Diyarbakır ilinde yetişen badem ağaçlarında sorun olan kök çürüklüğü ve solgunluk hastalık etmenlerinin karakterizasyonu ve yaygınlığı

Badem (Prunus dulcis L.) Güneydoğu Anadolu Bölgesi’nin önemli ürünlerinden biridir. Dünya genelinde bademin toprak kökenli fungal hastalık etmenlerinin kayda değer önemli kayıplara sebep olduğu bildirilmiştir. Bademlerde kök çürüklüğü ve solgunluk hastalığına, toprak kaynaklı herhangi bir veya birden fazla türün yer aldığı kombinasyon neden olabilir. Diyarbakır ilinde 2017 bahar döneminde badem bahçelerinde ve fidanlıklarında sürveyler yapılmış, rastgele seçilmiş tatlı badem ağaçları/fidanları, kök-kökboğazı çürüklüğü ve solgunluk hastalıklarına neden olan fungal hastalık etmenlerinin görülme sıklığı ve yaygınlığını değerlendirmek için incelenmiştir. Zayıf gelişmiş, sararmış, solgunluk ve ölüm belirtisi gösteren şüpheli badem ağaçlarının/fidanlarının kök ve kökboğazlarından bitki örnekleri alınmıştır. Sürvey yapılan bölgelerden toplanan hastalık belirtisi gösteren bademlerin kök, kök boğazı ve gövdelerinden yapılan izolasyonlardan elde edilen izolatların patojenisiteleri, morfolojik ve moleküler yöntemlerle teşhisleri yapılmıştır. Şüpheli bitki örneklerinden yapılan izolasyonlar sonucu elde edilen izolatların dağılımına göre en sık rastlanan ve karakterize edilen toprak kaynaklı fungal hastalık etmeni, %28.9 yaygınlık ve %38.0 rastlanma sıklığı ile Fusarium oxysporum (Fusarium solgunluğu hastalığı etmeni) olup, bu hastalık etmenini %24.6 yaygınlık ve %21.5 rastlanma sıklığı ile Macrophomina phaseolina (Kömür çürüklüğü hastalığı etmeni), %19.3 yaygınlık ve %11.3 rastlanma sıklığı ile Sclerotinia sclerotiorum (Beyaz küf hastalığı etmeni) ve %16.7 yaygınlık ve %18.3 rastlanma sıklığı ile Ceratobasidium sp., (Ceratobasidium kök çürüklüğü hastalığı etmeni) takip etmiştir. Bildiğimiz kadarıyla, Ceratobasidium sp., F. oxysporum, M. phaseolina ve S. sclerotiorum hastalık etmenlerinin Türkiye'de yetişen bademlerde hastalıklara neden olduğu ilk kez bu çalışmayla bildirilmiştir.

Characterization and prevalence of disease agents of root rot and wilt disease on sweet almond trees grown in Diyarbakır province

Sweet almond (Prunus dulcis L.) is one of the most important nut fruit growing in South East Anatolia region of Turkey. It has been reported that almond causes significant losses in fungal disease factors of soil origin throughout the world. Root rot and wilt disease of almond may be caused by any single or a combination of several common soilborne fungal species. During the spring of 2017, almond orchards and nurseries located in Diyarbakır province were surveyed to evaluate the prevalence and incidence of the fungal disease agent(s) causing root-foot rot and wilt diseases on randomly selected sweet almond trees/seedlings. Several root and crown tissues were collected from suspecious almond trees/seedlings showing poor growth, yellowing, and wilting and death symptoms. All isolates were subjected to pathogenicity test and all were identified according to morphological and molecular methods. According to the results of fungal isolations from roots, crowns and stems collected from suspicious almond plants indicated that the most frequently encountered soil-borne fungal disease agent isolated and characterised in surveyed districts was Fusarium oxysporum (Fusarium wilt disease agent) with the 28.9% prevalence and 38.0% incidence which was followed by Macrophomina phaseolina (Charcoal rot disease agent) with the 24.6% prevalence and 21.5% incidence, Sclerotinia sclerotiorumum (white mold disease agent) with 19.3% prevalence and 11.3% incidence and Ceratobasidium sp. (Ceratobasidium root rot disease agent) with the 16.7% prevalence and 18.3% incidence. To the best of our knowledge, this is the first report of Ceratobasidium sp., F. oxysporum, M. phaseolina and S. sclerotiorum causing almond root rot and wilt diseases in Turkey.

