Anadolu’da Yetişen Gundelia (Asteraceae) Taksonlarının ITS Filogenisi ve Moleküler Tarihlendirilmesi

Flora kitaplarına göre Gundelia L. monofiletik bir cins olarak bilinmektedir. Gundelia tournefortii L. cinsin tek türü olarak bilinmektedir. Çalışmamızda ITS bölgesine dayalı filogenetik analiz ve moleküler tarihleme yapmak için yeni tanımlanan türleri de kullandık. Bunlar: Gundelia aragatsi Vitek, Fayvush, Tamanyan & Gemeinholzer, Gundelia dersim Vitek, Yüce & Ergin, Gundelia munzuriensis Vitek, Yüce & Ergin, Gundelia vitekii Armağan, Gundelia komagenensis Fırat,Gundelia colemerikensis Fırat,Gundelia cilicica Fırat ve Gundelia anatolica Fırat. Adı geçen yeni türler Yürkiye'den arazi çalışmaları yaparak toplanmış ve bizim toplamalarımızın yanısıra G. tournefortii türüne ait daha önceki çalışmalarda ortaya çıkmış ITS dizileri de kullanılmıştır. Filogenetik ağaca göre, G. anatolica tüm Gundelia örneklerinden farklıdır. Daha önceki çalışmalarda toplanmış bazı G. tournefortii örnekleri G. cilicica, G. dersim ve G. colemerikensis ile birlikte kümelenmiştir. G. munzurensis G. vitekii ile grup oluşturmuştur. Gundelia komagenensis ve G. aragatsi örnekleri birbirine en yakın gruplanmışlardır. Moleküler tarihlendirmeye göre Gundelia cinsinin ayrılma zamanı 14.1 milyon yıl öncesine tarihlenmektedir

ITS Phylogeny and Molecular Dating of some Gundelia (Asteraceae) of Anatolia

Gundelia L. is known to be a monotypic genus according to the flora books. Gundelia tournefortii L. was the only species of the genus Gundelia L. In our research we used the recently introduced species: Gundelia aragatsi Vitek, Fayvush, Tamanyan & Gemeinholzer, Gundelia dersim Vitek, Yüce & Ergin, Gundelia munzuriensis Vitek, Yüce & Ergin, Gundelia vitekii Armağan, Gundelia komagenensis Fırat,Gundelia colemerikensis Fırat,Gundelia cilicica Fırat and Gundelia anatolica Firat, in order to reconstruct a phylogeny inference and molecular dating by using ITS region. The mentioned species were collected from Turkey and beside our collections, the ITS sequences belonging to G. tournefortii accessions of former studies were used in our research. According to the phylogeny inference, G. anatolica was different from all Gundelia accessions. Some G. tournefortii accessions belonging to former studies grouped with G. cilicica, G. dersim and G. colemerikensis, G. munzurensis clustered with G. vitekii. Gundelia komagenensis and G. aragatsi accessions were grouped as close relatives. According to the molecular dating the distinction of the genus Gundelia from the relative genera was around 14.1 million years ago (mya)

