AYAKTAN BAŞVURAN HASTALARDA ÜRİNER SİSTEM İNFEKSİYONUNA NEDEN OLAN ESHERICHIA COLI VE KLEBSIELLA SPP. SUŞLARININ ÇEŞİTLİ ANTİBİYOTİKLERE DİRENÇ ORANLARININ VE GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETA-LAKTAMAZ VARLIĞININ DEĞERLENDİRİLMESİ
Üriner sistem infeksiyonlarının (ÜSİ) çoğunluğunu komplike olmayan ve toplumdan kazanılmış infeksiyonlar oluşturmaktadır. Escherichia coli ve daha az sıklıkla da Klebsiella spp. suşlarının ilk sıralarda yer alan ÜSİ etkeni oldukları bilinmektedir. Bu bakterilerin geliştirmekte olduğu direnç tüm dünya için önemli bir sorun teşkil etmektedir. Direnç oluşumundaki en önemli mekanizmalardan birisi genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üretimidir. Bu çalışmada idrar kültürlerinden izole edilen E.coli ve Klebsiella spp. suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç oranları ve GSBL varlığının, sık kullanılan antibiyotiklerdeki direnç oranına etkisi retrospektif olarak araştırılmıştır. Çeşitli polikliniklerden laboratuvarımıza gönderilen idrar örneklerinde üreyen bakterilerin tanımlanmasında konvansiyonel yöntemler ve/veya otomatize VITEK 2 Compact System (BioMérieux, Fransa) kullanılmıştır. E.coli ve Klebsiella spp. olarak tanımlanan suşların antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ve/veya otomatize VITEK 2 Compact System ile, GSBL varlığı ise kombine disk difüzyon yöntemi ile araştırılmıştır. Laboratuvarımıza çeşitli polikliniklerden toplam 29,165 idrar örneği gönderilmiş olup 2,803ünde (% 10) anlamlı bakteri üremesi saptanmıştır. Üreyen bakterilerden 2,239u (% 80) E.coli, 271i (% 10) Klebsiella spp. olarak tanımlanmıştır. Ampisilin, amoksisilinklavulanik asit, sefazolin, seftriakson ve trimetoprim-sülfametoksazol için her iki cinsin de % 20nin üzerinde direnç gösterdiği tespit edilmiş- tir. Piperasilin-tazobaktam direnci E.coli suşlarında % 19, Klebsiella spp. suşlarında % 30 olarak bulunmuştur. E.coli suşlarında % 14 olan nitrofurantoin direncinin Klebsiella spp. suşlarında % 52 olduğu görülmüştür. GSBL varlığı E.coli suşlarının % 20sinde, Klebsiella spp. suşlarının ise % 27sinde saptanmıştır. GSBL pozitif olan suşlarda antibiyotik direnç oranlarının GSBL üretmeyen suşlara göre daha yüksek olduğu tespit edilmiştir. Sonuç olarak çalışmamızda E.coli en sık saptanan etken olup, bu suşların nitrofurantoin, kinolonlar ve aminoglikozitlere % 20nin altında direnç gösterdiği belirlenmiştir. Bu nedenle bu antibiyotiklerin ampirik tedavide tercih edilebilir olduğunu düşünmekteyiz. Ancak hem antibiyotiklerin olumsuz etkileri hem de yüksek GSBL pozitifliği ve bu suşlarda antibiyotiklere artmış direnç nedeniyle tedavi öncesi kültür ve antibiyogram testi gerekli görünmektedir.