___

  • Anonymous, 2018. FAOSTAT. http://www.fao.org/faostat/ en/#data/QC (Erişim tarihi 02.05.2019).
  • Akbar D.I., 2005. Study on decline of almond trees caused by soil-borne phytopathogenic fungi. FAO, AGRIS http://agris. fao.org/agris-search/search.do?recordID=IR2007000541 (Erişim tarihi: 02.05.2019).
  • Aktan Z.C., Soylu S., Ciftci O., Turkolmez, S., 2020. First report of root rot caused by Ceratobasidium sp. on sweet almond in Turkey. Journal of Plant Pathology, 102, 241–242
  • Aslantaş R., Güleryüz M., 1999. Almond selection in microclimate areas of Northeast Anatolia. XI. Grempa meeting on Pistacios and Almonds, University of Harran, Faculty of AgricUlture, Pistacio Research and Application Center (1-4 September 1999, Şanlıurfa), 91 p.
  • Baiswar P., Ngachan S.V., 2018. First report of root and collar rot of strawberry (Fragaria × ananassa) caused by Ceratobasidium sp. AG-B(o) (Binucleate Rhizoctonia) in India. Plant Disease, 102, 1035.
  • Baten M.D.A., Asano T., Motohashi K., Ishiguro Y., Rahman M.Z., Inaba S., Suga H., Kageyama K., 2014. Phylogenetic relationships among Phytopythium species and re-evaluation of Phytopythium fagopyri comb. nov., recovered from damped-off buckwheat seedlings in Japan. Mycological Progress, 13, 1145–1156.
  • Beck J.J., Higbee B.S., Merrill G.B., Roitman J.N., 2008a. Comparison of volatile emissions from undamaged and mechanically damaged almonds. Journal of the Science of Food and Agriculture, 88 (8), 1363-1368.
  • Beck J.J., Merrill G.B., Palumbo J.D., O Keeffe T.L. 2008b. Strain of Fusarium oxysporum isolated from almond hulls produces styrene and 7-methyl-1,3,5-cyclooctatriene as the principal volatile components. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 56 (23), 11392-11398.
  • Browne G.T., 2017. Resistance to Phytophthora species among rootstocks for cultivated Prunus species. HortScience, 52 (11), 1471-1476.
  • Camele I., Marcone C., Cristinzio G., 2005. Detection and identification of Phytophthora species in southern Italy by RFLP and sequence analysis of PCR-amplified nuclear ribosomal DNA. European Journal of Plant Pathology, 113, 1-14.
  • Çeliker N.M., Poyraz D., 2007. Muğla ili Datça ilçesinde badem ağaçlarında kurumaya neden olan fungal hastalıklar üzerinde çalışmalar. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri, Isparta, 274 s.
  • Çiftçi O., Türkölmez Ş., Derviş S., Serçe Ç.U., 2016. First report of canker and root rot of almond caused by Phytophthora plurivora in Turkey. Plant Disease, 100, 1507.
  • Gouk C., 2014. Almond diseases and disorders. In: XXIX International Horticultural Congress on Horticulture: sustaining lives, livelihoods and landscapes, (IHC2014), 1109 (pp. 249-254).
  • Holliday P., Punithalingam E., 1970. Macrophomina phaseolina. CMI Descriptions of Pathogenic Fungi and Bacteria, 275, 1-2.
  • Horst R.K., 2008. Host plants and their diseases. In:Westcott’s Plant Disease Handbook. Horst R.K., (Ed.). Springer, Netherlands, 699-1145 p.
  • Kurbetli I., Değirmenci K., 2010. First report of root and crown rot of almond caused by Phytophthora spp. in Turkey. Plant Disease, 94 (10), 1261-1261.
  • Kurbetli I., Değirmenci K., 2011. First report of Phytophthora taxon niederhauserii causing decline of almond in Turkey. New Disease Reports, 23, 14.
  • Kurbetli I., Yılmaz A., 2015. First report of Phytophthora megasperma causing crown and root rot of almond in Turkey. New Disease Reports, 32, 25.
  • Martin F.N., 2003. Development of alternative strategies for management of soilborne pathogens currently controlled with methyl bromide. Annual Review of Phytopathology, 41, 325-350.
