Bazı bitki fungal patojenlerinde dsRNA mikovirüslerinin varlığının taranması

Mikovirüsler birçok fungal hastalık etmenini enfekte edebilir ve bunların bazıları hipovirülensliğe neden olabilmektedir. Bu mikovirüsler bitkilerin biyolojik mücadelesinde yaygın olarak kullanılmaktadırlar. Mikovirüslerin kullanılması ile gerçekleştirilen biyolojik mücadeleye en başarılı örnek, Kestane kanseri hastalığıdır. Bu çalışmada, asmadan elde edilen Phomopsis viticola, pamuktan ve zeytinden Verticillium dahliae, pamuktan Rhizoctonia solani ve kirazdan Leucostoma spp., izolatlarındaki mikovirüslerin varlığı dsRNA metodu ile araştırılmıştır. dsRNA ekstraksiyonu yapılmış ve agaroz jel elektroforez yöntemi ile analiz edilmiştir. Asmada 80 P. viticola izolatının 8’inde, zeytinde 50 V. dahlia izolatının 1’inde, pamukta 50 V. dahliae izolatının 3’ünde, pamukta 50 R. solani izolatının 6’sında ve kirazda 50 Leucostoma spp. izolatının 3’ünde dsRNA bantları elde edilmiştir. Elde edilen dsRNA bantlarının tahmini moleküler ağırlıkları 12-20 kb arasında bulunmuştur.

Screening of some plant pathogenic fungi for the presence of dsRNA mycoviruses

Mycoviruses can infect many fungi and some may cause hypovirulence, which is a common phenomenon used in the biological control of certain fungal diseases of the plants. The most successful example regarding the use of mycoviruses and hypovirulent strains in biological control is the chestnut blight. In this study, the isolates of fungi, namely Phomopsis viticola from grapevine, Verticillium dahliae from cotton and olive, Rhizoctonia solani from cotton and Leucostoma spp., from cherry were screened for the presence of dsRNA mycoviruses. Isolation of dsRNAs was performed and dsRNA bands were analyzed by agarose gel electrophoresis. Putative dsRNA bands were detected in eight of 80 P. viticola isolates from grapevine, one of 50 V. dahliae isolates from olive, three of 50 V. dahliae isolates from cotton, six of 50 R. solani isolates from cotton and three of 50 Leucostoma spp., isolates from cherry. The estimated molecular sizes of the dsRNAs ranged from approximately 12.0 to 20.0 kb.

___

  • Abbas A., 2016. A review paper on mycoviruses. Journal of Plant Pathology and Microbiology, 7-12.
  • Balijja A., Kvarnheden A., Turchetti T., 2008. A non-phenol– chloroform extraction of double-stranded RNA from plant and fungal tissues. Journal of Virological Methods, 152, 32–37.
  • Bharathan N., Saso H., Gudipati L., Bharathan S., Whited K., 2005. Double-stranded RNA: distribution and analysis among isolates of Rhizoctonia solani AG-2 to -1. Plant Pathology, 54, 196–203.
  • Bharathan N., Tavantzis S.M., 1990. Genetic diversity of double-stranded RNA from Rhizoctonia solani. Phytopathology, 80, 631-635.
  • Bharathan N., Tavantzis S.M., 1991. Assessment of genetic relatedness among doublestranded RNAs from isolates of Rhizoctonia solani from diverse geographic origins. Phytopathology, 81, 411-415.
  • Canizares E., Perez-Artes M., García-Pedrajas N., GarciaPedrajas M., 2015. Characterization of a new partitivirus strain in Verticillium dahliae provides further evidence of the spread of the highly virulent defoliating pathotype through new introductions. Phytopathologia Mediterranea, 54 (3), 516−523.
  • Cao Y., Zhu Xw., Xiang Y., Li D.Q., Yang J.R., Mao Q.Z., Chen J.S., 2011. Genomic characterization of a novel dsRNA virus detected in the phytopathogenic fungus Verticillium dahliae’ Kleb. Virus Research, 159, 73–78.
  • Das S., Falloon R.E., Stewart A., Pitman A.R., 2014. Molecular characterisation of an endornavirus from Rhizoctonia solani AG-3PT infecting potato. Fungal Biology, 118, 924–934.
  • Feng Z., Zhu H., Li Z., Shi Y., Zhao L., Liu L., Jiang D., 2013. Complete genome sequence of a novel dsRNA mycovirus isolated from the phytopathogenic fungus Verticillium dahliae Kleb. Archives of Virology, 158, 2621–2623.
  • Hyakumachi M., Sumino A., Veda I., Shikata E., 1985. Relationship between the presence of dsRNA in Rhizoctonia solani and pathogenicity. Annals of the Phytopathological Society of Japan, 51, 372–3.
  • Jensen C.J.P., Adams G.C., 1995. Nitrogen metabolism of Leucostoma persoonii and L.cincta in virulent and hypovirulent isolates. Mycologia, 87 (6), 864-875.
  • Jiang D., Fu Y., Ghabrial S.A., 2013. Mycoviruses: Chapter eight—viruses of the plant pathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum. Advances in Virus Research, 86, 215–248.
  • Koloniuk I., El-Habbak M.H., Petrzik K., Ghabrial S.A., 2014. Complete genome sequence of a novel hypovirus infecting Phomopsis longicolla. Archives of Virology, 159, 1861–1863.
  • Kousik C.S., Snow J.P., Valrerde R.P., 1993. Comparison of double stranded RNA componts and virulence among isolates of Rhizoctonia solani AG_1 IA and AG_1 IB. Phytopathology, 84, 44-49.
  • Preisig O., Moleleki N., Smit W.A., Wingfield B.D., Wingfield M.J., 2000. A novel RNA mycovirus in a hypovirulent isolate of the plant pathogen Diaporthe ambigua. Journal of General Virology, 81, 3107–3114.
  • Son M., Yu J., Kim K., 2015. Five questions about mycoviruses. PLOS Pathogens, DOI:10.1371/journal.ppat.1005172
  • Tonguslu M., Acıkgoz S., 2015. Investigation of virulence and presence of mikoviral dsRNA on Leucostoma spp. isolates of the cherry production areas in the Aegean Region/ Turkey. International ScientificAgriculture Symposium “Agrosym 2015” Jahorina, 15-18 October 2015, Bosnia and Herzegovina.
  • Van Regenmortel M.H., Fauquet C.M., Bishop D.H.L., Carstens E.B., Estes M.K., Lemon S.M., Aniloff J., Mayo M.A., Mcgeoch D.J., Pringle C.R., Wickner R.B., 2000.
  • Virus taxonomy, classification and nomenclature of viruses. Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Academic Press, San Diego, USA, 1162 pp.
  • Xie J., Jiang D., 2014. New insights into mycoviruses and exploration for the biological control of crop fungal diseases. Annual Review of Phytopathology, 52, 45–68.
  • Zanzinger D.H., Bandy B.P., Tavantzis S.M., 1984. High frequency of finding double-stranded RNA in naturally occurring isolates of Rhizoctonia solani. Journal of General Virology, 65, 1601-1605.
  • Zhang R.J., Zhong J., Shang H.H., Pan X.T., Zhu H.J., Gao B.D., 2015. The complete nucleotide sequence and genomic organization of a novel victorivirus with two non-overlapping ORFs, identified in the plant-pathogenic fungus Phomopsis vexans. Archives of Virology 160, 1805–1809
Bitki Koruma Bülteni-Cover
  • ISSN: 0406-3597
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1952
  • Yayıncı: Zirai Mücadele Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü
Sayıdaki Diğer Makaleler

