ve sonrası için European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) kriterlerine göre değerlendirilmiştir. S.aureus suşlarının % 79’u servis, % 21’i poliklinik hastalarından izole edilmiştir. Üç yılda izole edilen toplam 197 S.aureus suşunun 47’si (% 24) metisilin dirençli, 150’si (% 76) metisilin duyarlı olarak tanımlanmıştır. Metisilin direnci 2016 yılında % 5.5, 2017’de % 21.3 ve 2018 yılında % 26.4 saptanmış ve direncin yıllar içinde giderek arttığı izlenmiştir. MRSA izolatları en sık yoğun bakım ünitesi’nden gelen örneklerden elde edilmiştir. Suşların hiçbirinde vankomisin ve linezolid direnci saptanmazken, bir MRSA izolatında otomatize sistem ve gradiyent test ile teikoplanin direnci tespit edilmiştir. Fusidik asitin duyarlılığı hem MSSA (% 97) hem de MRSA suşlarında (% 89) oldukça yüksek bulunmuştur. Sonuç olarak, çeşitli klinik örneklerden izole ettiğimiz S.aureus suşlarında vankomisin ve linezolid direncine rastlanmamıştır. Hastanemizde saptadığımız metisilin direnci ülkemiz ortalama değerlerinde bulunmakla birlikte, yoğun bakım ünitesinde yatan hasta sayısının artmasına paralel olarak üç yıl içinde ciddi bir artış göstermiştir. Bu yüzden enfeksiyon kontrolü ile ilgili daha fazla önlem alınmasının, uygun antibiyotiğin kullanımı açısından direnç profilinin belli aralıklarla takip edilmesinin ve her hastanenin kendi antibiyotik kullanım politikasını oluşturmasının önemli olduğu düşüncesindeyiz.
Determination of Meticillin Resistance and Investigation of Antibiotic Susceptibility of Staphylococcus aureus Strains Isolated from Clinical Samples
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains have become a serious health problem worldwide due to the limited treatment options and the cost of infection control measures. The aim of this study was to determine the antibiotic susceptibility and the change in methicillin resistance of S.aureus strains isolated from various clinical specimens over the years. A total of 197 S.aureus strains (non-recurrent) obtained from various clinical specimens in Üsküdar State Hospital Microbiology Laboratory between August 2015 and December 2018 were included in the study. Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF) (VITEK-MS, bioMérieux, France) was used to identify microorganisms. For antibiotic susceptibility tests (AST) VITEK 2 automated system (bioMérieux, France) was used. When the AST results were evaluated, Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) breakpoints were used for the year 2015 and European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) breakpoints were used for and after 2016. Of the S.aureus strains, 21 % were isolated from outpatients and 79 % from hospitalized patients. Of the 197 S.aureus strains isolated in three years, 47 (23 %) were identified as methicillin resistant (MRSA) and 150 (73 %) were identified as methicillin susceptible (MSSA). Methicillin resistance was 5.5 % in 2016, 21.3 % in 2017 and 26.4 % in 2018, pointing to a significant increase over the years. MRSA isolates were most frequently detected in samples from the intensive care unit. While vancomycin and linezolid resistance was not detected in any of the strains, teicoplanin resistance was found in an MRSA isolate by automated system and gradient test. The susceptibility to fusidic acid was very high in both MSSA (97 %) and MRSA strains (89%). In conclusion, vancomycin and linezolid resistance was not found in S. aureus strains isolated from various clinical specimens. Although methicillin resistance detected in our hospital is within the average values of our country, it has rised significantly within three years consistent with the increasing number of inpatients in intensive care unit.Therefore, we consider that it is important to take more precautions for infection control, to track resistance profiles periodically for the use of effective antibiotics and to establish each hospital’s own antibiotic usage policy.
___
- 1. Coşkun MV, Alper Y, Uyanık MH, Yazgı H. Sensitivity
of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains
to fusidic acid and other non-β-lactam antibiotics.
Klimik Derg. 2019;32(1):52-6.
https://doi.org/10.5152/kd.2019.12
2. Calık Z, Karamese M, Acar O. Prevalen
ce and
antimicrobial-resistance of Staphylococcus aureus
Isolated from blood culture in university hospital,
Turkey. Glob J Infect Dis Clin Res. 2015;1(1):10-3.
- 3. Çıkman A, Aydın M, Gülhan B, et al. Metisiline
dirençli Staphylococcus aureus izolatlarının
antibiyotik direnci ve azalmış vankomisin duyarlılığının
araştırılması: çok merkezli bir çalışma. Mikrobiyol
Bul. 2015;49(2):240-8.
https://doi.org/10.5578/mb.9230
- 4. Çıragil P. Ülkemizde yoğun bakım ünitelerinde
antimikrobiyal direnç sorunu. Türk Mikrobiyol Cem
Derg. 2016;46(3):97-104.
- 5. Doğan M, Feyzioğlu B, Baykan M. On yıllık dönemde
S.aureus suşlarının antibiyotik direnç durumundaki
değişim. Abant Med J. 2014;3(3):237-41.
https://doi.org/10.5505/abantmedj.2014.74946
- 6. European Centre for Disease Prevention and Control.
Antimicrobial resistance surveillance in Europe 2015.
Annual Report of the European Antimicrobial
Resistance Surveillance Network (EARS-Net).
Stockholm: ECDC; (2017). doi 10.2900/6928.
- 7. Flamm RK, Mendes RE, Hogan PA, Streit JM, Ross JE,
Jones RN. Linezolid Surveillance Results for the
United States (LEADER Surveillance Program 2014).