  • Martins M., Sarmento D., Oliveira M.M., 2002. Search form molecular markers linked to Fusicoccum tolerance in almond. Proceedings of the 7th International Symposium on Plum and Prune Genetics, Breeding and Pomology, Plovdiv, Bulgaria, 20–24 August 2001, Acta–Horticulturae, No: 577, 87–90.
  • Meza-Moller A., Rentería-Martínez M.E., Guerra-Camacho M.A., Romo-Tamayo F., Ochoa-Meza A., Moreno-Salazar S.F., 2014. First report of root rot of watermelon caused by Ceratobasidium sp. in Sonora, Mexico. Plant Disease, 98 (6), 847.
  • Mordue J.E.M., Holliday P., 1976. Sclerotinia sclerotiorum. CMI Descriptions of Pathogenic Fungi and Bacteria, 513. Nelson P.E., Tousson T.A., Marasas W.F.O., 1983. Fusarium species: an illustrated manual for identification. The Pennsylvania State University Press, University Park, Pennsylvania, 193 pp.
  • O’Donnel K., 1993. Fusarium and its near relatives. In: The fungal holomorphs: mitotic and pleomorphic speciation in fungal systematics. Reynolds D.R, Taylor J.W., (Eds.). CAB International, Wallingford, 225-233.
  • Ogawa J.M., English H., 1991. Diseases of temperate zone tree fruit and nut crops. UCANR Publications, No. 3345. 461 p.
  • Saroj A., Kumar A., Saeed S.T., Samad A., Alam M., 2013. First report of Tagetes erecta damping off caused by Ceratobasidium sp. from India. Plant Disease, 97 (9), 1251.
  • Schroeder K.L., Paulitz T.C., 2012. First report of root rot caused by Rhizoctonia solani AG-10 on canola in Washington State. Plant Disease, 96 (4), 584.
  • Sneh B., Burpee L., Ogoshi A., 1991. Identification of Rhizoctonia Species. APS Press, St. Paul, 133 pp. TÜİK, 2018. Bitkisel üretim istatistikleri. http://biruni.tuik. gov.tr/bitkiselapp/bitkisel.zul (Erişim tarihi: 02.05.2019).
  • Türkölmez Ş., Derviş S., Çiftçi O., Ulubaş Serçe Ç., 2016. First report of Phytophthora chlamydospora causing root and crown rot on almond (Prunus dulcis) trees in Turkey. Plant Disease, 100 (8), 1796.
  • You J.M., Lin X.M., Guo J., Zhang M.D., Liao C.L., He M.J., Sun Y.L., 2013. First report of root rot on Atractylodes macrocephala (largehead atractylodes rhizome) caused by Ceratobasidium sp. in China. Plant Disease, 97 (1), 139.
  • Zhou H., Gao Q., Gong Q.F., Qiu S., He J.X., Huang J., He Y.Q., 2017. First report of stem and root rot of the medicinal herb Dendrobium officinale (Orchidaceae) caused by Ceratobasidium sp. AG-R in Guangxi, China. Plant Disease, 101 (9), 1679.
  • White T.J., Bruns T., Lee S., Taylor J.W., 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: PCR protocols: A guide to methods and applications. Innis M.A., Gelfand D.H., Sninsky J.J., White T.J. (Eds.). Academic Press, Inc., New York, 38, 315–322.
  • Wicks T.J., Lee T.C., Scott E.S., 1997. Phytophthora crown rot of almonds in Australia. Bulletin OEPP, 27, 501–506.
  • Cite this article: Aktan, Z. C., Soylu, S , Çiftçi, O , Türkölmez, Ş. (2020). Characterization and prevalence of disease agents of root rot and wilt disease on sweet almond trees grown in Diyarbakır province. Plant Protection Bulletin, 60-1. DOI: 10.16955/bitkorb.561427
  • Atıf için: Aktan, Z. C., Soylu, S , Çiftçi, O , Türkölmez, Ş. (2020). Diyarbakır ilinde yetişen badem ağaçlarında sorun olan kök çürüklüğü ve solgunluk hastalık etmenlerinin karakterizasyonu ve yaygınlığı. Bitki Koruma Bülteni, 60-1. DOI: 10.16955/bitkorb.561427
Bitki Koruma Bülteni-Cover
  • ISSN: 0406-3597
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1952
  • Yayıncı: Zirai Mücadele Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü
Sayıdaki Diğer Makaleler