The Evaluation of Resistance Rates to Various Antibiotics and Extended Spectrum Beta-lactamase Positivity of Esherichia coli and Klebsiella spp. Strains Isolated from Outpatients with Urinary Tract Infection
Most of the urinary tract infections are uncomplicated and community acquired. Escherichia coli and less frequently Klebsiella spp. strains are known to be the most frequent microorganisms that cause urinary tract infections. Development of antimicrobial resistance in these bacteria is an important problem for the world. The most important mechanism for antibacterial resistance ise production of extended spectrum beta-lactamases (ESBL). In this study antimicrobial resistance rates of E.coli and Klebsiella spp. strains isolated from urine cultures and impact of the ESBL positivity on the resistance rate of frequently used antibiotics have been evaluated retrospectively. Conventional methods and/or automated VITEK 2 Compact System (BioMérieux, Fransa) were used for identification of bacteria obtained from urine samples coming from various clinics. Antimicrobial susceptibility of bacteria identified as E.coli and Klebsiella spp. was determined by Kirby-Bauer disk diffusion method and/or automated VITEK 2 Compact System. A total of 29,165 urine samples were sent to our laboratory from outpatients. Significant bacterial growth was detected in 2,803 (80 %) of the specimens. Of the isolated bacteria, 2,239 were identified as E.coli (80 %) and 271 were identified as Klebsiella spp. (10 %). Resistance rates of both E.coli and Klebsiella spp. were over 20 % for ampicillin, amoxicillin-clavulanic acid, cefazolin, ceftriaxone and trimethoprimsulfamethoxazole. Resistance to piperacillin-tazobactam was 19 % for E.coli, 30 % for Klebsiella spp. Nitrofurantoin resistance rate of E.coli strains were 14 % and Klebsiella spp. strains were 52 %. The prevalance of ESBL production was 20 % for E.coli and 27 % for Klebsiella spp. Antibiotic resistance rates were higher in ESBL positive strains than in ESBL negative strains. In conclusion, in our study E.coli is the most detected microorganism and for these strains nitrofurantoin, quinolones and aminoglycosides resistance rates were below 20 %. Therefore we think that these antibiotics may be used for empirical therapy. But because of antibiotics negative effects and the high ESBL positivity in E.coli strains and the increased resistance rates for the antibiotics in these strains, it seems necessary to perform culture and antibiotic susceptibility testing before therapy.
___
- 1. Allocati N, Masulli M, Alexeyev MF, Di Ilio C. Escherichia coli in Europe: An Overview, Int J Environ Res Public Health 2013;10(12):6235-54. http://dx.doi.org/10.3390/ijerph10126235
- 2. Arslan H, Azap ÖK, Ergönül Ö, Timurkaynak F. Risk factors for ciprofloxacin resistance among Escherichia coli strains isolated from communityacquired urinary tract infections in Turkey, J Antimicrob Chemother 2005;56(5):914-8. http://dx.doi.org/10.1093/jac/dki344
- 3. Ay S, İşeri LA, Duman B. İdrar örneklerinden izole edilen gram olumsuz mikroorganizmaların antibiyotiklere duyarlılıkları, İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Derg 2003;10(2):59-62.
- 4. Aykan SB, Ciftci IH. Antibiotic resistance patterns of Escherichia coli strains isolated from urine cultures in Turkey: a meta-analysis, Mikrobiyol Bul 2013;47(4):603-18. http://dx.doi.org/10.5578/mb.6383
- 5. Bayram Y, Eren H, Berktaş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriyel patojenlerin dağılımı ve GSBL pozitif ve negatif Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve diğer antimikrobiyallere duyarlılık paterni, ANKEM Derg 2011;25(4):232-6. http://dx.doi.org/10.5222/ankem.2011.232
- 6. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-first informational supplement, CLSI document M100-S21, CLSI, Wayne (2011).
- 7. Doğru A, Karatoka B, Ergen P, Aydın ÖŞ, Tigen ET. İdrar yolu enfeksiyonlarında direnç oranları: 2010 yılı verilerimiz, Turkish Journal of Urology 2013;39(4):237-43.
- 8. Eroğlu M, Koçoğlu E, Karabay O, Semerciöz A. Toplum kaynaklı üriner sistem enfeksiyonlarında izole edilen Enterobacteriaceae türlerinin bazı antibiyotiklere duyarlılıkları: geriye dönük çalış- ma, Türk Üroloji Derg 2007;33(1):100-3.
