Ayşe Rüveyda UĞUR, HATİCE TÜRK DAĞI, İnci TUNCER, Duygu FINDIK, UĞUR ARSLAN

İdrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz oranı

Bakteriyel infeksiyonların ilk sıralarında üriner sistem infeksiyonları yer almaktadır ve bu infeksiyonlardan en sık Escherichia coli izole edilmektedir. Antibiyotiklere karşı gelişen direncin artması ve yayılması bütün dünyada olduğu gibi ülkemizde de büyük bir sorundur. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üretimi, E.coli’nin de içinde bulunduğu Enterobacteriaceae üyelerinin geliştirdiği en önemli direnç mekanizmalarından biridir. Bu çalışmanın amacı üriner sistem infeksiyonu ön tanılı hastaların laboratuvarımıza gönderilen idrar örneklerinden izole edilen E.coli suşlarında GSBL üretimini araştırmak ve GSBL üreten ve üretmeyen suşlar arasındaki antibiyotik direnç profilini karşılaştırmaktır. İdrar örneklerinden izole edilen E.coli suşlarının antibiyotik duyarlılık profili ve GSBL üretimi retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Bakteri identifikasyonu konvansiyonel yöntemlerle yapılmış, suşların antibiyotik duyarlılıkları Clinical and Laboratory Standards Institute önerileri dikkate alınarak Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile saptanmıştır. GSBL üretimi, çift disk sinerji testi ile belirlenmiştir. Poliklinik hastalarından 276, yatan hastalardan 135 olmak üzere toplam 411 anlamlı E. coli üremesi belirlenmiştir. GSBL üretimi, yatan hastalarda % 44, poliklinik hastalarında % 26 ve toplam % 32 olarak saptanmıştır. En etkili antibiyotiklerin GSBL üreten suşlarda sırasıyla meropenem (% 95), nitrofurantoin (% 82), amikasin (% 77) ve netilmisin (% 72); GSBL üretmeyen suşlarda ise meropenem, sefepim, seftriakson, seftazidim, ve sefotaksim (% 100), amikasin (% 99), netilmisin (% 97) ve piperasilin-tazobaktam (% 96) olduğu belirlenmiştir. Tüm suşların en yüksek direnç gösterdiği antibiyotikler ise ampisilin, sefalotin ve sefuroksim olarak saptanmıştır. Duyarlılık sonuçları GSBL üretimi açısından karşılaştırıldığında, GSBL üreten E.coli suşlarında direnç oranlarının üretmeyen suşlara oranla daha yüksek olduğu görülmüştür (p

Antibiotic susceptibility and extended spectrum beta-lactamase rate of Escherichia coli strains isolated from urine cultures

Urinary system infections are ranked as the most seen ones among bacterial infections, and from these infections, Escherichia coli is the most isolated organism. The increasing rate and spread of resistance against antibiotics are a serious problem in our country as well as all over the world. Extended spectrum beta-lactamase (ESBL) production is one of the most significant resistance mechanisms produced by Enterobacteriaceae members included E.coli. The aim of this study is to investigate the production of ESBL in E.coli strains isolated from urinary specimens of patients with a prediagnosis of urinary system infection, and to compare differences of antibiotic resistance profiles between ESBL producing and nonproducing strains. Antibiotic susceptibility profiles and ESBL production of E.coli strains isolated from urine samples were evaluated retrospectively. Bacterial identification was performed by conventional methods and antibiotic susceptibility testing was investigated by Kirby-Bauer disk diffusion method according to Clinical and Laboratory Standards Institute criteria. ESBL production was determined by double-disk synergy test. A total of 411 significant growth of E.coli, were identified belonging to 276 outpatients and 135 inpatients. The prevalence of ESBL production in inpatients was found to be 44 %, in outpatients 26 %, and in total 32 %. The antibiotics to which ESBL producing strains are most susceptible were as follows: meropenem (95 %), nitrofurantoin (82 %), amikacin (77 %) and netilmicin (72 %). The antibiotics to which ESBL nonproducing strains are most susceptible were as following: meropenem, cefepime, ceftriaxone, ceftazidime, cefotaxime (100 %), amikacin (99 %), netilmicin (97 %) and piperacillin-tazobactam (96 %). The antibiotics to which all strains are most resistant were ampicillin, cephalothin and cefuroxime. Comparing the results of sensitivity in terms of ESBL production, resistance rates were higher in ESBL producing E.coli than in nonproducing strains (p<0.05). In conclusion, the spread of increasing resistance must be surveyed, and national antibiotic usage policies must be reorganized according to data obtained from these studies.