Erzincan ili bağ alanlarında fitoplazma hastalıklarının ve olası vektör böcek türlerinin tespiti

Yılmaz KARABIÇAK, İsmail ALASERHAT, Şenol ALTUNDAĞ, İşıl ÖZDEMİR, Emine Demir ÖZDEN

Diyarbakır ilinde yetişen badem ağaçlarında sorun olan kök çürüklüğü ve solgunluk hastalık etmenlerinin karakterizasyonu ve yaygınlığı

Zekiye Ceren AKTAN, Soner SOYLU, Osman ÇİFTÇİ, Şahimerdan TÜRKÖLMEZ

Achillea millefolium L. (Asteraceae) uçucu yağının kimyasal bileşimi ve Sitophilus granarius (Coleoptera: Curculionidae) ve Rhyzopertha dominica (Coleoptera: Bostrichidae)’ya karşı insektisidal aktivitesi

Mustafa ALKAN

Çukurova bölgesi pamuk alanlarında Aphis gossypii (Glover)’da aşırı düzeyde sitokrom P450 genleri ekspresyonu

Selçuk ULUSOY

Bazı bitki fungal patojenlerinde dsRNA mikovirüslerinin varlığının taranması

Sahra HOSSEİNALİZADEH, Ömer ERİNCİK, Serap AÇIKGÖZ

Türkiye çim alanlarındaki ak üçgüllerdeki (Trifolium repens L.) fungusların belirlenmesi ve patojenisite çalışmaları

Filiz ÜNAL, Senem TÜLEK, Mesrur Ümit BİNGÖL, Ömer ÖZTÜRK, Yeşim EĞERCİ, İlker KURBETLİ, Sirel CANPOLAT, Kamil SARPKAYA, Abdullah ÜNLÜ, Fatma Sara DOLAR

Düzce ilinde karayaprak lahanasında (Brassica oleracea L. var. acephala) zararlı Aleyrodes proletella L. (Hemiptera: Aleyrodidae)’nın yayılışı, konukçuları ve doğal düşmanları

Abdurrahman Sami KOCA, Halil KÜTÜK

Doğu Akdeniz Bölgesinde badem ağaçlarında görülen bazı virüs hastalıklarının saptanması ve karakterizasyonu

Mahmut YEGÜL, Saadettin BALOĞLU

Ankara’da soğan (Allium cepa L.) ve pırasayı (Allium ampeloprasum L.) enfekte eden Pırasa sarı çizgi virüsü’nün (Leek yellow stripe potyvirus) serolojik ve moleküler olarak tanılanması

Adyatma İrawan SANTOSA, Filiz ERTUNÇ

Bazı havuç çeşitlerinin kök-ur nematodu türlerine (Meloidogyne spp. Goeldi, 1982) karşı reaksiyonu

Emre EVLİCE, Fatma Dolunay ERDOĞUŞ, Gökhan YATKIN