- 9. Gazi H, Sürücüoğlu S, Kurutepe S. İdrar kültürlerinden izole edilen gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç, ANKEM Derg 2007;21(1):19-22.
- 10. Giedraitiene A, Vitkauskiene A, Naginiene R, Pavilonis A. Antibiotic resistance mechanisms of clinically important bacteria, Medicina (Kaunas) 2011;47(3):137-46.
- 11. Grabe M, Bjerklund-Johansen TE, Botto H et al. Guidelines on Urological Infections, European Association of Urology (2013). http://uroweb.org/wp-content/uploads/18_ Urological-infections_LR.pdf
- 12. Gupta K, Hooton TM, Naber K et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: a 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases, Clin Infect Dis 2011;52(5):e103-20. http://dx.doi.org/10.1093/cid/ciq257
- 13. Gündüz T, Mumcuoğlu İ. İdrar örneklerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotiklere duyarlılıkları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2004;34(3):157-61.
- 14. Kahlmeter G. The ECO-SENS Project: a prospective, multinational, multicenter epidemiological survey of the prevalence and antimicrobial suspectibility of urinary tract pathogens-interim report, J Antimicrob Chemother 2000;46(Suppl 1): S15-22. http://dx.doi.org/10.1093/jac/46.suppl_1.15
- 15. Meier S, Weber R, Zbinden R, Ruef C, Hasse B. Extended-spectrum β-lactamase-producing gramnegative pathogens in community-acquired urinary tract infections: an increasing challenge for antimicrobial therapy, Infection 2011;39(4):333-40. http://dx.doi.org/10.1007/s15010-011-0132-6
- 16. Oconnell S. Management of patients with urinary disorders, Smeltzer S, Bare B, Hinkle J, Cheever K (eds). Brunner&Suddarths Textbook of Medicalsurgical Nursing, 12.baskı kitabında s.1359, Lippincott Williams & Wilkins, US (2009).
- 17. Paterson DL. Collateral damage from cephalosporin or quinolone antibiotic therapy, Clin Infect Dis 2004;38(Suppl 4):S341-5. http://dx.doi.org/10.1086/382690
- 18. Paterson DL, Bonomo RA. Extended-Spectrum β-Lactamases: a clinical update, Clin Microbiol Rev 2005;18(4):657-86. http://dx.doi.org/10.1128/CMR.18.4.657-686.2005
- 19. Rifaioğlu MM, Yıldırım A, Başok EK, Keskin SK, Özgüneş N, Tokuç R. Son dört yıl içerisinde idrar kültürlerinden izole edilen bakterilere karşı geli- şen antibiyotik direncinde değişim, Türk Üroloji Derg 2009;35(3):201-9.
- 20. Rodríguez-Bano J, Navarro MD, Romero L et al. Epidemiology and clinical features of infections caused by extended-spectrum beta-lactamaseproducing Escherichia coli in nonhospitalized patients, J Clin Microbiol 2004;42(3):1089-94. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.42.3.1089-1094.2004
- 21. Sağlam D, Durmaz S, Kılıç H, Atalay MA, Erçal BD, Şarlı Ş, Perçin D. Kan kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz sıklığı ve antibiyotik direnç paternleri, ANKEM Derg 2011;25(4):250-5.
- 22. Schito GC, Naber KG, Botto H et al. The ARESC study: an international survey on the antimicrobial resistance of pathogens involved in uncomplicated urinary tract infections, Int J Antimicrob Agents 2009;34(5):407-13. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2009.04.012
- 23. Temiz H, Akkoç H, Gül K. Laboratuvarımızda idrar kültürlerinden izole edilen gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç, Dicle Tıp Derg 2008;35(4):234-9.
- 24. Uğur AR, Türk Dağı H, Tuncer İ, Fındık D, Arslan U. İdrar kültürlerinden izole edilen Esherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz oranı, ANKEM Derg 2013;27(1):13-8.