PDF

___

1. Ağca H. Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üretimleri ve antibiyotik duyarlılık oranları, DEÜ Tıp Fak Derg 2011;25(3):169-73.
2. Badura A, Feierl G, Kesler HH et al. Resistant bacteria in Southeastern Austria, Emerg Infect Dis 2007;13(8):1256-7. http://dx.doi.org/10.3201/eid1308.070283 PMid:17953107 PMCid:2828092
3. Bradford PA. Extended-spectrum beta-lactamases in the 21st century: characterization, epidemiology, and detection of this important resistance threat, Clin Microb Rev 2001;14(4):933-51. http://dx.doi.org/10.1128/CMR.14.4.933-951.2001 PMid:11585791 PMCid:89009
4. Chomarat M. Resistance of bacteria in urinary tract infections, Int J Antimicrob Agents 2000;16(4):483-7. http://dx.doi.org/10.1016/S0924-8579(00)00281-8
5. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-first informational supplement, CLSI document M100-S21, CLSI, Wayne (2011).
6. Cetin M, Ucar E, Güven O, Ocak S. Community-acquired urinary tract infections in Southern Turkey: etiology and antimicrobial resistance, Clinical Nephrology 2009;71(1):30-5. PMid:19203547
7. Demir N. Gram negatif bakterilerde genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üretimine katkıda bulunan çeşitli risk faktörlerinin araştırılması, (S.B. Dr. Lütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi, İstanbul) Uzmanlık Tezi, (2006).
8. Güdücüoğlu H, Baykal S, İzci H, Berktaş M. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotik direnci, ANKEM Derg 2007;21(3):155-60.
9. Gur D, Hascelik G, Aydin N et al. Antimicrobial resistance in Gram-negative hospital isolates: Results of the Turkish HITIT-2 Surveillance Study of 2007, J Chemother 2009;21(4):383-9. PMid:19622455
10. Hooton TM, Besser R, Foxman B, Fritsche TR, Nicolle LE. Acute uncomplicated cystitis in an era of increasing antibiotic resistance: A proposed approach to empirical therapy, Clin Infect Dis 2004;39(1):75-80. http://dx.doi.org/10.1086/422145 PMid:15206056
11. Iraz M. Malatya Devlet Hastanesi’nde klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz pozitifliği ile antibiyotik duyarlılığı, ANKEM Derg 2009;23(4):161-5.
12. Karlowsky JA, Lagacé-Wiens PRS, Simner PJ et al. Antimicrobial resistance in urinary tract pathogens in Canada from 2007 to 2009: CANWARD Surveillance Study, Antimicrob Agents Chemother 2011;55(7):3169-75. http://dx.doi.org/10.1128/AAC.00066-11 PMid:21537027 PMCid:3122429
13. Korten V, Ulusoy S, Zarakolu P, Mete B. Antibiotic resistance surveillance over A 4-year period (2000-2003) in Turkey: Results of the MYSTIC Program, Diagn Microbiol Infect Dis 2007;59(4):453-7. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2007.06.016 PMid:17888609
14. Mengeloğlu FZ, Demircan F, Oduncu MK. İdrar kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli izolatlarının fosfomisine karşı in-vitro duyarlılıklarının değerlendirilmesi, ANKEM Derg 2011;25(2):99-102.
15. Narayanaswamy A, Mallika M. Prevalence and susceptibility of extended spectrum beta-lactamases in urinary isolates of Escherichia coli in a tertiary care hospital, Chennai-South India, Internet J Med Update 2011;6(1):39-43.
16. Naz H, Çevik FG, Aykın N. Hastane kökenli üriner sistem infeksiyonları ve antibiyotik direnç profili, Dicle Tıp Derg 2009;36(2):85-90.
17. Oteo J, Lázaro E, de Abajo FJ, Baquero F, Campos J. Antimicrobial-resistant invasive Escherichia coli, Spain, Emerg Infect Dis 2005;11(4):546-53. http://dx.doi.org/10.3201/eid1104.040699 PMid:15829192 PMCid:3320321
18. Pullukcu H, Aydemir Ş, Taşbakan M, Çilli F, Tunger A, Ulusoy S. İdrar kültürlerinden soyutlanan genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia coli kökenlerinin fosfomisin, siprofloksasin, amikasin ve trimetoprim-sulfametok-sazol’e duyarlılıkları, Turk J Med Sci 2008;38(2): 175-80.
19. Ruppé E, Hem S, Lath S et al. CTX-M b-Lactamases in Escherichia coli from community-acquired urinary tract infections, Cambodia, Emerg Infect Dis 2009;15(5):741-8. http://dx.doi.org/10.3201/eid1505.071299 PMid:19402960 PMCid:2687024
20. Sağlam HS, Öğütlü A, Demiray V, Karabay O. Üriner enfeksiyonlarda toplum kökenli Escherichia coli’nin yeri ve gelişen antibiyotik direnci, Nobel Med 2012;8(1):67-71.
21. Stamm WE, Norrby RS. Urinary tract infections: Disease panorama and challenges, J Infect Dis 2001;183(1):1-4. http://dx.doi.org/10.1086/318850 PMid:11171002
22. Türk Dağı H. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz sıklığı ve antibiyotik direnç oranları, Türk Klin Lab Derg 2011;2(4):131-6.
23. Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliği, ANKEM Derg 2009;23(4):172-6.
24. Warren JW, Abrutyn E, Hebel JR, Johnson JR, Schaeffer AJ, Stamm WE. Guidelines for antimicrobial treatment of uncomplicated acute bacterial cystitis and acute pyelonephritis in women, Clin Infect Dis 1999;29(4):745-58. http://dx.doi.org/10.1086/520427 PMid:10589881
25. Winn WC, Allen SD, Janda WM et al. Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology, 6. baskı, s.82-3, Lippincott Williams & Wilkins, Baltimore (2006).
26. Yagi, T, Kruokawa H, Shibata N, Shibayama K, Arakawa Y. A preliminary Survey of extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in Japan, FEMS Microbiol Lett 2000;184(1):53-6. PMid:10689165