Antimicrob Agents Chemother. 2016;60(4):2273-80.
https://doi.org/10.1128/AAC.02803-15
- 8. Göktaş U, Yaman G, Karahocagil MK ve ark. Anestezi
yoğun bakım ünitesinde hastane enfeksiyonu
etkenleri ve direnç profilinin değerlendirilmesi. J Turk
Soc Intens Care. 2010;8(1):13-7.
- 9. Ippolito G, Leone S, Lauria FN, Nicastri E, Wenzel RP.
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: the
superbug. Int J Infect Dis. 2010;14(Suppl 4):S7-11.
https://doi.org/10.1016/j.ijid.2010.05.003
- 10. Lakhundi S, Zhang K. Methicillin resistant
Staphylococcus aureus: molecular characterization,
evolution and epidemiology. Clin Microbiol Rev.
2018;31(4):e00020-18.
https://doi.org/10.1128/CMR.00020-18
- 11. Nazik S, Cingöz E , Şahin AR, Güler S. Kan kültürlerinden
izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında
metisilin direncinin yıllara göre değişimi. Kocaeli
Med J. 2018;7(1):32-6.
https://doi.org/10.5505/ktd.2018.94824
- 12. Özel Y, Büyükzengin KB, Yavuz MT. Klinik örneklerden
izole edilen metisiline dirençli ve duyarlı Staphylococcus
aureus suşlarının antibiyotik direnç profilinin
araştırılması. ANKEM Derg. 2017;31(2):41-7.
- 13. Rağbetli C, Parlak M, Bayram Y, Guducuoglu H,
Ceylan N. Evaluation of antimicrobial resistance in
Staphylococcus aureus Isolates by years. Interdiscip
Perspect Infect Dis. 2016;2016:9171395.
https://doi.org/10.1155/2016/9171395
- 14. Sievert DM, Ricks P, Edwards JR et al. National
Healthcare Safety Network (NHSN) Team and
Participating NHSN Facilities. Infect Control Hosp
Epidemiol. 2013;34(1):1-14.
https://doi.org/10.1086/668770
- 15. Sipahi OR, Uysal S, Aydemir SŞ, et al. Antibacterial
resistance patterns and incidence of hospital
acquired Staphylococcus aureus bacteremia in a
tertiary care educational hospital in Turkey:a
perspective from 2001 to 2013. Turk J Med Sci.
2017;47(4):1210-5.
https://doi.org/10.3906/sag-1607-63
- 16. Song JH, Hsueh PR, Chung DR et al. ANSORP Study
Group. Spread of methicillin-resistant Staphylococcus
aureus between the community and the hospitals in
Asian countries: an ANSORP study. J Antimicrob
Chemother. 2011;66(5):1061-9.
https://doi.org/10.1093/jac/dkr024
- 17. Şen P, Demirdal T, Özdemir R, et al. Antimicrobial
resistance in Staphylococci: a 6-year-evaluation.
Medeniyet Medical Journal. 2017;32(4):205-11.
https://doi.org/10.5222/MMJ.2017.205
- 18. Şirin MC, Ağuş N, Yılmaz N, et al. Klinik örneklerden
izole edilen Staphylococcus aureus suşlarinda
antibiyotik direnci. Journal of Clinical and Analytical
Medicine. 2015;6(Suppl 6):859-63.
- 19. Tekin A, Dal T, Deveci Ö, et al. In vitro susceptibility to
methicillin, vancomycin and linezolid of staphylococci
isolated from bloodstream infections in eastern
Turkey. Braz J Microbiol. 2014;45(3):829-33.
https://doi.org/10.1590/S1517-83822014000300010
- 20. Telli M, Okulu Y, Patı Y. Staphylococcus aureus
Suşlarında metisiline direnç oranındaki değişim:
metisiline direnç azalıyor mu? ANKEM Derg.
2018;32(3):103-8.
- 21. The European Committee on Antimicrobial
Susceptibility Testing. New definitions of S, I and R.
http://www.eucast.org/newsiandr/ (erişim tarihi:
12.04.2019)
- 22. The European Committee on Antimicrobial
Susceptibility Testing. Resistance mechanisms.
http://www.eucast.org/resistance_mechanisms/
- 23. Ulusal Antimikrobiyal Direnç Surveyans Sistemi,
Türkiye Halk Sağlığı Kurumu, Sağlık Bakanlığı Ankara.
http://uamdss.thsk.gov.tr
- 24. Yıldız Ö, Çoban AY, Şener AG, et al. Antimicrobial
susceptibility and resistance mechanisms of
methicillin resistant Staphylococcus aureus isolated
from 12 Hospitals in Turkey, Ann Clin Microbiol
Antimicrob. 2014;13:44.
https://doi.org/10.1186/s12941-014-0044-2
- 25. Yılmaz EŞ, Aslantaş Ö. Antimicrobial resistance and
underlying mechanisms in Staphylococcus aureus
isolates. Asian Pac J Trop Med. 2017;10(11):1059-64.
https://doi.org/10.1016/j.apjtm.2017.10.003
- 26. Yüksekkaya Ş, Opuş A, Güvenç Hİ, et al. 2009-2013
yılları arasında Konya Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde
kan kültüründen izole edilen Staphylococcus
aureus suşlarının antimikrobiyal ajanlara
duyarlılıklarının değerlendirilmesi. ANKEM Derg.
2017;31(1):1-6.
- 27. Zencir M, Arı A, Yılmaz N, et al. Metisiline dirençli
Staphylococcus aureus suşlarının antibiyotiklere
duyarlılığı, hastaların klinik özellikleri ve mortaliteyi
etkileyen faktörler. ANKEM Derg. 2016;30(1):18-23.