___

  • Anonymous. 2016. Molecular evolution, phylogenetics and epidemiology. http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree.
  • Avetisian, V. E. 1995. Gundelieae. In: A. L. Takhtajan (Ed.). Flora Armenii 9. Koeltz Scientific Books, Havlíčkův Brod. pp. 212-216.
  • Drummond, A. J., M. A. Suchard, D. Xie, & A. Rambaut. 2012. Bayesian Phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. MolecularBiology and Evolution 29: 1969-1973.
  • Feinbrun-Dothan, N. 1978. Flora Palaestina, 3. The Israel Academy of Sciences and Humanities, Jerusalem, 481 pp.
  • Firat, M. 2016. Four new species of Gundelia L. (Asteraceae) from Anatolia: G. komagenensis, G. colemerikensis, G. cilicica and G. anatolica. Vameda Ofset Press, Van, 32 pp.
  • Firat, M. 2017a. Gundelia rosea (Asteraceae), a new record for the Flora of Turkey with contributions to its systematics. Acta Biologica Turcica 30 (2): 31‒35.
  • Firat, M. 2017b. Gundelia mesopotamica (Asteraceae), a new lactiferous species from Mardin (Turkey). Acta Biologica Turcica 30 (3): 64-69.
  • Hall T. A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symp., Ser. 41: 95- 98.
  • Karis P. O., P. Eldenäs, and M. Källersjö. 2001. New evidence for systematic position of Gundelia L. With notes on delimitation of Arctoteae (Asteraceae). Taxon, 50: 105-114.
  • Kupicha, F. K. 1875. Gundelia. In: P. H. Davis (Ed.). Flora of Turkey 5. University Press, Edinburgh, pp. 325-326.
  • Nikitin, V. V. 1960. Gundelia L. In: B. K. Schischkin (Ed.). Flora Turkmenii 7. Akademiia nauk Turkmenskoĭ SSR, Institut Botaniki, Ashkhabad, p. 141.
  • Rambaut, A., and A. J. Drummond. 2007. Tracer, version 1.4. Available from http:// beast.bio.ed.ac.uk/Tracer.
  • Rechinger, K. H. 1989. Gundelia. In: K. H. Rechinger (Ed.). Flora Iranica 164. Akademische Druck- und Verlagsanstalt, Graz, pp. 107-109.
  • Sofieva, R. M. 1961. Gundelia L. In: I. I. Karjagin (Ed.). Flora Azerbajdžana 8. Azerbaijan National Academy of Sciences Press, Baku, pp. 347-348.
  • Thiers, B. 2016. Index Herbariorum: A Global Directory of Public Herbaria and Associated Staff. New York Botanical Garden’s Virtual Herbarium. http://sweetgum.nybg.org/science/ih/
  • Tremetsberger, K., Gemeinholzer, B., Zetzsche, H., Blackmore, S., Kilian, N., & Talavera, S. (2013). Divergence time estimation in Cichorieae (Asteraceae) using a fossil-calibrated relaxed molecular clock. Organisms Diversity and Evolution, 13 (1): 1-13.
  • Vasilchenko, I. T. 1961. Gundelia L. In: V. L. Komarov (Ed.). Flora SSSR, 26. Nauka Publishers, Moscow & Leningrad, p. 862.
  • Vitek, E., G. Fayvush, K. Tamanyan, and B. Gemeinholzer. 2010. New taxa of Gundelia (Compositae) in Armenia. Annalen des Naturhistorischen Museums Wien, Serie B 111: 85-99.
  • Warwick, S. I., Al-Shehbaz, I. A., Sauder, C. A., Murray, D. F., Mummenhoff, K. 2004. Phylogeny of Smelowskia and related genera (Brassicaceae) based on nuclear ITS DNA and chloroplast trnL intron DNA sequences. Annals of the Missouri Botanical Garden 91: 99–123.
  • White, T. J. T, Bruns, S. L., Taylor, J. W. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis, M. A., Gelfand, D. H., Sninsky, J. J. and White, T. J. (Ed.). PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Academic Press, Inc., New York. pp. 315–322.
ANADOLU Ege Tarımsal Araştırma Enstitüsü Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-0225
  • Yayın Aralığı: Yılda 2 Sayı
  • Başlangıç: 1991
  • Yayıncı: Ege Tarımsal Araştırma Enstitüsü
Sayıdaki Diğer Makaleler

Anadolu’da Yetişen Gundelia (Asteraceae) Taksonlarının ITS Filogenisi ve Moleküler Tarihlendirilmesi

BURCU TARIKAHYA HACIOĞLU, MEHMET FIRAT

Bazı Ketencik [Camelina Sativa (L.) Crantz] Populasyonlarından Seçilen Materyallerin Moleküler Karakterizasyonu

Humeyra YAMAN, Kubra Nur ULUM, Burcu TARIKAHYA HACIOGLU, Yusuf ARSLAN, İlhan SUBASI

Characterization, Nutritional Value and Consumption Habit of Wild Mushroom in Tigray, Northern Ethiopia

Mehari WELDEKIROS, Emiru BIRHANE, Woldegebrial ZEWELD, Sarah TEWELDEBIRHAN

Türkiye’nin Kıyı Pancarları [Beta vulgaris subsp. maritima (L.) Arcang.] Yabani Yenilebilir Pancarları ve Bahçe Pancarları

Ayfer TAN, Nese ADANACIOGLU, Sevinc KARABAK, Nurcan AYSAR, Ahmet Semsettin TAN, Lerzan AYKAS

Molecular Characterization of Materials Selected from Some Camelina [Camelina sativa (L.) Crantz] Populations

Hümeyra YAMAN, Kubra Nur ULUM, BURCU TARIKAHYA HACIOĞLU, YUSUF ARSLAN, İlhan SUBAŞI

In Vitro Plant Regeneration of Libyan Wild Plants: Edible Species (Arbutus pavarii) and Endanger Species [Haplophyllum tuberculatum (Forsk.) Juss]

Adel M ELMAGHABI, Salem HAMMUD, Elmunder ABUGNIA

Türkiye - Ege Bölgesi’nde Ekonomik Öneme Sahip Yabani Çıntar Mantarı [Lactarius deliciosus (L.) Gray]

Nese ADANACIOGLU, Ayfer TAN, Sevinc KARABAK, Nurcan GUZELSOY, Firat AYAS, Lerzan AYKAS, Tefik TAYLAN

Halophytes as a Potential Food Source

GÜL NİLHAN TUĞ, AHMET EMRE YAPRAK

Wild Edible Fruits: A Rich Source of Biodiversity

Sezai ERCİŞLİ, Halil Ibrahim SAGBAS

Foxtail lilly (Eremurus spectabilis M. Bieb.) as Priority Species of Biodiversity for Food and Nutrition Project of Turkey

Ahu CINAR, Saadet TUĞRUL AY, Fırat AYAS, Sevinç KARABAK, Nurcan GUZELSOY, Ozgul UCURUM