Achillea millefolium L. (Asteraceae) uçucu yağının kimyasal bileşimi ve Sitophilus granarius (Coleoptera: Curculionidae) ve Rhyzopertha dominica (Coleoptera: Bostrichidae)’ya karşı insektisidal aktivitesi

Mustafa ALKAN

Doğu Akdeniz Bölgesinde badem ağaçlarında görülen bazı virüs hastalıklarının saptanması ve karakterizasyonu

Mahmut YEGÜL, Saadettin BALOĞLU

Bazı havuç çeşitlerinin kök-ur nematodu türlerine (Meloidogyne spp. Goeldi, 1982) karşı reaksiyonu

Emre EVLİCE, Fatma Dolunay ERDOĞUŞ, Gökhan YATKIN

Erzincan ili bağ alanlarında fitoplazma hastalıklarının ve olası vektör böcek türlerinin tespiti

Yılmaz KARABIÇAK, İsmail ALASERHAT, Şenol ALTUNDAĞ, İşıl ÖZDEMİR, Emine Demir ÖZDEN

Ankara’da soğan (Allium cepa L.) ve pırasayı (Allium ampeloprasum L.) enfekte eden Pırasa sarı çizgi virüsü’nün (Leek yellow stripe potyvirus) serolojik ve moleküler olarak tanılanması

Adyatma İrawan SANTOSA, Filiz ERTUNÇ

Diyarbakır ilinde yetişen badem ağaçlarında sorun olan kök çürüklüğü ve solgunluk hastalık etmenlerinin karakterizasyonu ve yaygınlığı

Zekiye Ceren AKTAN, Soner SOYLU, Osman ÇİFTÇİ, Şahimerdan TÜRKÖLMEZ

Adana ekolojik koşullarında Phyllocoptruta oleivora (Ashmead) (Acari: Phyllocoptidae)’nın popülasyon gelişmesi

Serdar SATAR, Gülsevim TİRİNG, Dindar İŞPINAR, Miraç YAYLA

Düzce ilinde karayaprak lahanasında (Brassica oleracea L. var. acephala) zararlı Aleyrodes proletella L. (Hemiptera: Aleyrodidae)’nın yayılışı, konukçuları ve doğal düşmanları

Abdurrahman Sami KOCA, Halil KÜTÜK

Çukurova bölgesi pamuk alanlarında Aphis gossypii (Glover)’da aşırı düzeyde sitokrom P450 genleri ekspresyonu

Selçuk ULUSOY

Türkiye çim alanlarındaki ak üçgüllerdeki (Trifolium repens L.) fungusların belirlenmesi ve patojenisite çalışmaları

Filiz ÜNAL, Senem TÜLEK, Mesrur Ümit BİNGÖL, Ömer ÖZTÜRK, Yeşim EĞERCİ, İlker KURBETLİ, Sirel CANPOLAT, Kamil SARPKAYA, Abdullah ÜNLÜ, Fatma Sara DOLAR